COsegregação de VARiants no Painel de Genes (COVAR)
Estudo da cossegregação familiar de VARiants de nucleotídeos no painel de genes para validar seu uso no aconselhamento genético
Visão geral do estudo
Status
Intervenção / Tratamento
Descrição detalhada
Originalmente, o estudo COVAR foi projetado para explorar variantes de significado biológico desconhecido (VUS) nos genes BRCA1 (BReast Cancer 1) e BRCA2 (BReast Cancer 2), que são os dois principais genes identificados em cânceres hereditários de mama e/ou ovário. Desde então o estudo evoluiu, em paralelo com a evolução do diagnóstico, introduzindo primeiro o gene PALB2 (Parceiro e localizador de BRCA2) explorado no diagnóstico desde 2015 e agora abrindo o estudo a todos os genes dos painéis realizados no diagnóstico em famílias com uma síndrome de predisposição genética para cânceres.
O UMD (Universal Mutation Database)-BRCA1/2 francês, credenciado pelo French National Cancer Institute, coleta resultados anônimos de testes genéticos realizados por laboratórios franceses autorizados desde 1995, dando uma visão em tempo real de famílias portadoras do mesmo VUS. Em setembro de 2011, o banco de dados francês UMD-BRCA1/2 compreendia 706 variantes diferentes em 1.300 famílias BRCA1 e 1.089 variantes diferentes em 2.101 famílias BRCA2. Em abril de 2021, esse banco de dados continha 1.651 VSU diferentes para BRCA1, 3.015 VUS diferentes para BRCA2, 471 VUS diferentes para PALB2, 68 para RAD51C e 66 para RAD51D.
Desde 2017, novos genes foram explorados no cenário de diagnóstico, pois foram relatados como fatores predisponentes para cânceres. Essa lista está em constante evolução (Moretta et al., 2018; Dhooge et al., 2020). A coleta de dados para esses genes está em andamento e um novo banco de dados (FrOG) reunindo todos os VUS e mutações identificadas na rede oncogenética francesa foi criado. Fizemos um contrato de consórcio no final de 2020. Este banco de dados reúne até o momento 12 genes e 11.912 variantes diferentes em mais de 40.000 famílias francesas.
Um dos principais parâmetros mensuráveis para a classificação de VUS como mutações causais é a sua co-segregação com a doença. O tamanho médio das famílias francesas é relativamente pequeno, a informação de co-segregação variante limitada a uma família não seria significativa. No entanto, a compilação dos resultados da co-segregação obtidos de várias famílias permitirá obter estimativas mais precisas e completas da probabilidade de causalidade de uma determinada variante.
O objetivo do estudo COVAR (COsegregation VARiants) é organizar estudos de cossegregação das VUS da base de dados UMD-BRCA1/2, de forma a determinar a natureza causal ou não causal destas variantes. Para organizar as variantes por sua relevância clínica, foi utilizada uma grade com 5 classes: 1=neutra, 2=provavelmente neutra, 3=VUS, 4=provavelmente causal, 5=causal. Os VUS das classes 3 e 4 serão candidatos a estudos de co-segregação, pois não podem ser utilizados para o aconselhamento genético.
Nas famílias selecionadas, o caso índice convidará os membros da família (afetados e não afetados) a fornecer uma amostra de fluido salivar para testar a presença do UV. A probabilidade de que um VUS seja causal será calculada a partir dos dados de cossegregação usando um modelo bayesiano. Os resultados serão integrados no modelo multifatorial descrito por D. Goldgar, modelo que integra diferentes parâmetros como conservação de aminoácidos, impacto estrutural da variante, co-ocorrência com uma mutação patogênica, história familiar e características do tumor.
