Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

COsegregering av VARianter i panel av gener (COVAR)

16. januar 2024 oppdatert av: Institut Curie

Studie av familie-COsegregering av nukleotidvarianter i panelet av gener for å validere deres bruk i genetisk rådgivning

Målet med COVAR-prosjektet er å klassifisere pålitelig maksimalt VUS i den franske databasen for å kunne bruke dem til genetisk rådgivning. Resultatene oppnådd gjennom denne studien vil ha stor innvirkning på den kliniske behandlingen av pasientene og deres familier som i noen tilfeller foreslår en profylaktisk kirurgi.

Studieoversikt

Status

Rekruttering

Intervensjon / Behandling

Detaljert beskrivelse

Opprinnelig var COVAR-studien designet for å utforske varianter av ukjent biologisk betydning (VUS) i BRCA1 (BReast Cancer 1) og BRCA2 (BReast Cancer 2) gener, som er de to hovedgenene identifisert i arvelig bryst- og/eller eggstokkreft. Siden den gang har studien utviklet seg, parallelt med utviklingen av diagnose, først introdusert PALB2 (Partner og lokalisator av BRCA2) genet utforsket i diagnose siden 2015 og nå åpner studien for alle genene til panelene utført i diagnose i familier med et genetisk predisposisjonssyndrom for kreft.

Den franske UMD (Universal Mutation Database)-BRCA1/2, akkreditert av det franske nasjonale kreftinstituttet, samler inn anonyme resultater av genetiske tester utført av autoriserte franske laboratorier siden 1995, og gir en sanntidsvisjon av familier som bærer samme VUS. I september 2011 omfattet den franske UMD-BRCA1/2-databasen 706 forskjellige varianter i 1300 BRCA1-familier og 1089 forskjellige varianter i 2101 BRCA2-familier. I april 2021 inneholdt denne databasen 1651 forskjellige VSU for BRCA1, 3015 forskjellige VUS for BRCA2, 471 forskjellige VUS for PALB2, 68 for RAD51C og 66 for RAD51D.

Siden 2017 har nye gener blitt utforsket i diagnostiske omgivelser ettersom de har blitt rapportert som disponerende faktorer for kreft. Denne listen er i stadig utvikling (Moretta et al., 2018; Dhooge et al., 2020). Datainnsamling for disse genene pågår og en ny database (FrOG) som samler alle VUS og mutasjoner identifisert i det franske onkogenetiske nettverket er satt opp. Vi har opprettet en konsortieavtale i slutten av 2020. Denne databasen samler til dags dato 12 gener og 11 912 forskjellige varianter i mer enn 40 000 franske familier.

En av de viktigste målbare parametrene for klassifisering av VUS som årsaksmutasjoner er deres ko-segregering med sykdommen. Den gjennomsnittlige størrelsen på franske familier er relativt liten, informasjonen om variant co-segregering begrenset til én familie ville ikke være signifikant. Imidlertid vil sammenstillingen av samsegregeringsresultater oppnådd fra flere familier gjøre det mulig å oppnå mer presise og fullstendige estimater av sannsynligheten for årsakssammenheng for en gitt variant.

Målet med COVAR-studien (COsegregation VARiants) er å organisere co-segregation-studier av VUS-en til databasen UMD-BRCA1/2, for å bestemme årsaks- eller ikke-årsaksnaturen til disse variantene. For å organisere variantene etter deres kliniske relevans er det brukt et rutenett med 5 klasser: 1=nøytral, 2=sannsynlig nøytral, 3=VUS, 4=sannsynlig årsakssammenheng, 5=årsak. VUS for klasse 3 og 4 vil være kandidater til samsegregeringsstudier fordi de ikke kan brukes til genetisk veiledning.

