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基因组中变体的共分离 (COVAR)

2024年1月16日 更新者：Institut Curie

研究基因组中核苷酸变体的家族共分离以验证其在遗传咨询中的用途

COVAR 项目的目的是对法国数据库的最大 VUS 进行可靠分类，以便将它们用于遗传咨询。 通过这项研究获得的结果将对患者及其家属的临床管理产生重大影响，在某些情况下建议进行预防性手术。

研究概览

地位

招聘中

条件

干预/治疗

详细说明

最初，COVAR 研究旨在探索 BRCA1（乳腺癌 1）和 BRCA2（乳腺癌 2）基因中具有未知生物学意义 (VUS) 的变异，这是在遗传性乳腺癌和/或卵巢癌中发现的两个主要基因。 从那时起，该研究随着诊断的发展而发展，首先引入了自 2015 年以来在诊断中探索的 PALB2（BRCA2 的伙伴和定位器）基因，现在将研究开放到在具有癌症的遗传易感性综合症。

法国 UMD（通用突变数据库）-BRCA1/2 获得法国国家癌症研究所认可，收集自 1995 年以来法国授权实验室进行的匿名基因检测结果，实时了解携带相同 VUS 的家庭。 2011 年 9 月，法国 UMD-BRCA1/2 数据库包含 1,300 个 BRCA1 家族中的 706 个不同变体和 2,101 个 BRCA2 家族中的 1,089 个不同变体。 2021 年 4 月，该数据库包含 1,651 个不同的 BRCA1 VSU、3,015 个不同的 BRCA2 VUS、47​​1 个不同的 PALB2 VUS、68 个 RAD51C 和 66 个 RAD51D。

自 2017 年以来，在诊断环境中探索了新基因，因为据报道它们是癌症的诱发因素。 该列表在不断发展（Moretta 等人，2018 年；Dhooge 等人，2020 年）。 这些基因的数据收集正在进行中，并且已经建立了一个新的数据库 (FrOG)，该数据库收集了在法国致癌网络中发现的所有 VUS 和突变。 我们已经在 2020 年底建立了一份联合体协议。 该数据库迄今为止收集了超过 40,000 个法国家庭的 12 个基因和 11,912 个不同的变体。

将 VUS 分类为因果突变的关键可测量参数之一是它们与疾病的共同分离。 法国家庭的平均规模相对较小，仅限于一个家庭的变异共隔离信息并不显着。 然而，从几个家族获得的共分离结果的汇编将允许对给定变异的因果关系概率获得更精确和完整的估计。

COVAR 研究（COsegregation VARiants）的目的是组织数据库 UMD-BRCA1/2 的 VUS 的共分离研究，以确定这些变异的因果或非因果性质。 为了根据临床相关性组织变体，使用了具有 5 类的网格：1=中性，2=可能中性，3=VUS，4=可能因果关系，5=因果关系。 第 3 类和第 4 类的 VUS 将成为共分离研究的候选者，因为它们不能用于遗传咨询。

在选定的家庭中，指示病例将邀请家庭成员（受影响和未受影响）提供唾液样本以测试 VUS 的存在。 VUS 是因果关系的概率将使用贝叶斯模型从共隔离数据中计算出来。 结果将整合到 D. Goldgar 描述的多因素模型中，该模型整合了不同参数，如氨基酸保守性、变异的结构影响、与致病突变的共现、家族史和肿瘤特征。

研究类型

介入性

注册 (估计的)

