Cartographie le risque de morsures de serpent au Ghana et au Rwanda

Introduction

La morsure de serpent de fond a été déclarée maladie tropicale négligée (NTD) par l'Organisation mondiale de la santé (OMS) en 2017, reflétant son impact mondial sur la santé publique. Plus de 95% des cas se produisent en milieu tropical, principalement dans les pays à revenu faible et intermédiaire (LMIC) en Asie du Sud, en Afrique subsaharienne et en Amérique du Sud et le plus grand fardeau incombe aux populations les plus vulnérables, y compris celles vivant dans des moins robustes Logement, travailleurs agricoles sur les revenus faibles et les enfants. On pense que l'enlèvement de morsures de serpent provoque jusqu'à 138 000 décès par an et les piqûres non mortelles entraînent un fardeau de santé considérable par l'invalidité physique, comme les cicatrices graves et l'amputation des membres, l'impact psychologique et la stigmatisation sociale, l'isolement et la perte économique résultant de ces conséquences. Pour aider à lutter contre l'impact sur la santé publique de Snakebite, qui a lancé sa stratégie enveloppant des morsures de serpent - une stratégie de prévention et de contrôle en 2019, dans un objectif ambitieux de faire de moitié la mort et le handicap de la condition d'ici 2030.

La prévention et la gestion des morsures de serpent sont un domaine en évolution. Des travaux importants sont nécessaires pour développer des traitements efficaces contre l'envevenation par toute la gamme des espèces de serpents médicalement importantes à un coût abordable pour les populations dans le besoin. Malgré ces défis, des approches pour aider à prévenir et gérer des morsures de serpent existent et peuvent être efficaces pour réduire la charge de la morsure de serpent dans les communautés à haut risque. Les activités de prévention se concentrent sur la création de connaissances au sein des communautés sur les dangers de l'enlèvement de morsures de serpent, de l'éducation concernant la façon d'éviter les serpents à la maison et au travail, y compris l'utilisation de chaussures protectrices et la promotion de l'importance de rechercher un traitement médical efficace, s'il est mordu, plutôt que de compter sur des remèdes traditionnels. Lorsqu'une personne éprouve une morsure de serpent, la gestion de la victime peut couvrir une gamme de mesures, notamment des techniques simples de premiers soins telles que l'immobilisation et l'application de bandages de pression, les soins de soutien dans un établissement médical, et, si nécessaire et disponible, un traitement avec un antiven efficace contre les espèces de serpents responsables.

Des données de haute qualité sur la charge des morsures de serpent sont essentielles pour garantir que les ressources de traitement et de prévention sont destinées aux populations les plus à risque. Cependant, ces données sont peu rapportées, la disponibilité des données particulièrement limitée entre les pays d'Afrique subsaharienne (SSA). La plupart des données sur les morsures de serpent de la SSA proviennent des enquêtes et des rapports des établissements de santé. Cependant, la morsure de serpent n'est pas largement désignée comme une condition notifiable et les données de la santé de la santé sont souvent non signalées à l'échelle nationale ou sont faites de manière incohérente. Lorsque des données sur les établissements de santé sont disponibles, ils sont susceptibles de sous-estimer le fardeau des morsures de serpent car ils ne capturent pas les nombreuses victimes de morsures de serpent n'atteignant pas les établissements de santé dans le temps ou la recherche de traitement traditionnel dans la communauté. Les enquêtes communautaires transversales de haute qualité peuvent aider à évaluer le fardeau des morsures de serpent à une échelle fine, mais très peu ont été réalisées en SSA à ce jour, et car elles nécessitent beaucoup de temps et de ressources et peuvent être difficiles à entreprendre dans des zones avec une inaccessible Terrain, infrastructure de santé faible ou instabilité politique, ils ne fournissent pas une alternative réalisable pour estimer le fardeau à l'échelle nécessaire. De meilleures données sont nécessaires pour caractériser l'épidémiologie des morsures de serpent pour éclairer les stratégies d'atténuation des risques, de prévention ou d'élimination et sans systèmes de surveillance robustes, une approche alternative pour identifier efficacement des zones à haut risque est nécessaire.

Énoncé du problème et justification de l'étude

Des estimations de haute qualité de la variation géographique du fardeau des morsures de serpent dans la SSA sont nécessaires pour plaider pour les ressources pour la prévention et la gestion des morsures de serpent, et pour les aligner sur les populations les plus à risque. Reconnaître les carences importantes dans les données de routine et les défis de compter sur les méthodes de collecte de données sur mesure, comme indiqué ci-dessus, la feuille de route de l'OMS pour mettre fin aux maladies tropicales négligées 2021-2030 stipule que de meilleures données sont nécessaires sur la distribution des risques de morsures de serpent dans des milieux à faible insour,, et à cette fin, les «nouvelles approches et outils de cartographie sont nécessaires pour obtenir une vision granulaire de l'épidémiologie de la maladie».

L'analyse spatiale et les techniques de cartographie des maladies sont de plus en plus reconnues pour leur efficacité dans l'évaluation de l'épidémiologie des MTN dans les domaines dans lesquels l'évaluation et le suivi des défis de la disponibilité des données sont confrontés à des défis de disponibilité des données. Les méthodes d'analyse spatiale aident à l'évaluation de la charge de la maladie en utilisant des informations sur des variables explicatives variant spatialement, telles que les variables géographiques, climatiques et basées sur la population, et l'évaluation de leur relation avec les données de la charge de la maladie collectées à des endroits connus. Ces données sont exploitées pour développer des modèles géostatistiques pour prédire le risque de maladie dans des emplacements non échantillonnés.

Le risque d'enveloppement de morsures de serpent est influencé par les distributions géographiques des espèces de serpents venimeuses et des populations humaines et par des facteurs affectant la probabilité et la nature de leur interaction. En tant que tels, les programmes de prévention et de gestion des morsures de serpent pourraient bénéficier de l'application des techniques d'analyse spatiale. Il existe une disponibilité limitée de données précises sur la distribution des espèces de serpents à grande échelle. Des ensembles de données détaillés de facteurs affectant l'adéquation de l'habitat des serpents, y compris les caractéristiques géographiques telles que l'altitude, les variables climatiques telles que les précipitations et la température, et les variables démographiques telles que la densité de population, la pauvreté et la distribution urbaine-rurale sont de plus en plus sophistiquées et accessibles au public. Beaucoup de ces ensembles de données comprennent également des données historiques, permettant l'évaluation des tendances temporelles. La disponibilité de ces données covariables et l'utilité des méthodes d'analyse spatiale offrent une opportunité précieuse pour exploiter les données limitées d'incidence des morsures de serpent pour développer des modèles pour prédire la variation du risque de morsures de serpent plus largement.

Ce projet vise à comprendre si l'analyse spatiale et les techniques de cartographie des maladies peuvent être utilisées pour aider à comprendre la variation géographique du risque de morsures de serpent et aider à la prédiction du risque dans les emplacements non échantillon et réduire la dépendance à l'égard des approches traditionnelles de collecte de données et la nécessité de relevés répétés à travers le continent. Il vise spécifiquement à répondre aux questions de recherche suivantes:

1. Dans quelle mesure les informations provenant des données d'incidence des morsures de serpent sont-elles couramment disponibles et des covariables référencées spatialement pour prédire la variation géographique du risque de morsures de serpent?

Pour permettre le développement de modèles géostatistiques pour prédire le risque de morsures de serpent, des données suffisantes sur l'incidence des morsures de serpent et des données environnementales sociales et naturelles de la région d'intérêt sont nécessaires. Un nombre limité d'ensembles de données existants sur le fardeau des morsures de serpent, collectés par le biais d'études communautaires et d'installations de santé précédemment menées, ont été identifiées et seront officiellement demandées pour analyse. Parallèlement à cela, il y a une disponibilité croissante de jeux de données open source de haute qualité sur des variables explicatives potentielles référencées spatialement, telles que l'environnement (y compris la couverture terrestre, l'altitude), la climatique (y compris les précipitations, la température) et la sociodémographique (y compris la pauvreté et la densité de population) Les facteurs, identifiés par la revue de la littérature, sont disponibles.

L'analyse des données historiques disponibles sur l'incidence des morsures de serpent et les variables explicatives potentielles permettra de mieux comprendre où cibler les ressources disponibles pour une collecte efficace de données primaires afin de valider ou d'affiner le modèle géostatistique.

2 Dans quelle mesure la combinaison de données primaires et secondaires peut-elle être utilisée pour valider et affiner l'analyse géostatistique, et quelle est l'utilité relative des différentes sources de données disponibles pour le développement de ce modèle géostatistique?

D'autres données de morsures de serpent à des emplacements sélectionnées seront collectées pour valider ou affiner l'évaluation de l'association entre l'incidence des morsures de serpent et les facteurs explicatifs potentiels.

Les plates-formes de collecte de données existantes seront utilisées pour collecter des données sur l'incidence des moteurs de serpent. À ce stade, une collaboration sera planifiée avec le groupe mondial de recherche sur la santé et les maladies infectieuses au Kumasi Center for Collaborative Research in Tropical Medicine (KCCR), Kumasi, pour mener des enquêtes sur les bouts de serpent ainsi que la collection de données en cours dans certains des quartiers d'étude sélectionnés. Il est également possible de collaborer avec le Rwanda Biomedical Center dans leur prochaine évaluation de la santé au niveau du village si possible dans la période d'étude. De plus, des enquêtes communautaires autonomes de serpents à des emplacements complémentaires sélectionnés seront menées.

La collecte de données supplémentaires permettra le raffinement du modèle géostatistique et améliorera l'évaluation de l'association entre le risque de morsures de serpent et les facteurs explicatifs référencés spatialement. L'objectif est de contribuer au développement d'un modèle de risque prédictif de morsure de serpent qui peut être appliqué dans les lieux de l'étude. Dans les travaux futurs, et avec des données nouvelles ou existantes, cela aurait le potentiel d'être étendu et appliqué à d'autres endroits à travers la SSA. Les résultats de ces modèles de risque prédictifs, sous forme de cartes de risque de morsure de serpent, fourniront une connaissance indispensable de la variation géographique du risque de morsures de serpent afin que les ressources de traitement et de prévention puissent être efficacement ciblées sur les populations dans le besoin.

Grâce à ce travail, une évaluation de l'utilité relative de sources de données plus facilement disponibles, telles que les données des établissements de santé et les données collectées via des plateformes d'enquête existantes, par rapport à une étalon-or (données recueillies par le biais d'enquêtes transversales communautaires) sera effectuée , de sorte que la valeur de ces sources de données dans la prédiction du risque de morsures de serpent peut être mieux comprise.

3. Les changements dans les variables environnementales telles que le climat, l'inondation et l'utilisation des terres (agriculture, routes, barrages, infrastructures de construction) affectent l'incidence de la morsure de serpent?

Des facteurs environnementaux tels que le climat, les inondations et l'utilisation des terres peuvent modifier l'habitat, la distribution et le comportement des serpents, conduisant à une probabilité accrue de contacts de serpent humain dans certaines régions. D'autres facteurs tels que l'humidité, la température, l'élévation, les précipitations et l'indice de végétation de la différence normalisée (NDVI) ont également été liés à la variation géospatiale de l'incidence des morsures de serpent, mais les preuves sont rares dans des contextes limités en ressources, y compris le Ghana et le Rwanda.

En utilisant des données environnementales naturelles et sociales open source et spatialement référencées, l'étude évaluera l'association entre les données environnementales variant dans le temps et l'occurrence des morsures de serpent pour comprendre les variations temporelles de l'incidence des morsures de serpent. Il est crucial de comprendre les variations temporelles de l'incidence des morsures de serpent car elle pourrait aider à prédire les saisons d'un risque accru de morsures de serpent et à éclairer le moment des interventions préventives. Les résultats informeraient donc pratiquement la gestion de l'environnement et l'atténuation des risques dans les zones à haut risque et contribueraient à prévoir les tendances futures de la variation spatio-temporelle de l'incidence des morsures de serpent dans les emplacements de l'étude et d'autres emplacements non échantillonnés.

4. Comment les données épidémiologiques peuvent-elles aider à la distribution appropriée de l'antivenue?

Dans un cadre géostatistique basé sur un modèle, les données épidémiologiques des enquêtes communautaires peuvent fournir des estimations fiables de la charge et du risque de morsure de serpent. En cartographiant les deux zones d'augmentation de l'incidence des morsures de serpent et en prédisant la variation saisonnière (périodes de risque accru), ces données épidémiologiques pourraient aider à identifier la variation saisonnière des points chauds où ils peuvent être une demande accrue de l'antivenue. Pour répondre à cette question de recherche, les données disponibles sur les emplacements des établissements de santé et la distribution d'Antivenom seront utilisées pour générer une carte de la stratégie actuelle pour la distribution d'Antivenom. Les cartes de risque de morsures de serpent seront comparées aux cartes de la stratégie de distribution actuelle de l'Antivenom. Ces informations guideront l'allocation et la distribution équitables de l'antivenue vers les hôpitaux dans les zones à haut risque pour améliorer les résultats des morsures de serpent.

Méthodologie de recherche

Conception de l'étude

Cette étude utilisera une conception transversale. Il comprendra une étude d'observation analytique évaluant les données quantitatives sur l'épidémiologie des morsures de serpent, la distribution spatiale de l'incidence des morsures de serpent et la stratégie de distribution de l'antivenue collectée à travers:

1. Enquêtes transversales communautaires
2. Évaluation de l'incidence des morsures de serpent grâce à une analyse des données sur les établissements de santé de routine

3. Évaluation au niveau de l'installation de la distribution antibrisée à l'échelle du pays

   Taille de l'échantillon et méthode d'échantillonnage

   Ghana Une méthode d'échantillonnage en plusieurs étapes sera utilisée pour sélectionner les unités des ménages pour la participation à l'enquête. Ceci sera mis en œuvre dans une conception hiérarchique à quatre niveaux dans l'ordre descendant comme suit: zones écologiques, districts dans les zones écologiques, zones d'énumération (EAS) dans les districts et les ménages au sein de l'EAS.

   Le Ghana est divisé en cinq zones écologiques principales. Le pays est également divisé en 16 régions géographiques, qui sont en outre segmentées en 261 districts (en particulier, 144 districts ordinaires, 111 districts municipaux et 6 districts métropolitains). À des fins d'échantillonnage pratiques, les 6 districts métropolitains seront exclus du processus d'échantillonnage car aucune morsure de serpent n'est attendue de manière réaliste dans ces domaines. Chaque district est subdivisé en Eas-An EA est défini comme la plus petite unité géographique avec des limites distinctes désignées à des fins de recensement. Le recensement de la population et du logement en 2021 a énuméré 51 917 EA, avec une moyenne d'environ 199 EAS par district.

   Sur les 255 districts restants, 20 seront sélectionnés au hasard pour s'étendre sur l'incidence brute des morsures de serpent dans les cinq zones écologiques. Tous les districts seront classés comme élevés (≥ 100), de milieu de gamme (50-99) ou bas (<50) sur la base des cas annuels de la morsure de serpent 2023. Un échantillonnage aléatoire simple sans remplacement à l'aide d'une technique de scrutin sera utilisé pour sélectionner les districts de chaque zone écologique. Pour assurer une propagation géographique à l'échelle du pays, la sélection de district ultérieure après la première sera soumise à la condition qu'ils ne sont pas contigus aux districts auparavant échantillonnés; Si cette condition n'est pas remplie, le district en question sera rejeté. Les districts du nombre de cas élevés seront suréchantillonnés pour obtenir des estimations de morsures de serpent plus précises. Un total de 8 degrés, 6 de gamme de milieu de gamme et 6 districts de comptage à faible cas seront inclus avec les allocations pour chaque zone écologique pour chaque district inclus, 25 EAS sera échantillonné au hasard à l'aide d'un générateur de nombres aléatoires, avec la liste principale de EAS dans le district comme cadre d'échantillonnage. Dans chaque EA sélectionné, 40 ménages seront sélectionnés pour la participation à l'enquête. La liste des ménages maintenue par le service statistique du Ghana sera utilisée comme cadre d'échantillonnage. Pour chaque EA incluse, un générateur de nombres aléatoires informatisé sera utilisé pour sélectionner 40 ménages à inclure dans l'enquête. Les ménages inclus dans le premier ensemble aléatoire selon lequel la participation à l'enquête décline sera remplacée par un autre ménage à partir d'une liste de secours de ménages sélectionnés au hasard non inclus dans le premier ensemble. Cette conception d'échantillonnage devrait produire un total de 20 000 ménages dans les 20 districts sélectionnés du Ghana.

   Rwanda pour le Rwanda, la méthode d'échantillonnage en plusieurs étages sera également mise en œuvre dans une conception hiérarchique à quatre niveaux dans l'ordre descendant comme suit: zones écologiques, districts dans les zones écologiques, villages au sein des secteurs et des ménages au sein des villages.

   Le Rwanda est divisé en 10 zones écologiques. Le pays est également divisé en 5 provinces, qui sont en outre segmentées en 30 districts. Les districts sont subdivisés en 416 secteurs. Cependant, en raison du chevauchement significatif des districts à travers les zones écologiques et, dans le but d'obtenir une propagation géographique adéquate, la contiguïté de certains districts sera autorisée. Chaque secteur est subdivisé en cellules et plus loin dans les villages. Le recensement de la population et du logement en 2022 a énuméré 14 837 villages.

   Douze (12) des 30 districts seront sélectionnés au hasard pour s'étendre sur l'incidence brute des morsures de serpent à travers les zones écologiques. Tous les districts seront classés comme élevés (≥ 100), de milieu de gamme (50-99) ou bas (<50) sur la base des cas annuels de la morsure de serpent 2022. Un échantillonnage aléatoire simple sans remplacement en utilisant une technique de scrutin sera utilisé pour sélectionner les districts de chaque zone écologique, permettant 4 paires contiguës de districts chevauchant différentes zones écologiques, pour réaliser une propagation géographique.

   Pour chaque district inclus, 25 villages seront échantillonnés au hasard à l'aide d'un générateur de nombres aléatoires, avec la liste principale des villages entretenus par l'Institut national des statistiques du Rwanda comme cadre d'échantillonnage. Dans chaque village sélectionné, 40 ménages seront sélectionnés pour la participation à l'enquête à l'aide d'un générateur de nombres aléatoires informatisé, avec la liste des ménages du recensement comme cadre d'échantillonnage. Les ménages inclus dans le premier ensemble aléatoire selon lequel la participation à l'enquête décline sera remplacée par un autre ménage à partir d'une liste de secours de ménages sélectionnés au hasard non inclus dans le premier ensemble. Cette conception d'échantillonnage devrait produire un total de 12 000 ménages dans les 12 districts sélectionnés au Rwanda.

   Données de routine des établissements de santé Les données des établissements de santé routinières des systèmes de gestion de l'information sur la santé dans les deux pays, couvrant les 5 à 10 ans précédentes, seront obtenus pour une analyse secondaire où des enregistrements sont disponibles.

   Procédures d'échantillonnage

   Les enquêtes sur les morsures de serpents autonomes seront menées dans des emplacements distincts et utiliseront une approche d'échantillonnage en grappes à plusieurs étapes, avec les composants suivants:

   Les districts des unités d'échantillonnage des deux pays seront sélectionnés au hasard pour s'étendre sur l'incidence des morsures de serpent, comme estimé à partir des données de santé de routine disponibles, ainsi que la couverture des covariables environnementales et sociodémographiques d'intérêt, identifiées par la revue de la littérature et l'analyse des données existantes.

   Les USU d'échantillonnage primaire (PSU) dans les districts seront basés sur les plus petites unités administratives et seront sélectionnées à l'aide d'un générateur de nombres aléatoires, avec un nombre sélectionné proportionnel à la taille de la population de district. Les estimations de la population et les PSU seront extraites des données du recensement de la population les plus récentes ou des estimations plus à jour si elles sont disponibles dans le pays. Les zones d'énumération du recensement (EA) telles que définies dans le recensement de la population et du logement seront utilisées.

   L'unité d'échantillonnage secondaire (SSUS) SSUS sera les unités ménagères. Si les listes de ménages sont uniformément disponibles, les ménages de chaque EA / EU seront sélectionnés au hasard à l'aide d'un générateur de nombres aléatoires. Si les listes des ménages ne sont pas uniformément disponibles, un échantillonnage de segments compacts sera utilisé, permettant de révisiter efficacement les ménages absents. Une unité domestique utilisera la définition suivante: une ou plusieurs personnes qui vivent dans le même complexe (clôturé ou non foncées) sont responsables du même chef et partagent une source commune de nourriture et / ou de budget / revenu commun des ménages. Un membre du ménage habituel aux fins de la liste des ménages est défini comme une personne présente dans le ménage pour plus de 50% du mois, y compris les domestiques, les logers ou les amis qui y vivent habituellement.

   Revise si le chef de ménage ou l'adulte responsable qui peut agir en leur nom n'est pas présent, une revisit sera prévue pour plus tard le même jour. S'il est possible, dans les contraintes logistiques de l'enquête, de revoir le lendemain si nécessaire, cela sera organisé.

   Si une victime de la morsure de serpent est identifiée mais absente, une revisit sera organisée comme ci-dessus. Si une revue n'est pas possible, le questionnaire sur les détails de serpent sera interrogé à un adulte responsable qui est en mesure de répondre aux questions sur l'épisode autant que possible.

   Si les participants potentiels souhaitent plus longtemps à considérer leur participation, les revisits peuvent également être programmés dans les délais décrits ci-dessus.

   Les ménages absents Si le ménage n'est pas présent lors de la première tentative ou ne revisitera pas, il sera enregistré comme un ménage absent. Les informations sur le nombre, l'âge et le sexe des membres du ménage absent seront recherchées auprès du Guide communautaire (Community Health Volunteer), qui détient des informations sur les ménages dans les villages qu'ils supervisent, et cela sera enregistré pour l'analyse du biais dans les données manque de manque.

   Le dépistage des ménages dans les enquêtes démographiques et de santé existantes, les questions de dépistage des ménages seront intégrées dans le questionnaire utilisé par l'enquête. Ces questions projeteront tous les membres du ménage pour des antécédents de morsure de serpent. Une enquête de suivi sera menée avec ceux qui signalent des antécédents de morsure de serpent.

   Dans les enquêtes autonomes des morsures de serpent, un questionnaire distinct de dépistage des ménages sera effectué pour filtrer tous les membres du ménage pour une morsure de serpent et documenter les détails sociodémographiques des ménages supplémentaires. Des questions seront posées, par des collectionneurs de données formés, au chef de ménage ou, si indisponible, un adulte responsable qui est en mesure de répondre au nom du chef du ménage, dans chaque ménage.

   Les données seront collectées à l'aide de formulaires de collecte de données préprogrammés développés sur RedCap et montés sur des tablettes.

   Questionnaire de détails sur les morsures de serpent Si une morsure de serpent est signalée, un questionnaire sur les détails des morsures de serpent sera administré avec le membre du ménage respectif (ou un représentant adulte responsable si la victime est mineure ou décédée). Dans le contexte des enquêtes en santé et démographiques existantes, ce questionnaire sera administré le même jour, s'il est possible, ou dans le cadre d'une période de suivi prévue avec des cas identifiés dans le mois suivant. Dans les enquêtes autonomes des morsures de serpent, ce questionnaire suivra immédiatement le questionnaire de dépistage des ménages, à moins que la victime ne soit absente et qu'une revisite soit demandée.

   Assurance de la qualité Les données La qualité et la cohérence des données seront assurées par la formation des collecteurs de données d'enquête dans les procédures d'enquête standard et l'administration du questionnaire. La compétence du collecteur de données sera examinée lors de la formation pendant laquelle ils doivent démontrer la capacité de mener des procédures d'enquête standardisées avant le début de l'étude.

   Lorsque des enquêtes de suivi sont menées avec des victimes de morsures de serpent, ces données seront revues régulièrement par l'IP pour la qualité et la cohérence.

   Les formulaires d'enquête seront programmés avec une sélection de réponse précodée pour minimiser l'entrée en texte libre. Le questionnaire de l'enquête subira un test pilote avec un petit groupe de répondants (15-20) pour identifier tout problème, affiner le libellé de la question et résoudre toute ambiguïté pour améliorer la clarté. Les collectionneurs de données seront formés de manière intensive sur les procédures de collecte de données, y compris le processus de consentement, l'administration de l'enquête et la gestion des questions et préoccupations des répondants. La formation comprendra des séances de jeu de rôle et des entretiens simulés pour garantir que les collectionneurs de données comprennent pleinement les questions et suivent les pratiques d'enquête standard.

   Un tableau de bord sera également créé pour suivre les progrès avec la collecte de données et aider à identifier les problèmes de qualité des données pour une résolution rapide en temps quasi réel. Les données seront examinées en continu pour les incohérences et les erreurs lors de la collecte de données. Les requêtes sur les incohérences de données, le cas échéant, seront envoyées aux collecteurs de données pour résoudre à la fin de chaque journée. Les entrées en double seront identifiées et supprimées, et toute différence ou valeurs aberrantes sera soigneusement examinée et corrigée.

   Des réunions hebdomadaires de l'équipe seront également organisées pour identifier tous les défis et discuter des solutions pour garantir la qualité globale des activités de collecte de données.

   Après la collecte de données, les procédures de vérification seront fermées et la base de données sera verrouillée pour empêcher toute autre entrée de données ou modifications sur le serveur.

   Les données d'analyse des données seront analysées à l'aide du logiciel statistique R, principalement avec le package Prevmap. Une approche géostatistique basée sur un modèle sera utilisée. L'analyse exploratoire sera d'abord menée en utilisant une régression linéaire linéaire et généralisée standard pour évaluer les associations entre les données environnementales et sociodémographiques référencées spatialement et l'incidence des morsures de serpent. Il sera également possible d'utiliser toutes les données covariables individuelles collectées dans le cadre de ces enquêtes ici, en incluant à la fois le niveau individuel et les effets au niveau du cluster. La structure spatiale des résidus de ce modèle de régression sera évaluée et les informations seront utilisées pour construire un modèle prédictif qui tient compte de cette corrélation spatiale qui n'a pas pu être supprimée par des ajustements de régression. Dans la mesure du possible, des facteurs de risque variant dans le temps seront pris en compte, par exemple, dans l'évaluation des données des établissements de santé.

