Intestinal Microbiome and Extremes of Atherosclerosis
Przegląd badań
Status
Szczegółowy opis
Patients were phenotyped by their residual score in linear multiple regression with measured carotid plaque burden as the dependent variable and coronary risk factors were predictors. The residual score essentially represents the distance off the regression line of predicted plaque. They were grouped into three categories: Unexplained atherosclerosis (with more plaque than predicted by risk factors; residual score >2); Explained (the amount of plaque predicted by risk factors, residual score >-2 and <2); and Protected (less plaque than predicted by risk factors, residual score <-2).
DNA was extracted from stool samples in the lab of Dr. Allen-Vercoe at University of Guelph. RNA makeup of the intestinal microbiome was assessed in the lab of Dr. Gregory Gloor at Western. Plasma levels of trimethylamine n-oxide, p-cresylsulfate, hippuric acid, p-cresyl glucuronide, pheny acetyl glutamine and phenyl sulfate were measured by ultra-performance liquid chromatography coupled to quadrupole time-of-flight mass spectrometry in the lab of Dr. Bradley Urquhart at Western.
Nutrient intake over the past year was calculated at the Harvard School of Public Health from the 131 item self-reported and semi-quantitative Harvard Food Frequency Questionnaire (FFQ).
Estimated glomerular filtration rate was calculated from the Chronic Kidney Disease Epidemiological (CKD-EPI) equations.
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
Ontario
-
London, Ontario, Kanada, N6G 2V4
- Stroke Prevention & Atherosclerosis Research Centre
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Płeć kwalifikująca się do nauki
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Inclusion Criteria:
- Patients attending stroke prevention clinics and a Premature Atherosclerosis Clinic at University Hospital, London, ON, Canada,
- with measurements of carotid plaque burden and the risk factors used in the linear regression model.
- Willing to consent to the protocol approved by the Ethics board
Exclusion Criteria:
- Missing data on variables used in the regression model,
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Unexplained Atherosclerosis phenotype
Residual score in linear regression >2
|
plasma levels of metabolites
Harvard food frequency questionnaire
amplification and sequencing of 16S rRNA gene variable regions in stool samples
|
|
Explained Atherosclerosis phenotype
Residual score in linear regression <-2, <2
|
plasma levels of metabolites
Harvard food frequency questionnaire
amplification and sequencing of 16S rRNA gene variable regions in stool samples
|
|
Protected Atherosclerosis phenotype
Residual score <-2
|
plasma levels of metabolites
Harvard food frequency questionnaire
amplification and sequencing of 16S rRNA gene variable regions in stool samples
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Plasma levels of metabolites in the three phenotypes
Ramy czasowe: Day 1
|
Plasma levels of trimethylamine n-oxide, p-cresylsulfate, hippuric acid, p-cresyl glucuronide, pheny acetyl glutamine and phenyl sulfate
|
Day 1
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Bacterial profile of the intestinal microbiome
Ramy czasowe: Day 1
|
Amplification and sequencing of 16S rRNA gene variable regions
|
Day 1
|
|
Effect of nutrient intake on plasma levels of metabolites
Ramy czasowe: Day 1
|
Nutrient analysis from food frequency questionnaire
|
Day 1
|
|
Effect of renal function on plasma levels of metabolites
Ramy czasowe: Day 1
|
eGFR from CKD-EPI equations
|
Day 1
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- 105166
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Opis planu IPD
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .