Toteutettavuustutkimus peräsuolen liman tutkimiseksi ilma-ruoansulatuskanavan syövässä. (ORI-EGI-03)

Ilmaruoansulatuskanavan (ADT) embryologinen kehitys tapahtuu yhdestä primitiivisestä kerroksesta, endodermista. Tämän kerroksen erilaistuminen johtaa epiteelin ja limakalvon histopatologisiin samankaltaisuuksiin jatkuvan yhdistetyn ontelon kautta, joka ulottuu ruokatorven yläkolmanneksesta anorektaaliseen liitoskohtaan ja sisältää maha-suolikanavan (maksa, haima, sappirakko) ja hengitysteiden (henkitorven, keuhkoputket ja keuhkot).

Aero-ruoansulatuskanavan syöpiä ovat; ei-pienisoluinen keuhkosyöpä (NSCLC), distaalinen ruokatorvi-, maha-, haima-, sappi-, ohutsuolen- ja paksusuolensyöpä. Vallitseva syöpätyyppi on adenokarsinooma, joka syntyy sisäelimiä peittävistä rauhassoluista. Näillä soluilla on kyky erittää limaa ja muodostaa ontelon sisäkalvo. Kaikki nämä syövät irrottavat soluja suoraan tai epäsuorasti maha-suolikanavaan. Ruoansulatuskanavan epiteeli uusiutuu 5-7 päivän välein, poistunut solumateriaali kulkeutuu distaalisesti ja erittyy osana ulosteita. Suurin osa keuhkojen eritteistä niellään, jolloin syntyy vuorovaikutus suolen kanssa, jota on tähän mennessä tutkittu ensisijaisesti mikrobiotan näkökulmasta.

Covid-19-pandemia on korostanut perinteisten diagnostisten reittien rasitusta, ja pandemian ensimmäisessä aallossa on pudonnut 90 % normaalista endoskopiatyömäärästä, mikä korostaa käytännön tutkimusten tarvetta, joita voidaan käyttää triage-työkaluna perusterveydenhuollossa. syrjiä henkilöitä, jotka eivät vaadi enemmän invasiivisia diagnostisia testejä. Peräsuolen liman näytteenotto on mahdollisesti houkutteleva seulontatyökalu; nopea, minimaalisesti invasiivinen, kustannustehokas, voidaan toistaa sarjassa mahdollisen prognostisen arvon saamiseksi, vaatii vain vähän laitteita tai koulutusta ja tuottaa vankkaa DNA-materiaalia uuttamista varten.

Viimeaikaiset tutkimukset ovat osoittaneet, että stabiili, hyvä määrä ja laatua paksusuolensyövästä peräisin olevaa cfDNA:ta voidaan havaita ottamalla peräsuolen limanäytteet, ja tekniikan kliiniset tutkimukset oireileville osallistujille ovat meneillään, joissa tarkastellaan peräsuolen liman käyttöä paksusuolen syöpien havaitsemiseen (ClinicalTrials.gov, NCT-tunniste: NCT04659590). Tämä julkaisematon tutkimus on luonut peräsuolen syövän genomisen profiilin peräsuolen limassa käyttämällä Next Generation Sequencing (NGS) -menetelmää, joka havaitsee geneettisiä mutaatioita ja metylaatiomuutoksia, mikä korreloi kolorektaalisen syövän kasvainbiopsioihin liittyvien dokumentoitujen geneettisten mutaatioiden kanssa. Alkioiden yhtäläisyyksistä johtuen KRAS:a ja p53:a löytyy myös muiden ruoansulatuskanavan syöpien yhteydessä. Vuonna 1983 löydetty metylaatio on kasvava epigenetiikan ala, se on nopeampaa ja kustannustehokkaampaa kuin geneettisten mutaatioiden havaitseminen ja lupaa lisääntynyttä herkkyyttä ja spesifisyyttä. Kirjallisuus ehdottaa vahvaa yhteyttä metylaatiomuutosten ja tuumorigeneesin välillä ilma-ruoansulatuskanavan syöpien välillä, mikä yksinään tai yhdessä cf-DNA-mutaatioiden havaitsemisen kanssa voisi olla merkittävä rooli varhaisessa diagnoosissa.

Tämän tutkimuksen tavoitteena on tarjota uusi käsitys peräsuolen limasta. Kirjallisuus on yksimielisesti samaa mieltä siitä, että biomarkkerien ja näytteenoton lisätutkimusta ja standardointia tarvitaan. Diagnostisten ja terapeuttisten kohteiden uudella genomisella ja epigeneettisellä ymmärryksellä on odotettavissa yksilöllisen onkologisen hoidon tulevaisuus.