PaCIFiC-CUPが原発不明がんを分類
2026年4月22日 更新者:Xiao-Peng Tian、Sun Yat-sen University
PaCIFiC-CUP:原発不明がんの起源を特定するための汎がん統合フィンガープリンティング分類器:多施設双方向コホート研究
この研究は、まず公共データベースからの汎癌 DNA メチル化データに対する機械学習を利用して、さまざまな種類の癌、特に原発部位を診断するための DNA メチル化分類モデル (PaCIFiC-CUP、CUP の汎癌統合フィンガープリンティング分類器) を構築することを目的としています。原発不明のがん。
目標は、がん標本の DNA メチル化パターンを分析することでがんの病理タイプを診断し、それによってその後のがんの精密な治療を導くことです。
調査の概要
研究の種類
観察的
入学 (推定)
120
連絡先と場所
このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。
研究連絡先
- 名前:Yiyang Zhang
- 電話番号:+8615652797092
- メール:zhangyy@sysucc.org.cn
研究場所
-
-
Guangdong
-
Guangzhou、Guangdong、中国、510060
- 募集
- Sun Yat-sen University Cancer Center
-
コンタクト:
- Yiyang Zhang
- 電話番号:+8615652797092
- メール:zhangyy@sysucc.org.cn
-
-
参加基準
研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。
適格基準
就学可能な年齢
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
いいえ
サンプリング方法
非確率サンプル
調査対象母集団
研究対象集団は、CUPと診断され、包含基準および除外基準を満たす患者で構成されます。
説明
包含基準:
- 患者の標本は中山大学がんセンターおよび関連協力センターから入手し、研究目的での標本の使用を許可する患者からの書面による同意を得た。
- 標準的な評価(病歴、身体検査、全血球計算、生化学、首、胸部、腹部、骨盤のコンピューター断層撮影スキャン、すべての症状領域の対象を絞った評価、病理、および免疫組織化学)の後、診断は一次診断として決定されました。部位不明の腫瘍(腺癌、扁平上皮癌、未分化癌、神経内分泌癌、肉腫などを含む)。
- 診断は参加施設で確認され、患者は全身療法を受けていた。
- 患者の完全な臨床データ、病理学データ、追跡データを取得できます。
- ECOG パフォーマンス ステータス スコア: 0 ~ 2 ポイント。
除外基準:
- 妊娠中または授乳中の女性患者。
- 腫瘍組織サンプルのサイズが小さすぎます (生検またはスライス組織で腫瘍組織が占める割合は 70% 未満です)。
- 臓器移植、または非自己(同種)骨髄または幹細胞移植の病歴。
- 過去に腫瘍の病歴があり、現在の状態は再発腫瘍である。
- 血液悪性腫瘍(リンパ腫を除く)。
- 重度の心血管疾患や脳血管疾患、敗血症、重度の外傷や火傷など、患者の生存に重大な影響を与える可能性のあるその他の疾患。
研究計画
このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
|---|
|
部位特異的治療グループ
原発不明のがんを患うこれらの患者は、DNAメチル化分類子によって予測された特定の部位と一致する部位特異的治療を受けた。
|
|
実証的治療グループ
原発不明のがんを患うこれらの患者は、DNAメチル化分類子によって予測された特定の部位と一致しない経験的治療を受けました。
|
この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
|
全生存
時間枠:診断日から何らかの原因による死亡日まで、最長 24 か月間評価
|
全生存期間とは、原発不明のがんと診断された後、特定の死因に関係なく生存する期間を指します。
|
診断日から何らかの原因による死亡日まで、最長 24 か月間評価
|
二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
|
進行なしの生存
時間枠:診断日から、最初に進行が記録された日、または何らかの原因による死亡日のいずれか早い方まで、最長 24 か月間評価されます。
|
無増悪生存期間とは、原発不明のがん患者が病気の進行の兆候や症状なしに生存し続ける期間を指します。
|
診断日から、最初に進行が記録された日、または何らかの原因による死亡日のいずれか早い方まで、最長 24 か月間評価されます。
|
協力者と研究者
ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。
スポンサー
協力者
出版物と役立つリンク
研究に関する情報を入力する責任者は、自発的にこれらの出版物を提供します。これらは、研究に関連するあらゆるものに関するものである可能性があります。
一般刊行物
- Kramer A, Bochtler T, Pauli C, Baciarello G, Delorme S, Hemminki K, Mileshkin L, Moch H, Oien K, Olivier T, Patrikidou A, Wasan H, Zarkavelis G, Pentheroudakis G, Fizazi K; ESMO Guidelines Committee. Electronic address: clinicalguidelines@esmo.org. Cancer of unknown primary: ESMO Clinical Practice Guideline for diagnosis, treatment and follow-up. Ann Oncol. 2023 Mar;34(3):228-246. doi: 10.1016/j.annonc.2022.11.013. Epub 2022 Dec 20. No abstract available.
- Paziewska A, Dabrowska M, Goryca K, Antoniewicz A, Dobruch J, Mikula M, Jarosz D, Zapala L, Borowka A, Ostrowski J. DNA methylation status is more reliable than gene expression at detecting cancer in prostate biopsy. Br J Cancer. 2014 Aug 12;111(4):781-9. doi: 10.1038/bjc.2014.337. Epub 2014 Jun 17.
- Wehmas LC, Hester SD, Wood CE. Direct formalin fixation induces widespread transcriptomic effects in archival tissue samples. Sci Rep. 2020 Sep 2;10(1):14497. doi: 10.1038/s41598-020-71521-w.
- Capper D, Jones DTW, Sill M, Hovestadt V, Schrimpf D, Sturm D, Koelsche C, Sahm F, Chavez L, Reuss DE, Kratz A, Wefers AK, Huang K, Pajtler KW, Schweizer L, Stichel D, Olar A, Engel NW, Lindenberg K, Harter PN, Braczynski AK, Plate KH, Dohmen H, Garvalov BK, Coras R, Holsken A, Hewer E, Bewerunge-Hudler M, Schick M, Fischer R, Beschorner R, Schittenhelm J, Staszewski O, Wani K, Varlet P, Pages M, Temming P, Lohmann D, Selt F, Witt H, Milde T, Witt O, Aronica E, Giangaspero F, Rushing E, Scheurlen W, Geisenberger C, Rodriguez FJ, Becker A, Preusser M, Haberler C, Bjerkvig R, Cryan J, Farrell M, Deckert M, Hench J, Frank S, Serrano J, Kannan K, Tsirigos A, Bruck W, Hofer S, Brehmer S, Seiz-Rosenhagen M, Hanggi D, Hans V, Rozsnoki S, Hansford JR, Kohlhof P, Kristensen BW, Lechner M, Lopes B, Mawrin C, Ketter R, Kulozik A, Khatib Z, Heppner F, Koch A, Jouvet A, Keohane C, Muhleisen H, Mueller W, Pohl U, Prinz M, Benner A, Zapatka M, Gottardo NG, Driever PH, Kramm CM, Muller HL, Rutkowski S, von Hoff K, Fruhwald MC, Gnekow A, Fleischhack G, Tippelt S, Calaminus G, Monoranu CM, Perry A, Jones C, Jacques TS, Radlwimmer B, Gessi M, Pietsch T, Schramm J, Schackert G, Westphal M, Reifenberger G, Wesseling P, Weller M, Collins VP, Blumcke I, Bendszus M, Debus J, Huang A, Jabado N, Northcott PA, Paulus W, Gajjar A, Robinson GW, Taylor MD, Jaunmuktane Z, Ryzhova M, Platten M, Unterberg A, Wick W, Karajannis MA, Mittelbronn M, Acker T, Hartmann C, Aldape K, Schuller U, Buslei R, Lichter P, Kool M, Herold-Mende C, Ellison DW, Hasselblatt M, Snuderl M, Brandner S, Korshunov A, von Deimling A, Pfister SM. DNA methylation-based classification of central nervous system tumours. Nature. 2018 Mar 22;555(7697):469-474. doi: 10.1038/nature26000. Epub 2018 Mar 14.