I de utvalgte familiene vil indekstilfellet invitere familiemedlemmene (berørte og upåvirkede) til å gi en prøve av spyttvæske for å teste tilstedeværelsen av VUS. Sannsynligheten for at en VUS er kausal vil bli beregnet fra cosegregeringsdataene ved å bruke en Bayesiansk modell. Resultatene vil bli integrert i den multifaktorielle modellen beskrevet av D. Goldgar, modell som integrerer ulike parametere som aminosyrekonservering, strukturell påvirkning av varianten, samtidig forekomst med en patogen mutasjon, familiehistorie og tumorkarakteristikker.

Studietype

Intervensjonell

Registrering (Antatt)

3500

Fase

  • Ikke aktuelt

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiekontakt

Studer Kontakt Backup

Studiesteder

      • Amiens, Frankrike, 80054
        • Rekruttering
        • CHU Amiens - Hopital Nord
        • Ta kontakt med:
          • Gilles MORIN, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Gilles MORIN, MD
      • Angers, Frankrike, 49933
        • Rekruttering
        • ICO - Centre Paul Papin
        • Ta kontakt med:
          • Marie COUDERT, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Marie COUDERT, MD
      • Angoulême, Frankrike, 16959
        • Rekruttering
        • Centre Hospitalier d'Angoulème
        • Ta kontakt med:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Avignon, Frankrike, 84918
        • Rekruttering
        • Institut Sainte-Catherine
        • Ta kontakt med:
          • Hélène DREYFUS, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Hélène DREYFUS, MD
      • Besancon, Frankrike, 25030
        • Rekruttering
        • CHU Besançon
        • Ta kontakt med:
          • Marie-Agnès COLLONGE-RAME, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Marie-Agnès COLLONGE-RAME, MD
      • Bordeaux, Frankrike, 33076
        • Rekruttering
        • Institut Bergonie
        • Ta kontakt med:
          • Virginie BUBIEN, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Virginie BUBIEN, MD
      • Bordeaux, Frankrike, 33076
        • Rekruttering
        • Groupe Hospitalier Pellegrin
        • Ta kontakt med:
          • Julie TINAT, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Julie TINAT, MD
      • Bourges, Frankrike, 18020
        • Rekruttering
        • Centre Hospitalier Jacques Coeur
        • Hovedetterforsker:
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
        • Ta kontakt med:
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
      • Brest, Frankrike, 29200
        • Rekruttering
        • CHU Morvan de Brest
        • Ta kontakt med:
          • Marc PLANES, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Marc PLANES, MD
      • Caen, Frankrike, 14076
        • Rekruttering
        • Centre francois Baclesse
        • Ta kontakt med:
          • Pascaline BERTHET, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Pascaline BERTHET, MD
      • Chambery, Frankrike, 73011
        • Rekruttering
        • Centre Hospitalier Hôtel Dieu
        • Ta kontakt med:
          • Sandra FERRER, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Sandra FERRER, MD
      • Clermont-Ferrand, Frankrike, 63011
        • Rekruttering
        • Centre Jean Perrin
        • Ta kontakt med:
          • Mathilde GAY-BELLILE, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Mathilde GAY-BELLILE, MD
      • Colmar, Frankrike, 68024
        • Har ikke rekruttert ennå
        • Hôpital Civil de Colmar
        • Ta kontakt med:
          • Jean-Marc LIMACHER
        • Hovedetterforsker:
          • Jean-Marc LIMACHER, MD
      • Dijon, Frankrike, 21079
        • Rekruttering
        • CHU de Dijon
        • Ta kontakt med:
          • Laurence FAIVRE-OLIVIER, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Laurence FAIVRE-OLIVIER, MD
      • Grenoble, Frankrike, 38043
        • Rekruttering
        • Chu De Grenoble
        • Ta kontakt med:
          • Clémentine LEGRAND, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Clémentine LEGRAND, MD
      • La Rochelle, Frankrike, 17019
        • Rekruttering
        • Groupe Hospitalier La Rochelle-Ré-Aunis
        • Ta kontakt med:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Le Havre, Frankrike, 76083
        • Rekruttering
        • Hôpital Flaubert
        • Ta kontakt med:
          • Elodie LACAZE, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Elodie LACAZE, MD
      • Lille, Frankrike, 59000
        • Rekruttering
        • Centre Oscar Lambret
        • Ta kontakt med:
          • Audrey MAILLIEZ, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Audrey MAILLIEZ, MD
      • Lille, Frankrike, 59037
        • Rekruttering
        • CHRU Lille
        • Ta kontakt med:
          • Sophie LEJEUNE, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Sophie LEJEUNE, MD
      • Limoges, Frankrike, 87042
        • Rekruttering
        • Chu Dupuytren
        • Ta kontakt med:
          • Laurence Venat-Bouvet, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Laurence VENAT-BOUVET, MD
      • Lyon, Frankrike, 69373
        • Rekruttering
        • Centre Leon Berard
        • Ta kontakt med:
          • Christine LASSET, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Christine LASSET, MD
      • Lyon, Frankrike, 69229
        • Rekruttering
        • Hospices Civils de Lyon
        • Ta kontakt med:
          • Sophie GIRAUD, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Sophie GIRAUD, MD
      • Marseille, Frankrike, 13009
        • Rekruttering
        • Institut Paoli Calmettes
        • Ta kontakt med:
          • Hagay SOBOL, PhD
        • Hovedetterforsker:
          • Hagay SOBOL, PhD
      • Marseille, Frankrike, 13385
        • Rekruttering
        • CHU La Timone
        • Ta kontakt med:
          • Hélène ZATTARA, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Hélène ZATTARA, MD
      • Montpellier, Frankrike, 34295
        • Rekruttering
        • CHU Arnaud de Villeneuve
        • Ta kontakt med:
          • Isabelle COUPIER, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Isabelle COUPIER, MD
      • Nantes, Frankrike, 44202
        • Rekruttering
        • Centre Catherine de Sienne
        • Hovedetterforsker:
          • Alain Lortholary, MD
        • Ta kontakt med:
          • Alain LORTHOLARY, MD
      • Nice, Frankrike, 06189
        • Rekruttering
        • Centre Antoine Lacassagne
        • Ta kontakt med:
          • Véronique MARI, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Véronique MARI, MD
      • Niort, Frankrike, 79021
        • Rekruttering
        • Centre Hospitalier Georges Renon
        • Ta kontakt med:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Nîmes, Frankrike, 30029
        • Rekruttering
        • CHRU Caremeau
        • Ta kontakt med:
          • Jean CHIESA, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Jean CHIESA, MD
      • Orléans, Frankrike, 45067
        • Rekruttering
        • Hôpital de la Source
        • Ta kontakt med:
          • E COTTEREAU, MD
        • Hovedetterforsker:
          • E COTTEREAU, MD
      • Paris, Frankrike, 75012
        • Rekruttering
        • Hôpital Saint-Antoine
        • Ta kontakt med:
          • Antoine DARDENNE, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Antoine DARDENNE, MD
      • Paris, Frankrike, 75475
        • Rekruttering
        • Hôpital Saint-Louis
        • Ta kontakt med:
          • Odile COHEN-HAGUENAUER, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Odile COHEN-HAGUENAUER, MD
      • Paris, Frankrike, 75013
        • Rekruttering
        • Groupe Hospitalier Pitie-Salpetriere
        • Ta kontakt med:
          • Véronica CUSIN, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Véronica CUSIN, MD
      • Paris, Frankrike, 75020
        • Rekruttering
        • Hopital Tenon
        • Ta kontakt med:
          • Clémence EVREVIN, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Clémence EVREVIN, MD
      • Paris, Frankrike, 75908
        • Rekruttering
        • HEGP
        • Ta kontakt med:
          • Pierre-Laurent PUIG, Phd
        • Hovedetterforsker:
          • Pierre-Laurent PUIG, Phd
      • Poitiers, Frankrike, 86021
        • Rekruttering
        • CHU la Milétrie
        • Ta kontakt med:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Reims, Frankrike, 51092
        • Rekruttering
        • CHU de Reims
        • Ta kontakt med:
          • Anne DURLACH, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Anne DURLACH, MD
      • Reims, Frankrike, 51100
        • Rekruttering
        • Institut Jean Godinot
        • Ta kontakt med:
