COsegregatie van VARIanten in panel van genen (COVAR)
Studie van familiale CO-scheiding van nucleotidevarianten in het genenpanel om hun gebruik in genetische counseling te valideren
Studie Overzicht
Toestand
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
Oorspronkelijk was de COVAR-studie opgezet om varianten van onbekende biologische betekenis (VUS) te onderzoeken in BRCA1- (BReast Cancer 1)- en BRCA2- (BReast Cancer 2)-genen, de twee belangrijkste genen die worden geïdentificeerd in erfelijke borst- en/of eierstokkanker. Sindsdien is de studie geëvolueerd, parallel met de evolutie van de diagnose, waarbij eerst het PALB2-gen (partner en lokalisatie van BRCA2) werd geïntroduceerd dat sinds 2015 in de diagnose wordt onderzocht, en nu wordt de studie opengesteld voor alle genen van de panels die worden uitgevoerd bij de diagnose in families met een genetisch aanlegsyndroom voor kankers.
De Franse UMD (Universal Mutation Database)-BRCA1/2, geaccrediteerd door het Franse National Cancer Institute, verzamelt anonieme resultaten van genetische tests die sinds 1995 zijn uitgevoerd door geautoriseerde Franse laboratoria, en geeft een real-time beeld van families die dezelfde VUS dragen. In september 2011 bevatte de Franse UMD-BRCA1/2-database 706 verschillende varianten in 1.300 BRCA1-families en 1.089 verschillende varianten in 2.101 BRCA2-families. In april 2021 bevatte deze database 1.651 verschillende VSU's voor BRCA1, 3.015 verschillende VUS's voor BRCA2, 471 verschillende VUS's voor PALB2, 68 voor RAD51C en 66 voor RAD51D.
Sinds 2017 zijn nieuwe genen onderzocht in de diagnostische setting, omdat ze zijn gerapporteerd als predisponerende factoren voor kanker. Deze lijst evolueert voortdurend (Moretta et al., 2018; Dhooge et al., 2020). Het verzamelen van gegevens voor deze genen is aan de gang en er is een nieuwe database (FrOG) opgezet die alle VUS en mutaties verzamelt die in het Franse oncogenetische netwerk zijn geïdentificeerd. Eind 2020 hebben we een consortiumovereenkomst gesloten. Deze database verzamelt tot op heden 12 genen en 11.912 verschillende varianten in meer dan 40.000 Franse families.
Een van de belangrijkste meetbare parameters voor classificatie van VUS als oorzakelijke mutaties is hun co-segregatie met de ziekte. De gemiddelde grootte van Franse gezinnen is relatief klein, de informatie over variante co-segregatie beperkt tot één gezin zou niet significant zijn. De compilatie van co-segregatieresultaten verkregen uit verschillende families zal het echter mogelijk maken om nauwkeurigere en volledigere schattingen te verkrijgen van de waarschijnlijkheid van causaliteit van een bepaalde variant.
Het doel van de COVAR studie (COsegregation VARiants) is het organiseren van co-segregatie studies van de VUS van de databank UMD-BRCA1/2, om de causale of niet-causale aard van deze varianten te bepalen. Om de varianten op klinische relevantie te ordenen, is een raster met 5 klassen gebruikt: 1=neutraal, 2=waarschijnlijk neutraal, 3=VUS, 4=waarschijnlijk causaal, 5=causaal. De VUS van klasse 3 en 4 komen in aanmerking voor co-segregatiestudies omdat ze niet kunnen worden gebruikt voor erfelijkheidsadvisering.
In de geselecteerde families zal het indexgeval de gezinsleden (aangetaste en niet-aangedane) uitnodigen om een monster speekselvocht af te staan om de aanwezigheid van de VUS te testen. De waarschijnlijkheid dat een VUS causaal is, wordt berekend op basis van de co-segregatiegegevens met behulp van een Bayesiaans model. De resultaten zullen worden geïntegreerd in het multifactoriële model beschreven door D. Goldgar, een model dat verschillende parameters integreert zoals aminozuurconservering, structurele impact van de variant, samen voorkomen met een pathogene mutatie, familiegeschiedenis en tumorkarakteristieken.