3500

阶段

  • 不适用

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。

学习联系方式

研究联系人备份

学习地点

  • 团圆
      • Saint-Pierre、团圆、97410
        • 招聘中
        • CHU Sud Réunion Saint-Pierre
        • 接触：
          • Hanitra RANJATOELINA, MD
        • 首席研究员：
          • Hanitra RANJATOELINA, MD
  • 法国
      • Amiens、法国、80054
        • 招聘中
        • CHU Amiens - Hopital Nord
        • 接触：
          • Gilles MORIN, MD
        • 首席研究员：
          • Gilles MORIN, MD
      • Angers、法国、49933
        • 招聘中
        • ICO - Centre Paul Papin
        • 接触：
          • Marie COUDERT, MD
        • 首席研究员：
          • Marie COUDERT, MD
      • Angoulême、法国、16959
        • 招聘中
        • Centre Hospitalier d'Angoulème
        • 接触：
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • 首席研究员：
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Avignon、法国、84918
        • 招聘中
        • Institut Sainte-Catherine
        • 接触：
          • Hélène DREYFUS, MD
        • 首席研究员：
          • Hélène DREYFUS, MD
      • Besancon、法国、25030
        • 招聘中
        • CHU Besançon
        • 接触：
          • Marie-Agnès COLLONGE-RAME, MD
        • 首席研究员：
          • Marie-Agnès COLLONGE-RAME, MD
      • Bordeaux、法国、33076
        • 招聘中
        • Institut Bergonie
        • 接触：
          • Virginie BUBIEN, MD
        • 首席研究员：
          • Virginie BUBIEN, MD
      • Bordeaux、法国、33076
        • 招聘中
        • Groupe Hospitalier Pellegrin
        • 接触：
          • Julie TINAT, MD
        • 首席研究员：
          • Julie TINAT, MD
      • Bourges、法国、18020
        • 招聘中
        • Centre Hospitalier Jacques Coeur
        • 首席研究员：
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
        • 接触：
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
      • Brest、法国、29200
        • 招聘中
        • CHU Morvan de Brest
        • 接触：
          • Marc PLANES, MD
        • 首席研究员：
          • Marc PLANES, MD
      • Caen、法国、14076
        • 招聘中
        • Centre Francois Baclesse
        • 接触：
          • Pascaline BERTHET, MD
        • 首席研究员：
          • Pascaline BERTHET, MD
      • Chambery、法国、73011
        • 招聘中
        • Centre Hospitalier Hôtel Dieu
        • 接触：
          • Sandra FERRER, MD
        • 首席研究员：
          • Sandra FERRER, MD
      • Clermont-Ferrand、法国、63011
        • 招聘中
        • Centre Jean Perrin
        • 接触：
          • Mathilde GAY-BELLILE, MD
        • 首席研究员：
          • Mathilde GAY-BELLILE, MD
      • Colmar、法国、68024
        • 尚未招聘
        • Hôpital Civil de Colmar
        • 接触：
          • Jean-Marc LIMACHER
        • 首席研究员：
          • Jean-Marc LIMACHER, MD
      • Dijon、法国、21079
        • 招聘中
        • CHU de Dijon
        • 接触：
          • Laurence FAIVRE-OLIVIER, MD
        • 首席研究员：
          • Laurence FAIVRE-OLIVIER, MD
      • Grenoble、法国、38043
        • 招聘中
        • CHU de Grenoble
        • 接触：
          • Clémentine LEGRAND, MD
        • 首席研究员：
          • Clémentine LEGRAND, MD
      • La Rochelle、法国、17019
        • 招聘中
        • Groupe Hospitalier La Rochelle-Ré-Aunis
        • 接触：
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • 首席研究员：
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Le Havre、法国、76083
        • 招聘中
        • Hôpital Flaubert
        • 接触：
          • Elodie LACAZE, MD
        • 首席研究员：
          • Elodie LACAZE, MD
      • Lille、法国、59000
        • 招聘中
        • Centre OSCAR LAMBRET
        • 接触：
          • Audrey MAILLIEZ, MD
        • 首席研究员：
          • Audrey MAILLIEZ, MD
      • Lille、法国、59037
        • 招聘中
        • CHRU Lille
        • 接触：
          • Sophie LEJEUNE, MD
        • 首席研究员：
          • Sophie LEJEUNE, MD
      • Limoges、法国、87042
        • 招聘中
        • Chu Dupuytren
        • 接触：
          • Laurence Venat-Bouvet, MD
        • 首席研究员：
          • Laurence VENAT-BOUVET, MD
      • Lyon、法国、69373
        • 招聘中
        • Centre LEON BERARD
        • 接触：
          • Christine LASSET, MD
        • 首席研究员：
          • Christine LASSET, MD
      • Lyon、法国、69229
        • 招聘中
        • Hospices Civils de Lyon
        • 接触：
          • Sophie GIRAUD, MD
        • 首席研究员：
          • Sophie GIRAUD, MD
      • Marseille、法国、13009
        • 招聘中
        • Institut Paoli Calmettes
        • 接触：
          • Hagay SOBOL, PhD
        • 首席研究员：
          • Hagay SOBOL, PhD
      • Marseille、法国、13385
        • 招聘中
        • CHU La Timone
        • 接触：
          • Hélène ZATTARA, MD
        • 首席研究员：
          • Hélène ZATTARA, MD
      • Montpellier、法国、34295
        • 招聘中
        • CHU Arnaud de Villeneuve
        • 接触：
          • Isabelle COUPIER, MD
        • 首席研究员：
          • Isabelle COUPIER, MD
      • Nantes、法国、44202
        • 招聘中
        • Centre Catherine de Sienne
        • 首席研究员：
          • Alain Lortholary, MD
        • 接触：
          • Alain LORTHOLARY, MD
      • Nice、法国、06189
        • 招聘中
        • Centre Antoine Lacassagne
        • 接触：
          • Véronique MARI, MD
        • 首席研究员：
          • Véronique MARI, MD
      • Niort、法国、79021
        • 招聘中
        • Centre Hospitalier Georges Renon
        • 接触：
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • 首席研究员：
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Nîmes、法国、30029
        • 招聘中
        • CHRU Caremeau
        • 接触：
          • Jean CHIESA, MD
        • 首席研究员：
          • Jean CHIESA, MD
      • Orléans、法国、45067
        • 招聘中
        • Hôpital de la Source
        • 接触：
          • E COTTEREAU, MD
        • 首席研究员：
          • E COTTEREAU, MD
      • Paris、法国、75012
        • 招聘中
        • Hopital Saint-Antoine
        • 接触：
          • Antoine DARDENNE, MD
        • 首席研究员：
          • Antoine DARDENNE, MD
      • Paris、法国、75475
        • 招聘中
        • Hôpital Saint-Louis
        • 接触：
          • Odile COHEN-HAGUENAUER, MD
        • 首席研究员：
          • Odile COHEN-HAGUENAUER, MD
      • Paris、法国、75013
        • 招聘中
        • Groupe Hospitalier Pitie-Salpetriere
        • 接触：
          • Véronica CUSIN, MD
        • 首席研究员：
          • Véronica CUSIN, MD
      • Paris、法国、75020
        • 招聘中
        • Hopital Tenon
        • 接触：
          • Clémence EVREVIN, MD
        • 首席研究员：
          • Clémence EVREVIN, MD
      • Paris、法国、75908
        • 招聘中
        • HEGP
        • 接触：
          • Pierre-Laurent PUIG, Phd
        • 首席研究员：
          • Pierre-Laurent PUIG, Phd
      • Poitiers、法国、86021
        • 招聘中
        • CHU La Milétrie
        • 接触：
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • 首席研究员：
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Reims、法国、51092
        • 招聘中
        • CHU de Reims
        • 接触：
          • Anne DURLACH, MD
        • 首席研究员：
          • Anne DURLACH, MD
      • Reims、法国、51100
        • 招聘中
        • Institut Jean Godinot
        • 接触：
          • Tan Dat NGUYEN, PHD
        • 首席研究员：
          • Tan Dat NGUYEN, PHD
      • Reims、法国、51100
        • 招聘中
        • ICC Courlancy
        • 接触：
          • Fanny BRAYOTEL, MD
        • 首席研究员：
          • Fanny BRAYOTEL, MD
      • Rennes、法国、35042
        • 招聘中
        • Centre Eugene Marquis
        • 接触：
          • Louise CRIVELLI, MD
        • 首席研究员：
          • Louise CRIVELLI, MD
      • Rouen、法国、76031
        • 招聘中
        • CHU de Rouen
        • 接触：
          • Isabelle TENNEVET, MD
        • 首席研究员：
          • Isabelle TENNEVET, MD
      • Saint-Herblain、法国、44804
        • 招聘中
        • ICO - Centre René Gauducheau
        • 接触：
          • Capucine DELNATTE, MD
        • 首席研究员：
          • Capucine DELNATTE, MD
      • Saint-Étienne、法国、42055
        • 招聘中
        • CHU Saint Etienne
        • 接触：
          • Fabienne PRIEUR, MD
        • 首席研究员：
          • Fabienne PRIEUR, MD
      • Strasbourg、法国、67033
        • 招聘中
        • Institut de Cancerologie Strasbourg Europe ICANS
        • 接触：
          • Philippe BOUDIER, MD
        • 首席研究员：
          • Philippe BOUDIER, MD
      • Strasbourg、法国、67200
        • 招聘中
        • Hopital de Hautepierre - Hôpital Universitaire
        • 接触：
          • Christine MAUGARD, MD
        • 首席研究员：
          • Christine MAUGARD, MD
      • Toulouse、法国、31059
        • 招聘中
        • Institut Claudius Regaud - IUCT - Oncopole
        • 首席研究员：
          • Laurence GLADIEFF, MD
        • 接触：
          • Laurence GLADIEFF, MD
      • Tours、法国、37044
        • 招聘中
        • CHU Bretonneau
        • 首席研究员：
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
        • 接触：
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
      • Troyes、法国、10003
        • 招聘中
        • CH Simone VEIL
        • 接触：
          • Charlotte CAILLE-BENIGNI, MD
        • 首席研究员：
          • Charlotte CAILLE-BENIGNI, MD
      • Valence、法国、26953
        • 招聘中
        • Centre Hospitalier de Valence
        • 接触：
          • Marie-Noëlle BONNET-DUPEYRON, MD
        • 首席研究员：
          • Marie-Noëlle BONNET-DUPEYRON, MD
      • Vandoeuvre les Nancy、法国、54511
        • 招聘中
        • CHU Nancy - Hôpital Brabois
        • 接触：
          • Jean-Marie RAVEL, MD
        • 首席研究员：
          • Jean-Marie RAVEL, MD
      • Vandoeuvre les Nancy、法国、54511
        • 撤销
        • Centre Alexis Vautrin
      • Villejuif、法国、94805
        • 招聘中
        • Gustave Roussy
        • 接触：
          • Olivier CARON, MD
        • 首席研究员：
          • Olivier CARON, MD
    • Haut De Seine
      • Saint-Cloud、Haut De Seine、法国、92210
        • 招聘中
        • Institut Curie - Hôpital René Huguenin
        • 接触：
        • 首席研究员：
          • Emmanuelle FOURME, MD
    • Ile De France
      • Paris、Ile De France、法国、75005
        • 招聘中
        • Institut Curie
        • 接触：
        • 首席研究员：
          • Dominique STOPPA-LYONNET, PU-PH
  • 瓜德罗普岛
      • Pointe à Pitre、瓜德罗普岛、97110
        • 招聘中
        • CHU de Pointe à Pitre
        • 接触：
          • Marilyn LACKMY-PORT-LIS, MD
        • 首席研究员：
          • Marilyn LACKMY-PORT-LIS, MD
  • 马提尼克岛
      • Fort de France、马提尼克岛、97261
        • 招聘中
        • CHU de Fort de France
        • 接触：
          • Odile BERA, MD
        • 首席研究员：
          • Odile BERA, MD