          • Tan Dat NGUYEN, PHD
        • Hovedetterforsker:
          • Tan Dat NGUYEN, PHD
      • Reims, Frankrike, 51100
        • Rekruttering
        • ICC Courlancy
        • Ta kontakt med:
          • Fanny BRAYOTEL, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Fanny BRAYOTEL, MD
      • Rennes, Frankrike, 35042
        • Rekruttering
        • Centre Eugène Marquis
        • Ta kontakt med:
          • Louise CRIVELLI, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Louise CRIVELLI, MD
      • Rouen, Frankrike, 76031
        • Rekruttering
        • Chu de Rouen
        • Ta kontakt med:
          • Isabelle TENNEVET, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Isabelle TENNEVET, MD
      • Saint-Herblain, Frankrike, 44804
        • Rekruttering
        • ICO - Centre René Gauducheau
        • Ta kontakt med:
          • Capucine DELNATTE, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Capucine DELNATTE, MD
      • Saint-Étienne, Frankrike, 42055
        • Rekruttering
        • Chu Saint Etienne
        • Ta kontakt med:
          • Fabienne PRIEUR, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Fabienne PRIEUR, MD
      • Strasbourg, Frankrike, 67033
        • Rekruttering
        • Institut de Cancerologie Strasbourg Europe ICANS
        • Ta kontakt med:
          • Philippe BOUDIER, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Philippe BOUDIER, MD
      • Strasbourg, Frankrike, 67200
        • Rekruttering
        • Hopital de Hautepierre - Hôpital Universitaire
        • Ta kontakt med:
          • Christine MAUGARD, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Christine MAUGARD, MD
      • Toulouse, Frankrike, 31059
        • Rekruttering
        • Institut Claudius Regaud - IUCT - Oncopole
        • Hovedetterforsker:
          • Laurence GLADIEFF, MD
        • Ta kontakt med:
          • Laurence GLADIEFF, MD
      • Tours, Frankrike, 37044
        • Rekruttering
        • CHU Bretonneau
        • Hovedetterforsker:
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
        • Ta kontakt med:
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
      • Troyes, Frankrike, 10003
        • Rekruttering
        • CH Simone VEIL
        • Ta kontakt med:
          • Charlotte CAILLE-BENIGNI, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Charlotte CAILLE-BENIGNI, MD
      • Valence, Frankrike, 26953
        • Rekruttering
        • Centre Hospitalier de Valence
        • Ta kontakt med:
          • Marie-Noëlle BONNET-DUPEYRON, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Marie-Noëlle BONNET-DUPEYRON, MD
      • Vandoeuvre les Nancy, Frankrike, 54511
        • Rekruttering
        • CHU Nancy - Hôpital Brabois
        • Ta kontakt med:
          • Jean-Marie RAVEL, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Jean-Marie RAVEL, MD
      • Vandoeuvre les Nancy, Frankrike, 54511
        • Tilbaketrukket
        • Centre Alexis Vautrin
      • Villejuif, Frankrike, 94805
        • Rekruttering
        • Gustave Roussy
        • Ta kontakt med:
          • Olivier CARON, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Olivier CARON, MD
    • Haut De Seine
      • Saint-Cloud, Haut De Seine, Frankrike, 92210
        • Rekruttering
        • Institut Curie - Hôpital René Huguenin
        • Ta kontakt med:
        • Hovedetterforsker:
          • Emmanuelle FOURME, MD
    • Ile De France
      • Paris, Ile De France, Frankrike, 75005
        • Rekruttering
        • Institut Curie
        • Ta kontakt med:
        • Hovedetterforsker:
          • Dominique STOPPA-LYONNET, PU-PH
      • Saint-Pierre, Gjenforening, 97410
        • Rekruttering
        • CHU Sud Réunion Saint-Pierre
        • Ta kontakt med:
          • Hanitra RANJATOELINA, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Hanitra RANJATOELINA, MD
      • Pointe à Pitre, Guadeloupe, 97110
        • Rekruttering
        • CHU de Pointe à Pitre
        • Ta kontakt med:
          • Marilyn LACKMY-PORT-LIS, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Marilyn LACKMY-PORT-LIS, MD
      • Fort de France, Martinique, 97261
        • Rekruttering
        • CHU de Fort de France
        • Ta kontakt med:
          • Odile BERA, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Odile BERA, MD