Studietype
Inschrijving (Geschat)
Fase
- Niet toepasbaar
Contacten en locaties
Studiecontact
- Naam: Sandrine CAPUTO, PhD
- Telefoonnummer: 33172389367
- E-mail: sandrine.caputo@curie.fr
Studie Contact Back-up
- Naam: Isabelle TURBIEZ, Project Manager
- Telefoonnummer: 33147111659
- E-mail: isabelle.turbiez@curie.fr
Studie Locaties
-
-
-
Saint-Pierre, Bijeenkomst, 97410
- Werving
- CHU Sud Réunion Saint-Pierre
-
Contact:
- Hanitra RANJATOELINA, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Hanitra RANJATOELINA, MD
-
-
-
-
-
Amiens, Frankrijk, 80054
- Werving
- CHU Amiens - Hopital Nord
-
Contact:
- Gilles MORIN, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Gilles MORIN, MD
-
Angers, Frankrijk, 49933
- Werving
- ICO - Centre Paul Papin
-
Contact:
- Marie COUDERT, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Marie COUDERT, MD
-
Angoulême, Frankrijk, 16959
- Werving
- Centre Hospitalier d'Angoulème
-
Contact:
- Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
-
Avignon, Frankrijk, 84918
- Werving
- Institut Sainte-Catherine
-
Contact:
- Hélène DREYFUS, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Hélène DREYFUS, MD
-
Besancon, Frankrijk, 25030
- Werving
- CHU Besançon
-
Contact:
- Marie-Agnès COLLONGE-RAME, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Marie-Agnès COLLONGE-RAME, MD
-
Bordeaux, Frankrijk, 33076
- Werving
- Institut Bergonie
-
Contact:
- Virginie BUBIEN, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Virginie BUBIEN, MD
-
Bordeaux, Frankrijk, 33076
- Werving
- Groupe Hospitalier Pellegrin
-
Contact:
- Julie TINAT, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Julie TINAT, MD
-
Bourges, Frankrijk, 18020
- Werving
- Centre Hospitalier Jacques Coeur
-
Hoofdonderzoeker:
- Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
-
Contact:
- Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
-
Brest, Frankrijk, 29200
- Werving
- CHU Morvan de Brest
-
Contact:
- Marc PLANES, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Marc PLANES, MD
-
Caen, Frankrijk, 14076
- Werving
- Centre François Baclesse
-
Contact:
- Pascaline BERTHET, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Pascaline BERTHET, MD
-
Chambery, Frankrijk, 73011
- Werving
- Centre Hospitalier Hôtel Dieu
-
Contact:
- Sandra FERRER, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Sandra FERRER, MD
-
Clermont-Ferrand, Frankrijk, 63011
- Werving
- Centre Jean Perrin
-
Contact:
- Mathilde GAY-BELLILE, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Mathilde GAY-BELLILE, MD
-
Colmar, Frankrijk, 68024
- Nog niet aan het werven
- Hôpital Civil de Colmar
-
Contact:
- Jean-Marc LIMACHER
-
Hoofdonderzoeker:
- Jean-Marc LIMACHER, MD
-
Dijon, Frankrijk, 21079
- Werving
- CHU de Dijon
-
Contact:
- Laurence FAIVRE-OLIVIER, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Laurence FAIVRE-OLIVIER, MD
-
Grenoble, Frankrijk, 38043
- Werving
- CHU de GRENOBLE
-
Contact:
- Clémentine LEGRAND, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Clémentine LEGRAND, MD
-
La Rochelle, Frankrijk, 17019
- Werving
- Groupe Hospitalier La Rochelle-Ré-Aunis
-
Contact:
- Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
-
Le Havre, Frankrijk, 76083
- Werving
- Hôpital Flaubert
-
Contact:
- Elodie LACAZE, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Elodie LACAZE, MD
-
Lille, Frankrijk, 59000