- Koelsche C, Schrimpf D, Stichel D, Sill M, Sahm F, Reuss DE, Blattner M, Worst B, Heilig CE, Beck K, Horak P, Kreutzfeldt S, Paff E, Stark S, Johann P, Selt F, Ecker J, Sturm D, Pajtler KW, Reinhardt A, Wefers AK, Sievers P, Ebrahimi A, Suwala A, Fernandez-Klett F, Casalini B, Korshunov A, Hovestadt V, Kommoss FKF, Kriegsmann M, Schick M, Bewerunge-Hudler M, Milde T, Witt O, Kulozik AE, Kool M, Romero-Perez L, Grunewald TGP, Kirchner T, Wick W, Platten M, Unterberg A, Uhl M, Abdollahi A, Debus J, Lehner B, Thomas C, Hasselblatt M, Paulus W, Hartmann C, Staszewski O, Prinz M, Hench J, Frank S, Versleijen-Jonkers YMH, Weidema ME, Mentzel T, Griewank K, de Alava E, Martin JD, Gastearena MAI, Chang KT, Low SYY, Cuevas-Bourdier A, Mittelbronn M, Mynarek M, Rutkowski S, Schuller U, Mautner VF, Schittenhelm J, Serrano J, Snuderl M, Buttner R, Klingebiel T, Buslei R, Gessler M, Wesseling P, Dinjens WNM, Brandner S, Jaunmuktane Z, Lyskjaer I, Schirmacher P, Stenzinger A, Brors B, Glimm H, Heining C, Tirado OM, Sainz-Jaspeado M, Mora J, Alonso J, Del Muro XG, Moran S, Esteller M, Benhamida JK, Ladanyi M, Wardelmann E, Antonescu C, Flanagan A, Dirksen U, Hohenberger P, Baumhoer D, Hartmann W, Vokuhl C, Flucke U, Petersen I, Mechtersheimer G, Capper D, Jones DTW, Frohling S, Pfister SM, von Deimling A. Sarcoma classification by DNA methylation profiling. Nat Commun. 2021 Jan 21;12(1):498. doi: 10.1038/s41467-020-20603-4.
- Hovestadt V, Remke M, Kool M, Pietsch T, Northcott PA, Fischer R, Cavalli FM, Ramaswamy V, Zapatka M, Reifenberger G, Rutkowski S, Schick M, Bewerunge-Hudler M, Korshunov A, Lichter P, Taylor MD, Pfister SM, Jones DT. Robust molecular subgrouping and copy-number profiling of medulloblastoma from small amounts of archival tumour material using high-density DNA methylation arrays. Acta Neuropathol. 2013 Jun;125(6):913-6. doi: 10.1007/s00401-013-1126-5. Epub 2013 May 14. No abstract available.
- Pajtler KW, Witt H, Sill M, Jones DT, Hovestadt V, Kratochwil F, Wani K, Tatevossian R, Punchihewa C, Johann P, Reimand J, Warnatz HJ, Ryzhova M, Mack S, Ramaswamy V, Capper D, Schweizer L, Sieber L, Wittmann A, Huang Z, van Sluis P, Volckmann R, Koster J, Versteeg R, Fults D, Toledano H, Avigad S, Hoffman LM, Donson AM, Foreman N, Hewer E, Zitterbart K, Gilbert M, Armstrong TS, Gupta N, Allen JC, Karajannis MA, Zagzag D, Hasselblatt M, Kulozik AE, Witt O, Collins VP, von Hoff K, Rutkowski S, Pietsch T, Bader G, Yaspo ML, von Deimling A, Lichter P, Taylor MD, Gilbertson R, Ellison DW, Aldape K, Korshunov A, Kool M, Pfister SM. Molecular Classification of Ependymal Tumors across All CNS Compartments, Histopathological Grades, and Age Groups. Cancer Cell. 2015 May 11;27(5):728-43. doi: 10.1016/j.ccell.2015.04.002.
- Sturm D, Orr BA, Toprak UH, Hovestadt V, Jones DTW, Capper D, Sill M, Buchhalter I, Northcott PA, Leis I, Ryzhova M, Koelsche C, Pfaff E, Allen SJ, Balasubramanian G, Worst BC, Pajtler KW, Brabetz S, Johann PD, Sahm F, Reimand J, Mackay A, Carvalho DM, Remke M, Phillips JJ, Perry A, Cowdrey C, Drissi R, Fouladi M, Giangaspero F, Lastowska M, Grajkowska W, Scheurlen W, Pietsch T, Hagel C, Gojo J, Lotsch D, Berger W, Slavc I, Haberler C, Jouvet A, Holm S, Hofer S, Prinz M, Keohane C, Fried I, Mawrin C, Scheie D, Mobley BC, Schniederjan MJ, Santi M, Buccoliero AM, Dahiya S, Kramm CM, von Bueren AO, von Hoff K, Rutkowski S, Herold-Mende C, Fruhwald MC, Milde T, Hasselblatt M, Wesseling P, Rossler J, Schuller U, Ebinger M, Schittenhelm J, Frank S, Grobholz R, Vajtai I, Hans V, Schneppenheim R, Zitterbart K, Collins VP, Aronica E, Varlet P, Puget S, Dufour C, Grill J, Figarella-Branger D, Wolter M, Schuhmann MU, Shalaby T, Grotzer M, van Meter T, Monoranu CM, Felsberg J, Reifenberger G, Snuderl M, Forrester LA, Koster J, Versteeg R, Volckmann R, van Sluis P, Wolf S, Mikkelsen T, Gajjar A, Aldape K, Moore AS, Taylor MD, Jones C, Jabado N, Karajannis MA, Eils R, Schlesner M, Lichter P, von Deimling A, Pfister SM, Ellison DW, Korshunov A, Kool M. New Brain Tumor Entities Emerge from Molecular Classification of CNS-PNETs. Cell. 2016 Feb 25;164(5):1060-1072. doi: 10.1016/j.cell.2016.01.015.