Tipo de estudo
Inscrição (Estimado)
Estágio
- Não aplicável
Contactos e Locais
Contato de estudo
- Nome: Sandrine CAPUTO, PhD
- Número de telefone: 33172389367
- E-mail: sandrine.caputo@curie.fr
Estude backup de contato
- Nome: Isabelle TURBIEZ, Project Manager
- Número de telefone: 33147111659
- E-mail: isabelle.turbiez@curie.fr
Locais de estudo
-
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-
Amiens, França, 80054
- Recrutamento
- CHU Amiens - Hopital Nord
-
Contato:
- Gilles MORIN, MD
-
Investigador principal:
- Gilles MORIN, MD
-
Angers, França, 49933
- Recrutamento
- ICO - Centre Paul Papin
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Contato:
- Marie COUDERT, MD
-
Investigador principal:
- Marie COUDERT, MD
-
Angoulême, França, 16959
- Recrutamento
- Centre Hospitalier d'Angoulème
-
Contato:
- Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
-
Investigador principal:
- Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
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Avignon, França, 84918
- Recrutamento
- Institut Sainte-Catherine
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Contato:
- Hélène DREYFUS, MD
-
Investigador principal:
- Hélène DREYFUS, MD
-
Besancon, França, 25030
- Recrutamento
- CHU Besançon
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Contato:
- Marie-Agnès COLLONGE-RAME, MD
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Investigador principal:
- Marie-Agnès COLLONGE-RAME, MD
-
Bordeaux, França, 33076
- Recrutamento
- Institut Bergonie
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Contato:
- Virginie BUBIEN, MD
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Investigador principal:
- Virginie BUBIEN, MD
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Bordeaux, França, 33076
- Recrutamento
- Groupe Hospitalier Pellegrin
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Contato:
- Julie TINAT, MD
-
Investigador principal:
- Julie TINAT, MD
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Bourges, França, 18020
- Recrutamento
- Centre Hospitalier Jacques Coeur
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Investigador principal:
- Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
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Contato:
- Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
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Brest, França, 29200
- Recrutamento
- CHU Morvan de Brest
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Contato:
- Marc PLANES, MD
-
Investigador principal:
- Marc PLANES, MD
-
Caen, França, 14076
- Recrutamento
- Centre Francois Baclesse
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Contato:
- Pascaline BERTHET, MD
-
Investigador principal:
- Pascaline BERTHET, MD
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Chambery, França, 73011
- Recrutamento
- Centre Hospitalier Hôtel Dieu
-
Contato:
- Sandra FERRER, MD
-
Investigador principal:
- Sandra FERRER, MD
-
Clermont-Ferrand, França, 63011
- Recrutamento
- Centre Jean Perrin
-
Contato:
- Mathilde GAY-BELLILE, MD
-
Investigador principal:
- Mathilde GAY-BELLILE, MD
-
Colmar, França, 68024
- Ainda não está recrutando
- Hôpital Civil de Colmar
-
Contato:
- Jean-Marc LIMACHER
-
Investigador principal:
- Jean-Marc LIMACHER, MD
-
Dijon, França, 21079
- Recrutamento
- CHU de Dijon
-
Contato:
- Laurence FAIVRE-OLIVIER, MD
-
Investigador principal:
- Laurence FAIVRE-OLIVIER, MD
-
Grenoble, França, 38043
- Recrutamento
- CHU de Grenoble
-
Contato:
- Clémentine LEGRAND, MD
-
Investigador principal:
- Clémentine LEGRAND, MD
-
La Rochelle, França, 17019
- Recrutamento
- Groupe Hospitalier La Rochelle-Ré-Aunis
-
Contato:
- Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
-
Investigador principal:
- Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
-
Le Havre, França, 76083
- Recrutamento
- Hôpital Flaubert
-
Contato:
- Elodie LACAZE, MD
-
Investigador principal:
- Elodie LACAZE, MD
-
Lille, França, 59000
- Recrutamento
- Centre OSCAR LAMBRET
-
Contato:
- Audrey MAILLIEZ, MD
-
Investigador principal:
- Audrey MAILLIEZ, MD
-
Lille, França, 59037
- Recrutamento
- CHRU Lille
-
Contato:
- Sophie LEJEUNE, MD
-
Investigador principal:
- Sophie LEJEUNE, MD
-
Limoges, França, 87042
- Recrutamento
- Chu Dupuytren
-
Contato:
- Laurence Venat-Bouvet, MD
-
Investigador principal:
- Laurence VENAT-BOUVET, MD
-
Lyon, França, 69373
- Recrutamento
- Centre LEON BERARD
-
Contato:
- Christine LASSET, MD
-
Investigador principal:
- Christine LASSET, MD
-
Lyon, França, 69229
- Recrutamento
- Hospices Civils de Lyon
-
Contato:
- Sophie GIRAUD, MD
-
Investigador principal:
- Sophie GIRAUD, MD
-
Marseille, França, 13009
- Recrutamento
- Institut Paoli Calmettes
-
Contato:
- Hagay SOBOL, PhD
-
Investigador principal:
- Hagay SOBOL, PhD
-
Marseille, França, 13385
- Recrutamento
- CHU La Timone
-
Contato:
- Hélène ZATTARA, MD
-
Investigador principal:
- Hélène ZATTARA, MD
-
Montpellier, França, 34295
- Recrutamento
- CHU Arnaud de Villeneuve
-
Contato:
- Isabelle COUPIER, MD
-
Investigador principal:
- Isabelle COUPIER, MD
-
Nantes, França, 44202
- Recrutamento
- Centre Catherine de Sienne
-
Investigador principal:
- Alain Lortholary, MD
-
Contato:
- Alain LORTHOLARY, MD
-
Nice, França, 06189
- Recrutamento
- Centre Antoine Lacassagne
-
Contato:
- Véronique MARI, MD
-
Investigador principal:
- Véronique MARI, MD
-
Niort, França, 79021
- Recrutamento
- Centre Hospitalier Georges Renon
-
Contato:
- Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
-
Investigador principal:
- Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
-
Nîmes, França, 30029
- Recrutamento
- CHRU Caremeau
-
Contato:
- Jean CHIESA, MD
-
Investigador principal:
- Jean CHIESA, MD
-
Orléans, França, 45067
- Recrutamento
- Hôpital de la Source
-
Contato:
- E COTTEREAU, MD
-
Investigador principal:
- E COTTEREAU, MD
-
Paris, França, 75012
- Recrutamento
- Hopital Saint-Antoine
-
Contato:
- Antoine DARDENNE, MD
-
Investigador principal:
- Antoine DARDENNE, MD
-
Paris, França, 75475
- Recrutamento
- Hôpital Saint-Louis
-
Contato:
- Odile COHEN-HAGUENAUER, MD
-
Investigador principal:
- Odile COHEN-HAGUENAUER, MD
-
Paris, França, 75013
- Recrutamento
- Groupe Hospitalier Pitie-Salpetriere
-
Contato:
- Véronica CUSIN, MD
-
Investigador principal:
- Véronica CUSIN, MD
-
Paris, França, 75020
- Recrutamento
- Hopital Tenon
-
Contato:
- Clémence EVREVIN, MD
-
Investigador principal:
- Clémence EVREVIN, MD
-
Paris, França, 75908
- Recrutamento
- HEGP
-
Contato:
- Pierre-Laurent PUIG, Phd
-
Investigador principal:
- Pierre-Laurent PUIG, Phd
-
Poitiers, França, 86021
- Recrutamento
- CHU La Milétrie
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Contato:
- Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
-
Investigador principal:
- Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
-
Reims, França, 51092
- Recrutamento
- CHU de Reims
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Contato:
- Anne DURLACH, MD
-
Investigador principal:
- Anne DURLACH, MD
-
Reims, França, 51100
- Recrutamento
- Institut Jean Godinot
-
Contato:
- Tan Dat NGUYEN, PHD
-
Investigador principal:
- Tan Dat NGUYEN, PHD
-
Reims, França, 51100
- Recrutamento
- ICC Courlancy
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Contato:
- Fanny BRAYOTEL, MD
-
Investigador principal:
- Fanny BRAYOTEL, MD
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Rennes, França, 35042
- Recrutamento
- Centre Eugene Marquis
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Contato:
- Louise CRIVELLI, MD
-
Investigador principal:
- Louise CRIVELLI, MD
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Rouen, França, 76031
- Recrutamento
- CHU de Rouen
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Contato:
- Isabelle TENNEVET, MD
-
Investigador principal:
- Isabelle TENNEVET, MD
-
Saint-Herblain, França, 44804
- Recrutamento
- ICO - Centre René Gauducheau
-
Contato:
- Capucine DELNATTE, MD
-
Investigador principal:
- Capucine DELNATTE, MD
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Saint-Étienne, França, 42055
- Recrutamento
- CHU Saint Etienne
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Contato:
- Fabienne PRIEUR, MD
-
Investigador principal:
- Fabienne PRIEUR, MD
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Strasbourg, França, 67033
- Recrutamento
- Institut de Cancerologie Strasbourg Europe ICANS
-
Contato:
- Philippe BOUDIER, MD
-
Investigador principal:
- Philippe BOUDIER, MD
-
Strasbourg, França, 67200
- Recrutamento
- Hopital de Hautepierre - Hôpital Universitaire
-
Contato:
- Christine MAUGARD, MD
-
Investigador principal:
- Christine MAUGARD, MD
-
Toulouse, França, 31059
- Recrutamento
- Institut Claudius Regaud - IUCT - Oncopole
-
Investigador principal:
- Laurence GLADIEFF, MD
-
Contato:
- Laurence GLADIEFF, MD
-
Tours, França, 37044
- Recrutamento
- CHU Bretonneau
-
Investigador principal:
- Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
-
Contato:
- Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
-
Troyes, França, 10003
- Recrutamento
- CH Simone VEIL
-
Contato:
- Charlotte CAILLE-BENIGNI, MD
-
Investigador principal:
- Charlotte CAILLE-BENIGNI, MD
-
Valence, França, 26953
- Recrutamento
- Centre Hospitalier de Valence
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Contato:
- Marie-Noëlle BONNET-DUPEYRON, MD
-
Investigador principal:
- Marie-Noëlle BONNET-DUPEYRON, MD
-
Vandoeuvre les Nancy, França, 54511
- Recrutamento
- CHU Nancy - Hôpital Brabois
-
Contato:
- Jean-Marie RAVEL, MD
-