- Werving
- Centre Oscar Lambret
-
Contact:
- Audrey MAILLIEZ, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Audrey MAILLIEZ, MD
-
Lille, Frankrijk, 59037
- Werving
- CHRU Lille
-
Contact:
- Sophie LEJEUNE, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Sophie LEJEUNE, MD
-
Limoges, Frankrijk, 87042
- Werving
- CHU Dupuytren
-
Contact:
- Laurence Venat-Bouvet, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Laurence VENAT-BOUVET, MD
-
Lyon, Frankrijk, 69373
- Werving
- Centre Léon Bérard
-
Contact:
- Christine LASSET, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Christine LASSET, MD
-
Lyon, Frankrijk, 69229
- Werving
- Hospices Civils de Lyon
-
Contact:
- Sophie GIRAUD, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Sophie GIRAUD, MD
-
Marseille, Frankrijk, 13009
- Werving
- Institut Paoli Calmettes
-
Contact:
- Hagay SOBOL, PhD
-
Hoofdonderzoeker:
- Hagay SOBOL, PhD
-
Marseille, Frankrijk, 13385
- Werving
- CHU La Timone
-
Contact:
- Hélène ZATTARA, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Hélène ZATTARA, MD
-
Montpellier, Frankrijk, 34295
- Werving
- CHU Arnaud de Villeneuve
-
Contact:
- Isabelle COUPIER, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Isabelle COUPIER, MD
-
Nantes, Frankrijk, 44202
- Werving
- Centre Catherine de Sienne
-
Hoofdonderzoeker:
- Alain Lortholary, MD
-
Contact:
- Alain LORTHOLARY, MD
-
Nice, Frankrijk, 06189
- Werving
- Centre Antoine Lacassagne
-
Contact:
- Véronique MARI, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Véronique MARI, MD
-
Niort, Frankrijk, 79021
- Werving
- Centre Hospitalier Georges Renon
-
Contact:
- Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
-
Nîmes, Frankrijk, 30029
- Werving
- CHRU Caremeau
-
Contact:
- Jean CHIESA, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Jean CHIESA, MD
-
Orléans, Frankrijk, 45067
- Werving
- Hôpital de la Source
-
Contact:
- E COTTEREAU, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- E COTTEREAU, MD
-
Paris, Frankrijk, 75012
- Werving
- Hopital Saint-Antoine
-
Contact:
- Antoine DARDENNE, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Antoine DARDENNE, MD
-
Paris, Frankrijk, 75475
- Werving
- Hopital Saint-Louis
-
Contact:
- Odile COHEN-HAGUENAUER, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Odile COHEN-HAGUENAUER, MD
-
Paris, Frankrijk, 75013
- Werving
- Groupe Hospitalier Pitie-Salpetriere
-
Contact:
- Véronica CUSIN, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Véronica CUSIN, MD
-
Paris, Frankrijk, 75020
- Werving
- Hôpital Tenon
-
Contact:
- Clémence EVREVIN, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Clémence EVREVIN, MD
-
Paris, Frankrijk, 75908
- Werving
- HEGP
-
Contact:
- Pierre-Laurent PUIG, Phd
-
Hoofdonderzoeker:
- Pierre-Laurent PUIG, Phd
-
Poitiers, Frankrijk, 86021
- Werving
- CHU La Miletrie
-
Contact:
- Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
-
Reims, Frankrijk, 51092
- Werving
- CHU de Reims
-
Contact:
- Anne DURLACH, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Anne DURLACH, MD
-
Reims, Frankrijk, 51100
- Werving
- Institut Jean Godinot
-
Contact:
- Tan Dat NGUYEN, PHD
-
Hoofdonderzoeker:
- Tan Dat NGUYEN, PHD
-
Reims, Frankrijk, 51100
- Werving
- ICC Courlancy
-
Contact:
- Fanny BRAYOTEL, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Fanny BRAYOTEL, MD
-
Rennes, Frankrijk, 35042