- Pisanic TR 2nd, Wang Y, Sun H, Considine M, Li L, Wang TH, Wang TL, Shih IM. Methylomic Landscapes of Ovarian Cancer Precursor Lesions. Clin Cancer Res. 2020 Dec 1;26(23):6310-6320. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-20-0270. Epub 2020 Aug 17.
- Muller D, Gyorffy B. DNA methylation-based diagnostic, prognostic, and predictive biomarkers in colorectal cancer. Biochim Biophys Acta Rev Cancer. 2022 May;1877(3):188722. doi: 10.1016/j.bbcan.2022.188722. Epub 2022 Mar 17.
- Liu MC, Oxnard GR, Klein EA, Swanton C, Seiden MV; CCGA Consortium. Sensitive and specific multi-cancer detection and localization using methylation signatures in cell-free DNA. Ann Oncol. 2020 Jun;31(6):745-759. doi: 10.1016/j.annonc.2020.02.011. Epub 2020 Mar 30.
- Nunes SP, Moreira-Barbosa C, Salta S, Palma de Sousa S, Pousa I, Oliveira J, Soares M, Rego L, Dias T, Rodrigues J, Antunes L, Henrique R, Jeronimo C. Cell-Free DNA Methylation of Selected Genes Allows for Early Detection of the Major Cancers in Women. Cancers (Basel). 2018 Sep 26;10(10):357. doi: 10.3390/cancers10100357.
- Moran S, Martinez-Cardus A, Sayols S, Musulen E, Balana C, Estival-Gonzalez A, Moutinho C, Heyn H, Diaz-Lagares A, de Moura MC, Stella GM, Comoglio PM, Ruiz-Miro M, Matias-Guiu X, Pazo-Cid R, Anton A, Lopez-Lopez R, Soler G, Longo F, Guerra I, Fernandez S, Assenov Y, Plass C, Morales R, Carles J, Bowtell D, Mileshkin L, Sia D, Tothill R, Tabernero J, Llovet JM, Esteller M. Epigenetic profiling to classify cancer of unknown primary: a multicentre, retrospective analysis. Lancet Oncol. 2016 Oct;17(10):1386-1395. doi: 10.1016/S1470-2045(16)30297-2. Epub 2016 Aug 27.
- Zhang Z, Lu Y, Vosoughi S, Levy JJ, Christensen BC, Salas LA. HiTAIC: hierarchical tumor artificial intelligence classifier traces tissue of origin and tumor type in primary and metastasized tumors using DNA methylation. NAR Cancer. 2023 Apr 19;5(2):zcad017. doi: 10.1093/narcan/zcad017. eCollection 2023 Jun.
- Greco FA, Lennington WJ, Spigel DR, Hainsworth JD. Molecular profiling diagnosis in unknown primary cancer: accuracy and ability to complement standard pathology. J Natl Cancer Inst. 2013 Jun 5;105(11):782-90. doi: 10.1093/jnci/djt099. Epub 2013 May 2.
- Maros ME, Capper D, Jones DTW, Hovestadt V, von Deimling A, Pfister SM, Benner A, Zucknick M, Sill M. Machine learning workflows to estimate class probabilities for precision cancer diagnostics on DNA methylation microarray data. Nat Protoc. 2020 Feb;15(2):479-512. doi: 10.1038/s41596-019-0251-6. Epub 2020 Jan 13.
研究記録日
これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。
主要日程の研究
研究開始 (実際)
2023年7月1日
一次修了 (推定)
2026年12月31日
研究の完了 (推定)
2026年12月31日
試験登録日
最初に提出
2023年11月14日
QC基準を満たした最初の提出物
2023年11月20日
最初の投稿 (実際)
2023年11月21日
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
2026年4月23日
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
2026年4月22日
最終確認日
2026年4月1日
詳しくは
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。
未知の原発腫瘍の臨床試験
-
Cairo Universityまだ募集していません