Intestinal Microbiome and Extremes of Atherosclerosis
Studienübersicht
Status
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
Patients were phenotyped by their residual score in linear multiple regression with measured carotid plaque burden as the dependent variable and coronary risk factors were predictors. The residual score essentially represents the distance off the regression line of predicted plaque. They were grouped into three categories: Unexplained atherosclerosis (with more plaque than predicted by risk factors; residual score >2); Explained (the amount of plaque predicted by risk factors, residual score >-2 and <2); and Protected (less plaque than predicted by risk factors, residual score <-2).
DNA was extracted from stool samples in the lab of Dr. Allen-Vercoe at University of Guelph. RNA makeup of the intestinal microbiome was assessed in the lab of Dr. Gregory Gloor at Western. Plasma levels of trimethylamine n-oxide, p-cresylsulfate, hippuric acid, p-cresyl glucuronide, pheny acetyl glutamine and phenyl sulfate were measured by ultra-performance liquid chromatography coupled to quadrupole time-of-flight mass spectrometry in the lab of Dr. Bradley Urquhart at Western.
Nutrient intake over the past year was calculated at the Harvard School of Public Health from the 131 item self-reported and semi-quantitative Harvard Food Frequency Questionnaire (FFQ).
Estimated glomerular filtration rate was calculated from the Chronic Kidney Disease Epidemiological (CKD-EPI) equations.
Studientyp
Einschreibung (Tatsächlich)
Kontakte und Standorte
Studienorte
-
-
Ontario
-
London, Ontario, Kanada, N6G 2V4
- Stroke Prevention & Atherosclerosis Research Centre
-
-
Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Studienberechtigte Geschlechter
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Inclusion Criteria:
- Patients attending stroke prevention clinics and a Premature Atherosclerosis Clinic at University Hospital, London, ON, Canada,
- with measurements of carotid plaque burden and the risk factors used in the linear regression model.
- Willing to consent to the protocol approved by the Ethics board
Exclusion Criteria:
- Missing data on variables used in the regression model,
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
Intervention / Behandlung |
|---|---|
|
Unexplained Atherosclerosis phenotype
Residual score in linear regression >2
|
plasma levels of metabolites
Harvard food frequency questionnaire
amplification and sequencing of 16S rRNA gene variable regions in stool samples
|
|
Explained Atherosclerosis phenotype
Residual score in linear regression <-2, <2
|
plasma levels of metabolites
Harvard food frequency questionnaire
amplification and sequencing of 16S rRNA gene variable regions in stool samples
|
|
Protected Atherosclerosis phenotype
Residual score <-2
|
plasma levels of metabolites
Harvard food frequency questionnaire
amplification and sequencing of 16S rRNA gene variable regions in stool samples
|
Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
|
Plasma levels of metabolites in the three phenotypes
Zeitfenster: Day 1
|
Plasma levels of trimethylamine n-oxide, p-cresylsulfate, hippuric acid, p-cresyl glucuronide, pheny acetyl glutamine and phenyl sulfate
|
Day 1
|
Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
|
Bacterial profile of the intestinal microbiome
Zeitfenster: Day 1
|
Amplification and sequencing of 16S rRNA gene variable regions
|
Day 1
|
|
Effect of nutrient intake on plasma levels of metabolites
Zeitfenster: Day 1
|
Nutrient analysis from food frequency questionnaire
|
Day 1
|
|
Effect of renal function on plasma levels of metabolites
Zeitfenster: Day 1
|
eGFR from CKD-EPI equations
|
Day 1
|
Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Primärer Abschluss (Tatsächlich)
Studienabschluss (Tatsächlich)
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Schlüsselwörter
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
- 105166
Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)
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Beschreibung des IPD-Plans
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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