Investigador principal:
- Jean-Marie RAVEL, MD
-
Vandoeuvre les Nancy, França, 54511
- Retirado
- Centre Alexis Vautrin
-
Villejuif, França, 94805
- Recrutamento
- Gustave Roussy
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Contato:
- Olivier CARON, MD
-
Investigador principal:
- Olivier CARON, MD
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-
Haut De Seine
-
Saint-Cloud, Haut De Seine, França, 92210
- Recrutamento
- Institut Curie - Hôpital René Huguenin
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Contato:
- Emmanuelle FOURME, PhD
- E-mail: emmanuelle.fourme@curie.fr
-
Investigador principal:
- Emmanuelle FOURME, MD
-
-
Ile De France
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Paris, Ile De France, França, 75005
- Recrutamento
- Institut Curie
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Contato:
- Sandrine CAPUTO, PhD
- E-mail: sandrine.caputo@curie.fr
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Investigador principal:
- Dominique STOPPA-LYONNET, PU-PH
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-
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Pointe à Pitre, Guadalupe, 97110
- Recrutamento
- CHU de Pointe à Pitre
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Contato:
- Marilyn LACKMY-PORT-LIS, MD
-
Investigador principal:
- Marilyn LACKMY-PORT-LIS, MD
-
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-
-
-
Fort de France, Martinica, 97261
- Recrutamento
- CHU de Fort de France
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Contato:
- Odile BERA, MD
-
Investigador principal:
- Odile BERA, MD
-
-
-
-
-
Saint-Pierre, Reunião, 97410
- Recrutamento
- CHU Sud Réunion Saint-Pierre
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Contato:
- Hanitra RANJATOELINA, MD
-
Investigador principal:
- Hanitra RANJATOELINA, MD
-
-
Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
Aceita Voluntários Saudáveis
Descrição
Critério de inclusão:
Casos de índice:
- Uma pessoa portadora de um gene variante classe 3 ou 4, presente e selecionado nas famílias do banco de dados nacional de grupo genético e câncer (GGC Unicancer) que identifica as variações de todos os genes do painel de genes de todos os laboratórios franceses.
- Idade ≥ 18 anos.
- Consentimento informado por escrito assinado "caso índice"
Partes envolvidas:
- Qualquer parente de um caso índice com câncer
- Qualquer parente sem câncer relacionado a um caso índice, retido pelos investigadores, com base na estrutura familiar e grau de parentesco em comparação com o caso índice
- Idade ≥ 18 anos
- Informação e assinatura do consentimento informado "parentes seleccionados"
Critério de exclusão:
- menores
- Pessoas privadas de liberdade ou sob tutela (incluindo curadores).
- Ausência de consentimento informado por escrito assinado
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
- Finalidade Principal: Diagnóstico
- Alocação: N / D
- Modelo Intervencional: Atribuição de grupo único
- Mascaramento: Nenhum (rótulo aberto)
Armas e Intervenções
Grupo de Participantes / Braço |
Intervenção / Tratamento |
|---|---|
|
Outro: Covar
|
As amostras de saliva serão feitas de parentes selecionados (DNA).
|
O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Prazo |
|---|---|
|
Realize a análise de co-segregação do VUS selecionado nas famílias para classificar o máximo de variantes em termos de probabilidade de serem patogênicas
Prazo: até 15 anos
|
até 15 anos
|
Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Prazo |
|---|---|
|
• Propor um método padronizado de classificação de UV que possa ser integrado à classificação já existente estabelecida na base de dados UMD-BRCA1/2, com foco principal nas variantes de classe 4 (provavelmente causal) e classe 3 (significância desconhecida).
Prazo: até 15 anos
|
até 15 anos
|
|
• Maximizar o número de VUS (tanto patogênicos quanto neutros) com recomendações associadas para manejo clínico de parentes em risco que podem ser usadas para orientar o aconselhamento genético.
Prazo: até 15 anos
|
até 15 anos
|
|
Avalie a penetrância de vários VUS de classe 3 e 4 provavelmente associados a risco moderado de câncer, usando dados de fenótipo/genótipo coletados em pedigrees estendidos.
Prazo: até 15 anos
|
até 15 anos
|
Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Investigadores
- Cadeira de estudo: Dominique STOPPA-LYONNET, PU-PH, Institut Curie
- Diretor de estudo: Sandrine CAPUTO, PhD, Institut Curie
Publicações e links úteis
Links úteis
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Conclusão Primária (Estimado)
Conclusão do estudo (Estimado)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Estimado)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- IC 2011-11
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