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

18 år og eldre (Voksen, Eldre voksen)

Tar imot friske frivillige

Nei

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

Indeks tilfeller:

  • En person som bærer en genvariant klasse 3 eller 4, tilstede og valgt i familiene til den nasjonale databasen for genetisk gruppe og kreft (GGC Unicancer) som identifiserer variasjonene til alle gener fra panelet av gener til alle franske laboratorier.
  • Alder ≥ 18 år.
  • Signert skriftlig informert samtykke "indekssak"

Relaterte partier:

  • Enhver pårørende til et indekstilfelle med kreft
  • Enhver slektning uten kreft relatert til et indekstilfelle, beholdt av etterforskere, basert på familiestruktur og grad av relatert sammenlignet med indekstilfellet
  • Alder ≥ 18 år
  • Informasjon og signatur av informert samtykke "utvalgte slektninger"

Ekskluderingskriterier:

  • Mindreårige
  • Personer som er frihetsberøvet eller under vergemål (inkludert kuratorer).
  • Fravær av signert skriftlig informert samtykke

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

  • Primært formål: Diagnostisk
  • Tildeling: N/A
  • Intervensjonsmodell: Enkeltgruppeoppdrag
  • Masking: Ingen (Open Label)

Våpen og intervensjoner

Deltakergruppe / Arm
Intervensjon / Behandling
Annen: Covar
Spyttprøvene vil bli laget av utvalgt relatert (DNA).

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tidsramme
Utfør co-segregeringsanalysen av den valgte VUS i familiene for å klassifisere maksimalt antall varianter med tanke på deres sannsynlighet for å være patogen
Tidsramme: opptil 15 år
opptil 15 år

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Tidsramme
• Foreslå en standardisert metode for å klassifisere VUS som kan integreres i den allerede eksisterende klassifiseringen etablert i UMD-BRCA1/2 databasen, med hovedfokus på varianter av klasse 4 (sannsynligvis kausal) og klasse 3 (ukjent betydning).
Tidsramme: opptil 15 år
opptil 15 år
• Maksimere antall VUS (både patogene og nøytrale) med tilhørende anbefalinger for klinisk behandling av slektninger i risikogruppen som kan brukes til å veilede genetisk veiledning.
Tidsramme: opptil 15 år
opptil 15 år
Vurder penetransen til flere klasse 3 og 4 VUS sannsynligvis assosiert med moderat kreftrisiko, ved å bruke innsamlede fenotype/genotypedata på utvidede stamtavler.
Tidsramme: opptil 15 år
opptil 15 år

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Sponsor

Etterforskere

  • Studiestol: Dominique STOPPA-LYONNET, PU-PH, Institut Curie
  • Studieleder: Sandrine CAPUTO, PhD, Institut Curie

Publikasjoner og nyttige lenker

Den som er ansvarlig for å legge inn informasjon om studien leverer frivillig disse publikasjonene. Disse kan handle om alt relatert til studiet.

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

2. juli 2012

Primær fullføring (Antatt)

2. januar 2033

Studiet fullført (Antatt)

2. januar 2034

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

14. mai 2012

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

20. september 2012

Først lagt ut (Antatt)

21. september 2012

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

17. januar 2024

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

16. januar 2024

Sist bekreftet

1. januar 2024

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Kliniske studier på Genetisk predisposisjon

Kliniske studier på spyttsett

3
Abonnere