   L'ajout de données de morsures de serpent nouvellement collectées auprès des enquêtes sur la communauté et les établissements de santé nécessitera une extension de l'analyse géostatistique basée sur un modèle pour affiner le modèle. Lorsque des méthodologies d'enquête comparables et des mesures de résultats sont utilisées, une modélisation conjointe peut être effectuée. Les cartes de contour de probabilité seront également produites en incorporant des estimations de vraisemblance qui indiquent la probabilité d'incidence dépassant un seuil défini.

   La précision relative de chaque source de données et méthode de collecte de données sera comparée pour leur valeur dans l'évaluation de l'incidence des morsures de serpent, les enquêtes échantillonnées en grappe considérées comme l'étalon-or, pour mieux comprendre la manière la plus efficace dont ces sources de données peuvent être utilisées dans la Prédiction précise du risque de morsures de serpent.

   Validation du modèle La validation interne du modèle prédictif sera réalisée à l'aide d'ensembles de données simulés pour évaluer la précision prédictive du modèle géostatistique. Le modèle prédictif sera validé à l'extérieur à l'aide des données des sites sentinelles nouvellement échantillonnés couvrant les niveaux de risque. Lorsque les données deviennent disponibles à partir d'études en dehors de la région étudiée, elles seront utilisées pour tester la généralisabilité du modèle.

   La gestion des données manquantes des données manquantes sera analysée pour évaluer si elle peut avoir conduit à un biais en termes de distribution démographique de l'échantillon d'enquête. Si les détails de la taille absente des ménages et de l'âge / sexe des membres du ménage étaient disponibles, cela sera comparé à l'échantillon inclus. Si ces données ne sont pas disponibles, l'échantillon inclus sera comparé à la distribution démographique de la population du comté conformément au recensement le plus récent.

   Conseils éthiques et réglementaires Cette étude sera menée conformément aux principes éthiques énoncés dans la déclaration d'Helsinki et de bonne pratique clinique (GCP) et tous les chercheurs de l'étude devront avoir une formation à jour en GCP.

   Le protocole d'étude sera soumis à l'examen par des comités d'éthique de la recherche au Royaume-Uni et les pays d'étude et l'approbation sera demandée avant le début de l'étude dans le pays respectif.

   Revue du comité d'éthique de la recherche (REC) Avant le début de l'étude, l'approbation sera demandée au comité d'éthique de la recherche de la Liverpool School of Tropical Medicine (LSTM) au Royaume-Uni pour le protocole d'étude, des formulaires de consentement éclairés et d'autres documents d'étude. Nous fournirons au Sponsor LSTM et au Comité d'éthique de la recherche un rapport annuel, dû chaque année à la date d'approbation initiale, et un rapport de fin d'étude une fois toutes les activités terminées.

   L'approbation équivalente du Rec sera également recherchée dans les pays collaborateurs:

   Au Ghana, l'approbation éthique sera demandée par le biais du comité d'examen de l'éthique des services de santé du Ghana. Une demande d'éthique sera soumise pour couvrir toutes les activités de collecte de données. Au Rwanda, l'approbation de l'éthique sera demandée par le biais du Rwanda National Ethics Committee.

   Amendements du protocole Nous nous assurerons que la recherche ne s'écarte pas du protocole décrit. Si une déviation de protocole se produit, nous soumettrons des modifications aux autorités LSTM et dans le pays pour approbation.

   Diffusion et application des résultats à la fin de l'étude, les données seront analysées et un rapport d'étude final préparé. Les résultats des enquêtes communautaires seront officiellement partagés avec les partenaires de recherche et les parties prenantes locales (y compris les dirigeants communautaires et les représentants des soins de santé) pour diffuser les communautés des participants après la fin de l'analyse par le biais d'ateliers en ligne ou en personne.

   Les résultats de l'étude seront soumis dans des articles de recherche dans des revues examinées par des pairs et pour la présentation lors de conférences scientifiques appropriées. Le chercheur principal assumera la responsabilité de la publication; La publication reconnaîtra les participants, le personnel et l'organisme de financement dont la contribution a permis de terminer l'étude.