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

18年 及以上 (成人、年长者)

接受健康志愿者

不

描述

纳入标准：

指标案例：

  • 携带 3 级或 4 级基因变异的人，出现在国家遗传组和癌症数据库 (GGC Unicancer) 的家族中并被选中，该数据库从所有法国实验室的基因组中识别出所有基因的变异。
  • 年龄 ≥ 18 岁。
  • 签署书面知情同意书“指标案例”

关联方：

  • 癌症指示病例的任何亲属
  • 与指示病例相关的任何未患癌症的亲属，由调查人员根据家庭结构和与指示病例的相关程度进行保留
  • 年龄 ≥ 18 岁
  • “选择的亲属”知情同意书的信息和签名

排除标准：

  • 未成年人
  • 被剥夺自由或受到监护的人（包括馆长）。
  • 没有签署书面知情同意书

学习计划

本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的？

设计细节

  • 主要用途：诊断
  • 分配：不适用
  • 介入模型：单组作业
  • 屏蔽：无（打开标签）

武器和干预

参与者组/臂
干预/治疗
其他：协华
遗传的：唾液套装
唾液样本将由选定的相关（DNA）制成。

研究衡量的是什么？

主要结果指标

结果测量
大体时间
对家族中选定的 VUS 进行共分离分析，以便根据致病概率对最大变体进行分类
大体时间：长达 15 年
长达 15 年

次要结果测量

结果测量
大体时间
• 提出一种对VUS 进行分类的标准化方法，该方法可以集成到UMD-BRCA1/2 数据库中建立的现有分类中，主要关注第4 类（可能是因果关系）和第3 类（意义不明）的变体。
大体时间：长达 15 年
长达 15 年
• 最大限度地增加VUS（包括致病性和中性）的数量，这些VUS 具有可用于指导遗传咨询的高危亲属临床管理的相关建议。
大体时间：长达 15 年
长达 15 年
使用在扩展谱系上收集的表型/基因型数据，评估可能与中度癌症风险相关的几个 3 类和 4 类 VUS 的外显率。
大体时间：长达 15 年
长达 15 年

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

赞助

Institut Curie

调查人员

  • 学习椅：Dominique STOPPA-LYONNET, PU-PH、Institut Curie
  • 研究主任：Sandrine CAPUTO, PhD、Institut Curie

出版物和有用的链接

负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。

有用的网址

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (实际的)

2012年7月2日

初级完成 (估计的)

2033年1月2日

研究完成 (估计的)

2034年1月2日

研究注册日期

首次提交

2012年5月14日

首先提交符合 QC 标准的

2012年9月20日

首次发布 (估计的)

2012年9月21日

研究记录更新

最后更新发布 (实际的)

2024年1月17日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2024年1月16日

最后验证

2024年1月1日

更多信息

与本研究相关的术语

关键字

其他相关的 MeSH 术语

其他研究编号

  • IC 2011-11

此信息直接从 clinicaltrials.gov 网站检索，没有任何更改。如果您有任何更改、删除或更新研究详细信息的请求，请联系 register@clinicaltrials.gov. clinicaltrials.gov 上实施更改，我们的网站上也会自动更新.

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