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유전자 패널에서 VARiants의 CO분리 (COVAR)

2024년 1월 16일 업데이트: Institut Curie

유전자 상담에서의 사용을 검증하기 위한 유전자 패널에서 뉴클레오티드 변이체의 가족 공동분리 연구

COVAR 프로젝트의 목표는 프랑스 데이터베이스의 최대 VUS를 안정적으로 분류하여 유전 상담에 사용하는 것입니다. 본 연구를 통해 얻은 결과는 경우에 따라 예방적 수술을 제안하는 환자 및 그 가족의 임상 관리에 큰 영향을 미칠 것입니다.

연구 개요

상세 설명

원래 COVAR 연구는 유전성 유방암 및/또는 난소암에서 확인된 두 가지 주요 유전자인 BRCA1(BReast Cancer 1) 및 BRCA2(BReast Cancer 2) 유전자에서 알려지지 않은 생물학적 중요성(VUS)의 변이체를 탐색하기 위해 설계되었습니다. 그 이후로 이 연구는 진단의 진화와 병행하여 2015년부터 진단에서 탐색된 PALB2(BRCA2의 파트너 및 로컬라이저) 유전자를 처음 도입했으며 현재는 가족에서 진단에서 수행된 패널의 모든 유전자에 대한 연구를 공개하고 있습니다. 암에 대한 유전적 소인 증후군.

프랑스 국립 암 연구소의 인증을 받은 French UMD(Universal Mutation Database)-BRCA1/2는 1995년부터 인증된 프랑스 연구소에서 수행한 유전자 검사의 익명 결과를 수집하여 동일한 VUS를 보유한 가족의 실시간 비전을 제공합니다. 2011년 9월, 프랑스 UMD-BRCA1/2 데이터베이스는 1,300개 BRCA1 계열의 706개 변종과 2,101개 BRCA2 계열의 1,089개 변종으로 구성되었습니다. 2021년 4월 이 데이터베이스에는 BRCA1용 1,651개의 서로 다른 VSU, BRCA2용 3,015개의 서로 다른 VUS, PALB2용 471개의 서로 다른 VUS, RAD51C용 68개, RAD51D용 66개가 포함되어 있습니다.

2017년부터 암에 대한 소인 인자로 보고된 새로운 유전자가 진단 환경에서 탐색되었습니다. 이 목록은 지속적으로 진화하고 있습니다(Moretta et al., 2018; Dhooge et al., 2020). 이러한 유전자에 대한 데이터 수집이 진행 중이며 French oncogenetic 네트워크에서 확인된 모든 VUS 및 돌연변이를 수집하는 새로운 데이터베이스(FrOG)가 설정되었습니다. 2020년 말에 컨소시엄 계약을 체결했습니다. 이 데이터베이스는 현재까지 40,000개 이상의 프랑스 가족에서 12개의 유전자와 11,912개의 다른 변이체를 수집합니다.

VUS를 원인 돌연변이로 분류하기 위한 주요 측정 가능한 매개변수 중 하나는 질병과의 공동 분리입니다. 프랑스 가족의 평균 규모는 상대적으로 작기 때문에 한 가족으로 제한되는 변형 공동 분리 정보는 중요하지 않습니다. 그러나 여러 가족에서 얻은 공동 분리 결과를 편집하면 주어진 변종의 인과 관계 확률을 보다 정확하고 완전하게 추정할 수 있습니다.

COVAR 연구(COsegregation VARiants)의 목적은 데이터베이스 UMD-BRCA1/2의 VUS에 대한 공동 분리 연구를 조직하여 이러한 변형의 인과적 또는 비인과적 특성을 결정하는 것입니다. 임상 관련성에 따라 변형을 구성하기 위해 5개 등급의 그리드가 사용되었습니다. 클래스 3과 4의 VUS는 유전 상담에 사용할 수 없기 때문에 공동 분리 연구의 후보가 됩니다.

선택된 가족에서 지표 사례는 VUS의 존재를 테스트하기 위해 타액 샘플을 제공하기 위해 가족 구성원(영향을 받는 것과 영향을 받지 않는)을 초대합니다. VUS가 원인일 확률은 베이지안 모델을 사용하여 공동 분리 데이터에서 계산됩니다. 결과는 아미노산 보존, 변이체의 구조적 영향, 병원성 돌연변이와의 동시 발생, 가족력 및 종양 특성과 같은 다양한 매개변수를 통합하는 모델인 D. Goldgar가 설명한 다인자 모델에 통합될 것입니다.

연구 유형

중재적

등록 (추정된)

3500

단계

  • 해당 없음

연락처 및 위치

이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.

연구 연락처

연구 연락처 백업

연구 장소

      • Pointe à Pitre, 과들루프, 97110
        • 모병
        • CHU de Pointe à Pitre
        • 연락하다:
          • Marilyn LACKMY-PORT-LIS, MD
        • 수석 연구원:
          • Marilyn LACKMY-PORT-LIS, MD
      • Fort de France, 마르티니크, 97261
        • 모병
        • CHU de Fort de France
        • 연락하다:
          • Odile BERA, MD
        • 수석 연구원:
          • Odile BERA, MD
      • Saint-Pierre, 재결합, 97410
        • 모병
        • CHU Sud Réunion Saint-Pierre
        • 연락하다:
          • Hanitra RANJATOELINA, MD
        • 수석 연구원:
          • Hanitra RANJATOELINA, MD
      • Amiens, 프랑스, 80054
        • 모병
        • CHU Amiens - Hopital Nord
        • 연락하다:
          • Gilles MORIN, MD
        • 수석 연구원:
          • Gilles MORIN, MD
      • Angers, 프랑스, 49933
        • 모병
        • ICO - Centre Paul Papin
        • 연락하다:
          • Marie COUDERT, MD
        • 수석 연구원:
          • Marie COUDERT, MD
      • Angoulême, 프랑스, 16959
        • 모병
        • Centre Hospitalier d'Angoulème
        • 연락하다:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • 수석 연구원:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Avignon, 프랑스, 84918
        • 모병
        • Institut Sainte-Catherine
        • 연락하다:
          • Hélène DREYFUS, MD
        • 수석 연구원:
          • Hélène DREYFUS, MD
      • Besancon, 프랑스, 25030
        • 모병
        • CHU Besançon
        • 연락하다:
          • Marie-Agnès COLLONGE-RAME, MD
        • 수석 연구원:
          • Marie-Agnès COLLONGE-RAME, MD
      • Bordeaux, 프랑스, 33076
        • 모병
        • Institut Bergonie
        • 연락하다:
          • Virginie BUBIEN, MD
        • 수석 연구원:
          • Virginie BUBIEN, MD
      • Bordeaux, 프랑스, 33076
        • 모병
        • Groupe Hospitalier Pellegrin
        • 연락하다:
          • Julie TINAT, MD
        • 수석 연구원:
          • Julie TINAT, MD
      • Bourges, 프랑스, 18020
        • 모병
        • Centre Hospitalier Jacques Coeur
        • 수석 연구원:
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
        • 연락하다:
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
      • Brest, 프랑스, 29200
        • 모병
        • CHU Morvan de Brest
        • 연락하다:
          • Marc PLANES, MD
        • 수석 연구원:
          • Marc PLANES, MD
      • Caen, 프랑스, 14076
        • 모병
        • Centre Francois Baclesse
        • 연락하다:
          • Pascaline BERTHET, MD
        • 수석 연구원:
          • Pascaline BERTHET, MD
      • Chambery, 프랑스, 73011
        • 모병
        • Centre Hospitalier Hôtel Dieu
        • 연락하다:
          • Sandra FERRER, MD
        • 수석 연구원:
          • Sandra FERRER, MD
      • Clermont-Ferrand, 프랑스, 63011
        • 모병
        • Centre Jean Perrin
        • 연락하다:
          • Mathilde GAY-BELLILE, MD
        • 수석 연구원:
          • Mathilde GAY-BELLILE, MD
      • Colmar, 프랑스, 68024
        • 아직 모집하지 않음
        • Hôpital Civil de Colmar
        • 연락하다:
          • Jean-Marc LIMACHER
        • 수석 연구원:
          • Jean-Marc LIMACHER, MD
      • Dijon, 프랑스, 21079
        • 모병
        • Chu de Dijon
        • 연락하다:
          • Laurence FAIVRE-OLIVIER, MD
        • 수석 연구원:
          • Laurence FAIVRE-OLIVIER, MD
      • Grenoble, 프랑스, 38043
        • 모병
        • CHU de Grenoble
        • 연락하다:
          • Clémentine LEGRAND, MD
        • 수석 연구원:
          • Clémentine LEGRAND, MD
      • La Rochelle, 프랑스, 17019
        • 모병
        • Groupe Hospitalier La Rochelle-Ré-Aunis
        • 연락하다:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • 수석 연구원:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Le Havre, 프랑스, 76083
        • 모병
        • Hôpital Flaubert
        • 연락하다:
          • Elodie LACAZE, MD
        • 수석 연구원:
          • Elodie LACAZE, MD
      • Lille, 프랑스, 59000
        • 모병
        • Centre Oscar Lambret
        • 연락하다:
          • Audrey MAILLIEZ, MD
        • 수석 연구원:
          • Audrey MAILLIEZ, MD
      • Lille, 프랑스, 59037
        • 모병
        • CHRU Lille
        • 연락하다:
          • Sophie LEJEUNE, MD
        • 수석 연구원:
          • Sophie LEJEUNE, MD
      • Limoges, 프랑스, 87042
        • 모병
        • CHU Dupuytren
        • 연락하다:
          • Laurence Venat-Bouvet, MD
        • 수석 연구원:
          • Laurence VENAT-BOUVET, MD
      • Lyon, 프랑스, 69373
        • 모병
        • Centre Leon Berard
        • 연락하다:
          • Christine LASSET, MD
        • 수석 연구원:
          • Christine LASSET, MD
      • Lyon, 프랑스, 69229
        • 모병
        • Hospices Civils de Lyon
        • 연락하다:
          • Sophie GIRAUD, MD
        • 수석 연구원:
          • Sophie GIRAUD, MD
      • Marseille, 프랑스, 13009
        • 모병
        • Institut Paoli Calmettes
        • 연락하다:
          • Hagay SOBOL, PhD
        • 수석 연구원:
          • Hagay SOBOL, PhD
      • Marseille, 프랑스, 13385
        • 모병
        • CHU La Timone
        • 연락하다:
          • Hélène ZATTARA, MD
        • 수석 연구원:
          • Hélène ZATTARA, MD
      • Montpellier, 프랑스, 34295
        • 모병
        • CHU Arnaud de Villeneuve
        • 연락하다:
          • Isabelle COUPIER, MD
        • 수석 연구원:
          • Isabelle COUPIER, MD
      • Nantes, 프랑스, 44202
        • 모병
        • Centre Catherine de Sienne
        • 수석 연구원:
          • Alain Lortholary, MD
        • 연락하다:
          • Alain LORTHOLARY, MD
      • Nice, 프랑스, 06189
        • 모병
        • Centre Antoine Lacassagne
        • 연락하다:
          • Véronique MARI, MD
        • 수석 연구원:
          • Véronique MARI, MD
      • Niort, 프랑스, 79021
        • 모병
        • Centre Hospitalier Georges Renon
        • 연락하다:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • 수석 연구원:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Nîmes, 프랑스, 30029
        • 모병
        • CHRU Caremeau
        • 연락하다:
          • Jean CHIESA, MD
        • 수석 연구원:
          • Jean CHIESA, MD
      • Orléans, 프랑스, 45067
        • 모병
        • Hôpital de la Source
        • 연락하다:
          • E COTTEREAU, MD
        • 수석 연구원:
          • E COTTEREAU, MD
      • Paris, 프랑스, 75012
        • 모병
        • Hôpital Saint-Antoine
        • 연락하다:
          • Antoine DARDENNE, MD
        • 수석 연구원:
          • Antoine DARDENNE, MD
      • Paris, 프랑스, 75475
        • 모병
        • Hôpital Saint-Louis
        • 연락하다:
          • Odile COHEN-HAGUENAUER, MD
        • 수석 연구원:
          • Odile COHEN-HAGUENAUER, MD
      • Paris, 프랑스, 75013
        • 모병
        • Groupe Hospitalier Pitie-Salpetriere
        • 연락하다:
          • Véronica CUSIN, MD
        • 수석 연구원:
          • Véronica CUSIN, MD
      • Paris, 프랑스, 75020
        • 모병
        • Hopital Tenon
        • 연락하다:
          • Clémence EVREVIN, MD
        • 수석 연구원:
          • Clémence EVREVIN, MD
      • Paris, 프랑스, 75908
        • 모병
        • HEGP
        • 연락하다:
          • Pierre-Laurent PUIG, Phd
        • 수석 연구원:
          • Pierre-Laurent PUIG, Phd
      • Poitiers, 프랑스, 86021
        • 모병
        • Chu La Miletrie
        • 연락하다:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • 수석 연구원:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Reims, 프랑스, 51092
        • 모병
        • CHU de Reims
        • 연락하다:
          • Anne DURLACH, MD
        • 수석 연구원:
          • Anne DURLACH, MD
      • Reims, 프랑스, 51100
        • 모병
        • Institut Jean Godinot
        • 연락하다:
          • Tan Dat NGUYEN, PHD
        • 수석 연구원:
          • Tan Dat NGUYEN, PHD
      • Reims, 프랑스, 51100
        • 모병
        • ICC Courlancy
        • 연락하다:
          • Fanny BRAYOTEL, MD
        • 수석 연구원:
          • Fanny BRAYOTEL, MD
      • Rennes, 프랑스, 35042
        • 모병
        • Centre Eugene Marquis
        • 연락하다:
          • Louise CRIVELLI, MD
        • 수석 연구원:
          • Louise CRIVELLI, MD
      • Rouen, 프랑스, 76031
        • 모병
        • CHU de ROUEN
        • 연락하다:
          • Isabelle TENNEVET, MD
        • 수석 연구원:
          • Isabelle TENNEVET, MD
      • Saint-Herblain, 프랑스, 44804
        • 모병
        • ICO - Centre René Gauducheau
        • 연락하다:
          • Capucine DELNATTE, MD
        • 수석 연구원:
          • Capucine DELNATTE, MD
      • Saint-Étienne, 프랑스, 42055
        • 모병
        • CHU Saint Etienne
        • 연락하다:
          • Fabienne PRIEUR, MD
        • 수석 연구원:
          • Fabienne PRIEUR, MD
      • Strasbourg, 프랑스, 67033
        • 모병
        • Institut de Cancerologie Strasbourg Europe ICANS
        • 연락하다:
          • Philippe BOUDIER, MD
        • 수석 연구원:
          • Philippe BOUDIER, MD
      • Strasbourg, 프랑스, 67200
        • 모병
        • Hopital de Hautepierre - Hôpital Universitaire
        • 연락하다:
          • Christine MAUGARD, MD
        • 수석 연구원:
          • Christine MAUGARD, MD
      • Toulouse, 프랑스, 31059
        • 모병
        • Institut Claudius Regaud - IUCT - Oncopole
        • 수석 연구원:
          • Laurence Gladieff, MD
        • 연락하다:
          • Laurence GLADIEFF, MD
      • Tours, 프랑스, 37044
        • 모병
        • CHU Bretonneau
        • 수석 연구원:
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
        • 연락하다:
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
      • Troyes, 프랑스, 10003
        • 모병
        • CH Simone VEIL
        • 연락하다:
          • Charlotte CAILLE-BENIGNI, MD
        • 수석 연구원:
          • Charlotte CAILLE-BENIGNI, MD
      • Valence, 프랑스, 26953
        • 모병
        • Centre Hospitalier de Valence
        • 연락하다:
          • Marie-Noëlle BONNET-DUPEYRON, MD
        • 수석 연구원:
          • Marie-Noëlle BONNET-DUPEYRON, MD
      • Vandoeuvre les Nancy, 프랑스, 54511
        • 모병
        • CHU Nancy - Hôpital Brabois
        • 연락하다:
          • Jean-Marie RAVEL, MD
        • 수석 연구원:
          • Jean-Marie RAVEL, MD
      • Vandoeuvre les Nancy, 프랑스, 54511
        • 빼는
        • Centre Alexis Vautrin
      • Villejuif, 프랑스, 94805
        • 모병
        • Gustave Roussy
        • 연락하다:
          • Olivier CARON, MD
        • 수석 연구원:
          • Olivier CARON, MD
    • Haut De Seine
      • Saint-Cloud, Haut De Seine, 프랑스, 92210
        • 모병
        • Institut Curie - Hopital Rene Huguenin
        • 연락하다:
        • 수석 연구원:
          • Emmanuelle FOURME, MD
    • Ile De France
      • Paris, Ile De France, 프랑스, 75005
        • 모병
        • Institut Curie
        • 연락하다:
        • 수석 연구원:
          • Dominique STOPPA-LYONNET, PU-PH

참여기준

연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.

자격 기준

공부할 수 있는 나이

18년 이상 (성인, 고령자)

건강한 자원 봉사자를 받아들입니다

아니

설명

포함 기준:

사례 색인:

  • 모든 프랑스 연구소의 유전자 패널에서 모든 유전자의 변이를 식별하는 유전자 그룹 및 암의 국가 데이터베이스(GGC Unicancer)의 패밀리에 존재하고 선택된 유전자 변이 클래스 3 또는 4를 보유하는 사람.
  • 연령 ≥ 18세.
  • 서명된 서면 동의서 "인덱스 케이스"

제휴사:

  • 암에 걸린 지표 사례의 모든 친척
  • 가족 구조 및 지표 사례와 비교한 관련 정도에 따라 연구자가 유지한 지표 사례와 관련된 암이 없는 모든 친척
  • 연령 ≥ 18세
  • 정보에 입각한 동의서 "선택된 친척"의 정보 및 서명

제외 기준:

  • 미성년자
  • 자유를 박탈당했거나 후견인(큐레이터 포함).
  • 서명된 서면 동의서 부재

공부 계획

이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.

연구는 어떻게 설계됩니까?

디자인 세부사항

  • 주 목적: 특수 증상
  • 할당: 해당 없음
  • 중재 모델: 단일 그룹 할당
  • 마스킹: 없음(오픈 라벨)

무기와 개입

참가자 그룹 / 팔
개입 / 치료
다른: 코바르
타액 샘플은 선택된 관련(DNA)으로 만들어집니다.

연구는 무엇을 측정합니까?

주요 결과 측정

결과 측정
기간
병원성이 될 확률 측면에서 변이의 최대치를 분류하기 위해 패밀리에서 선택된 VUS의 공동 분리 분석을 수행합니다.
기간: 최대 15년
최대 15년

2차 결과 측정

결과 측정
기간
• UMD-BRCA1/2 데이터베이스에 확립된 기존 분류에 통합할 수 있는 VUS를 분류하기 위한 표준화된 방법을 제안하고, 클래스 4(아마도 인과적) 및 클래스 3(중요성을 알 수 없음)의 변형에 중점을 둡니다.
기간: 최대 15년
최대 15년
• 유전 상담을 안내하는 데 사용할 수 있는 위험에 처한 친척의 임상 관리에 대한 관련 권장 사항이 있는 VUS(병원성 및 중립 모두)의 수를 최대화합니다.
기간: 최대 15년
최대 15년
확장된 가계도에서 수집된 표현형/유전자형 데이터를 사용하여 중등도 암 위험과 관련이 있는 여러 클래스 3 및 4 VUS의 침투를 평가합니다.
기간: 최대 15년
최대 15년

공동 작업자 및 조사자

여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.

스폰서

수사관

  • 연구 의자: Dominique STOPPA-LYONNET, PU-PH, Institut Curie
  • 연구 책임자: Sandrine CAPUTO, PhD, Institut Curie

간행물 및 유용한 링크

연구에 대한 정보 입력을 담당하는 사람이 자발적으로 이러한 간행물을 제공합니다. 이것은 연구와 관련된 모든 것에 관한 것일 수 있습니다.

연구 기록 날짜

이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.

연구 주요 날짜

연구 시작 (실제)

2012년 7월 2일

기본 완료 (추정된)

2033년 1월 2일

연구 완료 (추정된)

2034년 1월 2일

연구 등록 날짜

최초 제출

2012년 5월 14일

QC 기준을 충족하는 최초 제출

2012년 9월 20일

처음 게시됨 (추정된)

2012년 9월 21일

연구 기록 업데이트

마지막 업데이트 게시됨 (실제)

2024년 1월 17일

QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출

2024년 1월 16일

마지막으로 확인됨

2024년 1월 1일

추가 정보

이 연구와 관련된 용어

이 정보는 변경 없이 clinicaltrials.gov 웹사이트에서 직접 가져온 것입니다. 귀하의 연구 세부 정보를 변경, 제거 또는 업데이트하도록 요청하는 경우 register@clinicaltrials.gov. 문의하십시오. 변경 사항이 clinicaltrials.gov에 구현되는 즉시 저희 웹사이트에도 자동으로 업데이트됩니다. .

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