- Werving
- Centre Eugene Marquis
-
Contact:
- Louise CRIVELLI, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Louise CRIVELLI, MD
-
Rouen, Frankrijk, 76031
- Werving
- CHU de Rouen
-
Contact:
- Isabelle TENNEVET, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Isabelle TENNEVET, MD
-
Saint-Herblain, Frankrijk, 44804
- Werving
- ICO - Centre René Gauducheau
-
Contact:
- Capucine DELNATTE, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Capucine DELNATTE, MD
-
Saint-Étienne, Frankrijk, 42055
- Werving
- Chu Saint Etienne
-
Contact:
- Fabienne PRIEUR, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Fabienne PRIEUR, MD
-
Strasbourg, Frankrijk, 67033
- Werving
- Institut de Cancerologie Strasbourg Europe ICANS
-
Contact:
- Philippe BOUDIER, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Philippe BOUDIER, MD
-
Strasbourg, Frankrijk, 67200
- Werving
- Hopital de Hautepierre - Hôpital Universitaire
-
Contact:
- Christine MAUGARD, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Christine MAUGARD, MD
-
Toulouse, Frankrijk, 31059
- Werving
- Institut Claudius Regaud - IUCT - Oncopole
-
Hoofdonderzoeker:
- Laurence GLADIEFF, MD
-
Contact:
- Laurence GLADIEFF, MD
-
Tours, Frankrijk, 37044
- Werving
- CHU Bretonneau
-
Hoofdonderzoeker:
- Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
-
Contact:
- Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
-
Troyes, Frankrijk, 10003
- Werving
- CH Simone VEIL
-
Contact:
- Charlotte CAILLE-BENIGNI, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Charlotte CAILLE-BENIGNI, MD
-
Valence, Frankrijk, 26953
- Werving
- Centre Hospitalier de Valence
-
Contact:
- Marie-Noëlle BONNET-DUPEYRON, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Marie-Noëlle BONNET-DUPEYRON, MD
-
Vandoeuvre les Nancy, Frankrijk, 54511
- Werving
- CHU Nancy - Hôpital Brabois
-
Contact:
- Jean-Marie RAVEL, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Jean-Marie RAVEL, MD
-
Vandoeuvre les Nancy, Frankrijk, 54511
- Ingetrokken
- Centre Alexis Vautrin
-
Villejuif, Frankrijk, 94805
- Werving
- Gustave Roussy
-
Contact:
- Olivier CARON, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Olivier CARON, MD
-
-
Haut De Seine
-
Saint-Cloud, Haut De Seine, Frankrijk, 92210
- Werving
- Institut Curie - Hôpital René Huguenin
-
Contact:
- Emmanuelle FOURME, PhD
- E-mail: emmanuelle.fourme@curie.fr
-
Hoofdonderzoeker:
- Emmanuelle FOURME, MD
-
-
Ile De France
-
Paris, Ile De France, Frankrijk, 75005
- Werving
- Institut Curie
-
Contact:
- Sandrine CAPUTO, PhD
- E-mail: sandrine.caputo@curie.fr
-
Hoofdonderzoeker:
- Dominique STOPPA-LYONNET, PU-PH
-
-
-
-
-
Pointe à Pitre, Guadeloupe, 97110
- Werving
- CHU de Pointe à Pitre
-
Contact:
- Marilyn LACKMY-PORT-LIS, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Marilyn LACKMY-PORT-LIS, MD
-
-
-
-
-
Fort de France, Martinique, 97261
- Werving
- CHU de Fort de France
-
Contact:
- Odile BERA, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Odile BERA, MD
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Beschrijving
Inclusiecriteria:
Indexzaken:
- Een persoon die een genvariant klasse 3 of 4 draagt, aanwezig en geselecteerd in de families van de nationale database van genetische groep en kanker (GGC Unicancer) die de variaties van alle genen uit het genenpanel van alle Franse laboratoria identificeert.
