Étude sur les caractéristiques de la microflore des lésions pancréatiques solides par aspiration/biopsie à l'aiguille fine guidée par échographie endoscopique

Il s'agit d'une étude observationnelle prospective. Les patients qui ont besoin d'EUS-FNA/B pour le diagnostic de lésions pancréatiques solides (cancer du pancréas, pancréatite chronique, pancréatite auto-immune, etc.) seront successivement inclus dans cette étude. Les procédures EUS-FNA/B seront accomplies de manière standard après que le site de ponction a été lavé trois fois avec 20 ml de solution saline stérile. Le tissu frais restant après avoir recueilli suffisamment d'échantillons pour le diagnostic sera stocké dans un réfrigérateur à - 80 ℃. L'ADN est extrait de tous les échantillons à l'aide du kit approprié et le séquençage du gène de l'ARNr V4 16S est effectué sur tous les échantillons. Les enquêteurs ont utilisé "Decontam" (Davis NM, et al. Microbiome 2018;6:226) afin d'identifier et de supprimer les séquences d'ADN contaminant de l'ensemble de données. Et le microbiome est analysé avec la méthodologie standard. Les chercheurs tendent à décrire les caractéristiques de la microflore des lésions pancréatiques solides et tentent de comparer les différences entre cancer et maladies bénignes.

Cette étude se déroulera en deux étapes : l'étape préliminaire, 10 patients seront inclus. Si le taux de réussite technique (extraction réussie de l'ADN et séquençage de l'ARNr 16s après élimination bioinformatique des contaminations potentielles de l'ADN via l'utilisation de 'Decontam') est supérieur à 50 %, les progrès successifs d'inclusion [l'étape principale] dureront un an .