Scoperta di potenziali biomarcatori del cancro al seno Amp; Possibili bersagli farmacologici utilizzando la spettrometria di massa quantitativa avanzata
Lo scopo di questo studio è valutare l'uso della spettrometria di massa quantitativa avanzata (Super SILAC) come piattaforma di scoperta per scoprire nuovi biomarcatori proteici nel tumore e confrontare il profilo proteico tra diversi sottotipi di carcinoma mammario (ER positivo, HER2 positivo, triplo negativo). Verrà ottenuto un massimo di 100 campioni di tumore al seno dal repository di tessuti NUHS, comprendente una percentuale approssimativamente uguale di tumori ER positivi, HER2 positivi e tripli negativi. I campioni saranno analizzati utilizzando la spettrometria di massa avanzata (Super SILAC) come piattaforma di scoperta per identificare nuovi biomarcatori proteici che potrebbero essere importanti nel cancro. DNA e RNA saranno anche estratti da campioni tumorali per l'analisi correlativa con i dati di proteomica. I dati di genomica e proteomica saranno correlati con i dati clinici, inclusi i dati di risposta al trattamento e di sopravvivenza. Importanza della ricerca proposta per la scienza o la medicina: l'identificazione dei biomarcatori tumorali può consentire una migliore prognosi, follow-up e selezione del trattamento per i malati di cancro in futuro. Potenziali benefici e rischi: nessun beneficio diretto per il paziente. Il rischio per i soggetti è minimo in quanto non vi è alcun contatto diretto con il paziente e l'analisi viene eseguita su campioni tumorali precedentemente donati. I pazienti hanno precedentemente fornito il consenso a donare i propri campioni per la ricerca nel repository di tessuti NUHS.
Nuovi biomarcatori tumorali che determinano la biologia del tumore, inclusa la prognosi e la sensibilità al trattamento, possono essere rilevati utilizzando il nuovo metodo avanzato di spettrometria di massa quantitativa (Super SILAC). Diversi sottotipi di tumori al seno avranno diversi profili proteomici analizzati utilizzando super SILAC.
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Tipo di studio
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
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Singapore, Singapore
- Reclutamento
- Nationa University Hospital
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Contatto:
- Soo Chin Lee, MBBS, MRCP
- Numero di telefono: +65 6779 5555
- Email: Soo_Chin_Lee@nuhs.edu.sg
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
- Bambino
- Adulto
- Adulto più anziano
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Pazienti con cancro al seno
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
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Valutare l'uso della spettrometria di massa quantitativa avanzata (Super SILAC) come piattaforma di scoperta per scoprire nuovi biomarcatori proteici nel tumore
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SILAC è un metodo di spettrometria di massa quantitativa avanzata che consente l'analisi dell'intero proteoma in modo completo quanto l'analisi del trascrittoma.
Consente la quantificazione dell'intero proteoma, la misurazione delle modifiche post-traduzionali e la mappatura dell'interattoma completo di una proteina.
Super-SILAC, un miglioramento del metodo SILAC, consente il confronto delle quantità di centinaia o migliaia di proteine di un particolare tessuto tra diversi pazienti.
Questa tecnologia potrebbe consentire la scoperta di nuovi marcatori proteici tumorali che potrebbero essere importanti nella progressione del tumore e nella risposta al trattamento.
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Collaboratori e investigatori
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- Geiger T, Cox J, Ostasiewicz P, Wisniewski JR, Mann M. Super-SILAC mix for quantitative proteomics of human tumor tissue. Nat Methods. 2010 May;7(5):383-5. doi: 10.1038/nmeth.1446. Epub 2010 Apr 4.
- Neubert TA, Tempst P. Super-SILAC for tumors and tissues. Nat Methods. 2010 May;7(5):361-2. doi: 10.1038/nmeth0510-361. No abstract available.
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Termini relativi a questo studio
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Altri numeri di identificazione dello studio
- 2012/00106
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