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딥 러닝을 사용한 수막종의 자동 분할 및 용적 측정

2021년 10월 13일 업데이트: Chul-Kee Park, Seoul National University Hospital

대비 강화 MRI에서 nnU-Net 기반 아키텍처를 사용한 자동화된 수막종 분할 및 용적 측정

U-Net 기반 아키텍처는 수막종을 수동으로 분할한 후 단일 기관에서 다른 환자의 500개의 조영 증강 축 방향 MR 이미지에 적용되며 이 중 50개는 테스트에 사용되었습니다. 훈련된 U-Net 기반 아키텍처에 의한 자동 분할 후 종양 체적 분석이 최종 목표입니다.

연구 개요

상태

완전한

개입 / 치료

상세 설명

U-Net 기반 아키텍처는 수막종을 수동으로 분할한 후 단일 기관에서 다른 환자의 500개의 조영 증강 축 방향 MR 이미지에 적용되며 이 중 50개는 테스트에 사용되었습니다. 이미지의 Z-isotropification과 intensity normalization으로 전처리 후, 3개의 U-Net 기반 네트워크(2D U-Net, Attention U-Net, 3D U-Net)와 3개의 nnU-Net 기반 네트워크(2D nnU-Net, Attention) nnU-Net, 3D nnU-Net)은 수막종 분할 이미지로 학습됩니다. 3D 네트워크에 적용하기 위해 시상 및 관상 이미지는 축상 이미지를 사용하여 재구성됩니다. 예측 후 trade-off인 확률함수의 cut-off는 확률밀도함수를 이용한 Gaussian Mixture Modeling 알고리즘으로 구하게 된다. 그보다 높은 확률 함수를 갖는 복셀은 최종적으로 수막종으로 예측됩니다. 종양 체적은 분할된 영역과 축상 이미지의 두께의 곱의 합으로 계산됩니다. 성능 평가를 위해 주사위 유사성 계수(DSC), 정밀도 및 재현율을 유효성 검사 데이터 세트를 위해 수동으로 분할된 복셀과 비교하여 평가합니다. 각 모델의 체적 측정 결과는 Pearson의 상관관계 분석을 통해 수동 세분화 기반 체적과 비교됩니다.

연구 유형

관찰

등록 (실제)

600

참여기준

연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.

자격 기준

공부할 수 있는 나이

18년 이상 (성인, 고령자)

건강한 자원 봉사자를 받아들입니다

아니

연구 대상 성별

모두

샘플링 방법

비확률 샘플

연구 인구

MRI로 진단된 두개내 수막종 환자가 이 연구의 연구 모집단입니다. 종양 절제술 시행 여부나 MRI 두께, 자력에 따라 본 연구에 포함할지 여부는 결정되지 않았다.

설명

포함 기준:

  • MRI로 방사선학적으로 진단된 수막종

제외 기준:

  • 18세 미만
  • 다발성 수막종
  • 안와 수막종
  • 등록 전 두개내 수막종에 대한 이전 치료

공부 계획

이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.

연구는 어떻게 설계됩니까?

디자인 세부사항

코호트 및 개입

그룹/코호트
개입 / 치료
수막종 환자
이 연구는 피험자에 대한 어떠한 개입도 포함하지 않습니다.

연구는 무엇을 측정합니까?

주요 결과 측정

결과 측정
측정값 설명
기간
지상 실측과 비교한 정확도
기간: 2020년 10월 1일부터 2021년 9월 30일까지
1차 종료점으로 U-Net 및 nnU-Net이 뇌 MR에서 수막종을 세분화하는 능력을 실측과 비교하여 조사할 것입니다. Ground truth는 두 명의 신경외과 의사가 그린 MR의 영역으로 정의됩니다. 수막종의 자동 분할 정확도는 주사위 유사성 계수, 재현율 및 정밀도로 평가됩니다.
2020년 10월 1일부터 2021년 9월 30일까지

공동 작업자 및 조사자

여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.

연구 기록 날짜

이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.

연구 주요 날짜

연구 시작 (실제)

2013년 3월 23일

기본 완료 (실제)

2021년 9월 30일

연구 완료 (실제)

2021년 9월 30일

연구 등록 날짜

최초 제출

2021년 10월 1일

QC 기준을 충족하는 최초 제출

2021년 10월 13일

처음 게시됨 (실제)

2021년 10월 26일

연구 기록 업데이트

마지막 업데이트 게시됨 (실제)

2021년 10월 26일

QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출

2021년 10월 13일

마지막으로 확인됨

2021년 10월 1일

추가 정보

이 연구와 관련된 용어

개별 참가자 데이터(IPD) 계획

개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?

아니요

IPD 계획 설명

IPD를 공유할 계획이 없습니다.

약물 및 장치 정보, 연구 문서

미국 FDA 규제 의약품 연구

아니

미국 FDA 규제 기기 제품 연구

아니

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