Evaluation of Somatic Mutation Spectrum as Biomarker for Survival Outcome in Chinese CRC
14 января 2020 г. обновлено: Ruihua Xu, Sun Yat-sen University
A Cohort Study Evaluating the Effectiveness of the Somatic Mutation Spectrum Model in CRC Prognosis and Prediction Stratification
By analyse the tissue/blood variant spectrum model using NGS, the present clinical trial aims to elucidate the genetic basis of CRC in Chinese; to establish of CRC genetic map in Chinese patients; to identification new genetic biomarkers, drug and pathways; and to subtyping for precision treatment and management for Chinese CRC patients.
Обзор исследования
Статус
Неизвестный
Условия
Подробное описание
Colorectal cancer (CRC), as one of the common malignant tumors with high morbidity and mortality, is a major health threat in China. Surgical resection is the conventional treatment for early and intermediate stage CRC, chemotherapy is the main treatment for late stage CRC.
Circulating tumor DNA (ctDNA) is tumor-derived fragmented DNA with an average size of 170bp, mixed with cell free DNA (cfDNA) of other sources in blood circulation. Although the mechanisms of its release have not been fully addressed, apoptosis and/or necrosis of tumor cells and serum exosome are considered as its main source, which makes it a genomic reservoir of different tumor clones. Also, as its half-life is up to hours, ctDNA is reflecting the most up-to-date status of tumor genome. Hence, it allows for noninvasive molecular characterization of tumors,which can be qualitative, quantitative and used for disease monitoring. The possibility of that ctDNA could be used to detect micrometastatic disease in patients received surgical resection was suggested in several studies. Using Next Generation Sequencing (NGS), Newman et al. have shown that the serum level of ctDNA was correlated with tumor progress and prognosis in NSCLC. Isaac et al. demonstrated the postoperative ctDNA level was associated with breast cancer progression, and it was more sensitive compared to CT scan for predicting the early relapse. Tie et al. examined the postoperative ctDNA level of 1046 plasma samples from a prospective cohort of 230 patients with resected stage II CRC by NGS, and their results demonstrated that recurrence happened in 79% of the patients with positive postoperative ctDNA at median follow-up of 27 months, versus 9.8% in the negative postoperative ctDNA group.
Тип исследования
Наблюдательный
Регистрация (Ожидаемый)
1500
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Места учебы
-
-
Guangdong
-
Guangzhou, Guangdong, Китай, 510060
- Рекрутинг
- Medical Oncology,Sun Yat-sen University Cancer Center
-
Контакт:
- Feng Wang, M.D,Ph.D
- Электронная почта: wangfeng@sysucc.org.cn
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
18 лет и старше (Взрослый, Пожилой взрослый)
Принимает здоровых добровольцев
Нет
Полы, имеющие право на обучение
Все
Метод выборки
Невероятностная выборка
Исследуемая популяция
Patients must have baseline evaluations performed prior to the study and must meet all inclusion and exclusion criteria.
In addition, the patient of the prospective cohort should be thoroughly informed about the study, including the study visit schedule and required evaluations and all regulatory requirements for informed consent.
The written informed consent of the prospective cohort should be obtained from the patient prior to enrollment.
The following criteria apply to all patients enrolled onto the study unless otherwise specified.
Описание
Inclusion Criteria:
Retrospective cohort:
- The patient had no previous history of tumor prior to the diagnosis of colorectal cancer.
- The tissue samples of patients were obtained from the radical(stage I-III) or palliative (stage IV) resection of colorectal cancer.
- The clinical data of patients are complete.
- The treatment record of the patients after surgery are complete, and the fellow-up data are available.
Prospective cohort:
- Patients who were diagnosed as stage IV colorectal cancer and planed to received palliative systematic chemotherapy.
- Paired 10 ml blood and tissue samples should be available
- The clinical informations of patients and definite pathological diagnosis of colorectal cancer should be obtained
- Patients agree with the group to follow-up them and provide follow-up informations
- Performance status ECOG（Eastern Cooperative Oncology Group） score ≤2
- Informed consent must be obtained from the patient
Exclusion Criteria:
Retrospective cohort:
- The patient had previous history of tumor prior to colorectal cancer surgery
- The clinical data of patients are not available
4. The date of treatment after surgery are not integrity, outcome data are not available
Prospective cohort:
- The patient received a blood transfusion within three months;
- The patient has active HIV, hepatitis B or hepatitis C infection;
- pregnant patients;
- Alcohol or drug users;
- Other situation that researchers considered might affect the results of the experiment or violate the ethics.
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
|---|
|
Retrospective cohort
Whole exome sequencing of 2500 retrospective tissue sample.
|
|
Prospective cohort
Whole exome sequencing of 500 prospectively collected tissue samples.
