Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Analyse af gener for reparation af androgene receptorer og DNA-skade hos patienter med prostatakræft

17. september 2018 opdateret af: Medical University of Graz

Analyse af androgene receptorers akse og DNA-skade reparationsgener fra plasma-DNA (ctDNA) hos patienter med prostatakræft

I dette projekt vil vi gerne sætte fokus på kastrationsfølsom prostatacancer (CRPC). Dette er et meget varierende klinisk billede med differentierede og belastende symptomer. De kliniske parametre, der er brugt til at estimere prognosen, har indtil videre kun vist en meget begrænset valens; genetiske markører er hidtil kun sjældent blevet undersøgt.

I løbet af vores foreløbige undersøgelser var vi allerede i stand til at isolere 189 plasmaprøver fra 59 patienter med metastatisk prostatacancer. Disse prøver er fremstillet ved hjælp af yderst innovative teknikker, f.eks. "hele genomsekventering", for at få omfattende indsigt i spektret af genetiske ændringer under terapi og den tilhørende tumorudvikling. Disse resultater skal sammenlignes med det genetiske materiale fra de respektive prostatatumorer, som stammer fra tidligere operationer. Disse meget omfattende data, som vil give resultater om kopiantalændringer, mutationer og genekspression, vil tillade analyse af signalveje med hidtil uset opløsning for at øge effektiviteten af ​​målrettede terapier hos patienter og minimere byrden af ​​ikke-effektive terapibivirkninger.

Studieoversigt

Status

Ukendt

Betingelser

Detaljeret beskrivelse

Efterforskerne indsamlede 189 plasmaprøver fra 59 patienter med metastaseret CRPC behandlet med abirateron/enzalutamid. For at stratificere plasma-DNA-prøver baseret på tilstedeværelsen af ​​lav (dvs. z-score ≤5; svarer til <10 % ctDNA) i forhold til høj (z-score >5; svarer til ≥10 % ctDNA) genomisk kompleksitet i ctDNA. Forskerne brugte det modificerede Fast Aneuploidy Screening Test-Sequencing System (mFAST-SeqS), som giver et plasmabaseret markør for aneuploidi (z-score). I alt 106 plasmaprøver med en lav z-score vil kun blive evalueret med AVENIO ctDNA Expanded Kit, som er i stand til at påvise mutationer med VAF'er så lave som 0,1 %. Fra de 83 plasmaprøver med øget z-score vil der blive sekventeret med høj dækning (70x), således at både mutationer og nukleosompositioner kan udvindes fra de opnåede sekvenser. Med de andre 32 høje z-score prøver vil plasma-Seq blive udført for at etablere genom-dækkende kopinummerprofiler, og 31 prostatacancergener vil blive beriget for at screene for mutationer i disse gener.

På nuværende tidspunkt er der ingen evidens for, hvilke parametre der skal bruges til at afgøre, hvilke behandlingsmuligheder der er bedst for patienter med metastaserende prostatacancer. De foreslåede innovative teknologier, dvs. kortlægning af nukleosompositioner og genekspressionsanalyser, vil give systematiske kort over nukleosompositioner. Sekventeringen af ​​plasmaprøver med 70x vil desuden give et omfattende overblik over mutationsspektret i metastatisk prostatacancer. Ved at inkludere primære tumoranalyser vil der opnås et hidtil uset syn på prostatacancergenomudviklingen. Samlet set vil det omfattende datasæt (ændringer af kopinummer, mutationer, genekspression) tillade pathway-analyser med hidtil uset opløsning.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Forventet)

59

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiesteder

  • Østrig
      • Graz, Østrig, 8010
        • Institute of Human Genetics, Medical University of Graz

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

18 år og ældre (Voksen, Ældre voksen)

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Køn, der er berettiget til at studere

Han

Prøveudtagningsmetode

Sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Undersøgelsen omfatter mænd med dokumenteret histologisk diagnose af prostatacancer og behandling med abirateron og/eller enzalutamid.

Deltagerne blev rekrutteret på det medicinske universitetshospital i Graz.

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • forsøgspersonen har dokumenteret histologisk diagnose af prostatacancer
  • forsøgspersonen blev behandlet med abirateron og/eller enzalutamid.

Ekskluderingskriterier:

  • patienten afviser deltagelse

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Nukleosompositioneringsmønstre
Tidsramme: 3 år
Her vil prøver med øget z-score (z-score >5; svarer til ≥10% ctDNA; modificeret Fast Aneuploidy Screening Test-Sequencing System (mFAST-SeqS)) blive sekventeret med høj dækning (70x), så nukleosompositioner kan ekstraheres fra de opnåede sekvenser. Som ved TSS'er (transkriptionelt startsted), resulterer nukleosombesættelsen i forskellige læsedybdedækningsmønstre i udtrykte og tavse gener (Ulz et al., Nat Genet 2016), vil der blive genereret systematiske kort over nukleosompositioner hos definerede patienter.
3 år

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Fokale amplifikationer i ctDNA
Tidsramme: 3 år
Kortlægning (absolut antal og størrelse) af tilbagevendende fokale amplifikationer/erhvervede regioner og identifikation af drivergenerne inden for disse amplikoner ved systematisk katalogisering af gener udtrykt i fokale amplifikationer/vundne regioner. For at lette identifikation af fokale amplifikationer anvender vi meget stringente/konservative kriterier vedrørende amplikonstørrelse og gentæthed, som vi anvendte i tidligere publikationer (Ulz et al., Nat Commun 2016; Ulz, Heitzer, Speicher, Nat Genet 2016).
3 år
Prostatakræftpanel
Tidsramme: 3 år
Karakterisering af mutationsfrekvens af berigede prostatacancergener ved hjælp af plasma-Seq (dvs. AKAP9, APC, AR, ATM, BRAF, BRCA1, BRCA2, CTNNB1, EGFR, ERG, FOXA1, GNAS, GRIN2A, HRAS, KRAS, MED12, MLL, MLL2, MLL3, MLLT3, NOTCH1, NRG1, PIK3CA, PIK3RC1, PTEN, RB1, SPOP, TMPRSS2, TP53, ZFHX3).
3 år
Klinisk-patologiske karakteristika
Tidsramme: 3 år
Dokumentation af klinisk-patologiske karakteristika (PSA, NSE; blodtal; lokalisering, antal og størrelse af metastaser ved billeddannelse) inklusive tidligere og efterfølgende behandlinger. For at identificere prædiktive/prognostiske biomarkører, nyligt forekommende genomiske ændringer i plasma-DNA'et (se primært resultat og yderligere sekundære resultatmål) vil blive korreleret med resultaterne af givne terapier.
3 år
Analyser af primære tumorer
Tidsramme: 3 år
Måling af kopiantal ændringer i primære tumorer ved næste generations sekventering, dvs. SCNA-seq og RNA-Seq til sammenligning med nukleosompositionerne, se ovenfor.
3 år
Bukal swap
Tidsramme: 3 år
Forskellen mellem kimlinje vs. somatiske mutationer
3 år

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Sponsor

Medical University of Graz

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: Jochen B Geigl, Prof, MD, Institute of Human Genetics

Publikationer og nyttige links

Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.

Generelle publikationer

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

10. september 2018

Primær færdiggørelse (Forventet)

31. januar 2021

Studieafslutning (Forventet)

31. august 2021

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

17. september 2018

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

17. september 2018

Først opslået (Faktiske)

19. september 2018

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

19. september 2018

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

17. september 2018

Sidst verificeret

1. september 2018

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Nøgleord

Yderligere relevante MeSH-vilkår

Andre undersøgelses-id-numre

  • FWF Project KLI 710-B26
  • 21-228 ex 09/10 (Anden identifikator: Ethics Committee at Med Uni Graz)

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Prostatiske neoplasmer

Søg i lignende forsøg

Sponsorer og samarbejdspartnere

Medicinske tilstande

Narkotikainterventioner

CROs by country

CROs in Jordan

Betingelser

Sjældne sygdomme

Narkotikainterventioner

Kosttilskud

Sponsor / samarbejdspartnere

Placeringer

Abonner