- Leeftijd ≥ 18 jaar.
- Ondertekende schriftelijke geïnformeerde toestemming "index case"
Gerelateerde partijen:
- Elk familielid van een indexgeval met kanker
- Elk familielid zonder kanker gerelateerd aan een indexgeval, behouden door onderzoekers, op basis van gezinsstructuur en mate van verwantschap in vergelijking met het indexgeval
- Leeftijd ≥ 18 jaar
- Informatie en handtekening van de geïnformeerde toestemming "geselecteerde familieleden"
Uitsluitingscriteria:
- minderjarigen
- Personen die van hun vrijheid zijn beroofd of onder curatele staan (inclusief curatoren).
- Afwezigheid van ondertekende schriftelijke geïnformeerde toestemming
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Primair doel: Diagnostisch
- Toewijzing: NVT
- Interventioneel model: Opdracht voor een enkele groep
- Masker: Geen (open label)
Wapens en interventies
Deelnemersgroep / Arm |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Ander: Covar
|
De speekselmonsters worden gemaakt van geselecteerd verwant (DNA).
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Tijdsspanne |
|---|---|
|
Voer de co-segregatie-analyse uit van de geselecteerde VUS in de families om het maximum aantal varianten te classificeren in termen van hun waarschijnlijkheid om pathogeen te zijn
Tijdsspanne: tot 15 jaar
|
tot 15 jaar
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Tijdsspanne |
|---|---|
|
• Een gestandaardiseerde methode voorstellen om VUS te classificeren die kan worden geïntegreerd in de reeds bestaande classificatie die is vastgelegd in de UMD-BRCA1/2-database, met de nadruk op varianten van klasse 4 (waarschijnlijk oorzakelijk) en klasse 3 (onbekende significantie).
Tijdsspanne: tot 15 jaar
|
tot 15 jaar
|
|
• Maximaliseer het aantal VUS (zowel pathogeen als neutraal) met bijbehorende aanbevelingen voor klinische behandeling van risicoverwanten die kunnen worden gebruikt om erfelijkheidsadvisering te begeleiden.
Tijdsspanne: tot 15 jaar
|
tot 15 jaar
|
|
Beoordeel de penetrantie van verschillende VUS van klasse 3 en 4 die waarschijnlijk geassocieerd zijn met een matig risico op kanker, gebruikmakend van verzamelde fenotype-/genotypegegevens over uitgebreide stambomen.
Tijdsspanne: tot 15 jaar
|
tot 15 jaar
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Onderzoekers
- Studie stoel: Dominique STOPPA-LYONNET, PU-PH, Institut Curie
- Studie directeur: Sandrine CAPUTO, PhD, Institut Curie
Publicaties en nuttige links
Nuttige links
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Geschat)
Studie voltooiing (Geschat)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Geschat)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- IC 2011-11
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .
Klinische onderzoeken op speeksel kit
-
University of MiamiWervingHypoplastisch linkerhartsyndroomVerenigde Staten
-
Merck KGaA, Darmstadt, GermanyVoltooid
-
South Dakota State UniversityUniversity of Missouri-Columbia; Ohio State University; Michigan State University; Purdue University en andere medewerkersVoltooidVoedselveiligheid | Voedingswaarde
-
Sunnybrook Health Sciences CentreVoltooidColorectale aandoeningenCanada
-
Médecins Sans Frontières, KenyaEpicentreNog niet aan het wervenHIV primaire infectie
-
University of California, Los AngelesBeëindigdCirroseVerenigde Staten
-
Tufts Medical CenterTufts UniversityWervingEmpowerment van de patiënt | Autistisch Spectrum Stoornis | Menstrueel ongemakVerenigde Staten
-
Pharmassist LtdUniversity of AthensActief, niet wervend
-
AntnorOnbekendArtrose van de knieCanada