Panel sequencing of 451 genes of prospectively collected blood samples.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
prediction accuracy of survival rate
Временное ограничение: through study completion, an average of 5 years
|
We will use the gene mutation data and follow-up data of the patients to construct a prediction model,the accuracy of model to anticipating the 5 year survival rate of patients is the primary endpoint
|
through study completion, an average of 5 years
|
|
prediction accuracy of recurrent rate
Временное ограничение: through study completion, an average of 3 years
|
We will use the gene mutation data and follow-up data of the patients to construct a prediction model,the accuracy of model to anticipating the 3 year recurrent rate of patients is the primary endpoint
|
through study completion, an average of 3 years
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Mutation Consistency of tissue and blood sample
Временное ограничение: through study completion, an average of 3 years
|
We do NGS sequencing of both the tissue sample and blood sample of the CRC patients.
The gene mutation data will be analysis, and the percentage of same and different mutation of tissue and blood sample will be reported.
|
through study completion, an average of 3 years
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Спонсор
Следователи
- Директор по исследованиям: Ruihua Xu, MD.,PhD, Sun Yat-sen University
Публикации и полезные ссылки
Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.
Общие публикации
- Newman AM, Bratman SV, To J, Wynne JF, Eclov NC, Modlin LA, Liu CL, Neal JW, Wakelee HA, Merritt RE, Shrager JB, Loo BW Jr, Alizadeh AA, Diehn M. An ultrasensitive method for quantitating circulating tumor DNA with broad patient coverage. Nat Med. 2014 May;20(5):548-54. doi: 10.1038/nm.3519. Epub 2014 Apr 6.
- Tie J, Wang Y, Tomasetti C, Li L, Springer S, Kinde I, Silliman N, Tacey M, Wong HL, Christie M, Kosmider S, Skinner I, Wong R, Steel M, Tran B, Desai J, Jones I, Haydon A, Hayes T, Price TJ, Strausberg RL, Diaz LA Jr, Papadopoulos N, Kinzler KW, Vogelstein B, Gibbs P. Circulating tumor DNA analysis detects minimal residual disease and predicts recurrence in patients with stage II colon cancer. Sci Transl Med. 2016 Jul 6;8(346):346ra92. doi: 10.1126/scitranslmed.aaf6219.
- Garcia-Murillas I, Schiavon G, Weigelt B, Ng C, Hrebien S, Cutts RJ, Cheang M, Osin P, Nerurkar A, Kozarewa I, Garrido JA, Dowsett M, Reis-Filho JS, Smith IE, Turner NC. Mutation tracking in circulating tumor DNA predicts relapse in early breast cancer. Sci Transl Med. 2015 Aug 26;7(302):302ra133. doi: 10.1126/scitranslmed.aab0021.
- Guinney J, Dienstmann R, Wang X, de Reynies A, Schlicker A, Soneson C, Marisa L, Roepman P, Nyamundanda G, Angelino P, Bot BM, Morris JS, Simon IM, Gerster S, Fessler E, De Sousa E Melo F, Missiaglia E, Ramay H, Barras D, Homicsko K, Maru D, Manyam GC, Broom B, Boige V, Perez-Villamil B, Laderas T, Salazar R, Gray JW, Hanahan D, Tabernero J, Bernards R, Friend SH, Laurent-Puig P, Medema JP, Sadanandam A, Wessels L, Delorenzi M, Kopetz S, Vermeulen L, Tejpar S. The consensus molecular subtypes of colorectal cancer. Nat Med. 2015 Nov;21(11):1350-6. doi: 10.1038/nm.3967. Epub 2015 Oct 12.
- Rolfo C, Castiglia M, Hong D, Alessandro R, Mertens I, Baggerman G, Zwaenepoel K, Gil-Bazo I, Passiglia F, Carreca AP, Taverna S, Vento R, Santini D, Peeters M, Russo A, Pauwels P. Liquid biopsies in lung cancer: the new ambrosia of researchers. Biochim Biophys Acta. 2014 Dec;1846(2):539-46. doi: 10.1016/j.bbcan.2014.10.001. Epub 2014 Oct 16. Erratum In: Biochim Biophys Acta. 2015 Jan; 1855(1):17. Santini, Daniele [added].
- Yu SC, Lee SW, Jiang P, Leung TY, Chan KC, Chiu RW, Lo YM. High-resolution profiling of fetal DNA clearance from maternal plasma by massively parallel sequencing. Clin Chem. 2013 Aug;59(8):1228-37. doi: 10.1373/clinchem.2013.203679. Epub 2013 Apr 19.
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
1 мая 2018 г.
Первичное завершение (Ожидаемый)
1 февраля 2020 г.
Завершение исследования (Ожидаемый)
1 мая 2021 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
28 октября 2019 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
11 января 2020 г.
Первый опубликованный (Действительный)
14 января 2020 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
18 января 2020 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
14 января 2020 г.
Последняя проверка
1 января 2020 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Дополнительные соответствующие термины MeSH
- Заболевания пищеварительной системы
- Новообразования
- Новообразования по локализации
- Желудочно-кишечные новообразования
- Новообразования пищеварительной системы
- Желудочно-кишечные заболевания
- Заболевания толстой кишки
- Кишечные заболевания
- Новообразования кишечника
- Заболевания прямой кишки
- Колоректальные новообразования
Другие идентификационные номера исследования
- mutation spectrum model-CRC
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Нет
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Нет
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .