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ON-treatment Single-cell Analysis for the Identification of Early Tumor Response Biomarkers on Prospective Collected Serial Tumor Biopsies in Triple Negative Breast Cancer Patient During Standard Neoadjuvant Chemo-immunotherapy (ONSET)

19 maggio 2026 aggiornato da: Giulia Viale, IRCCS San Raffaele

This study explores early breast cancer, focusing on triple-negative and high-risk luminal subtypes. It combines single-cell RNA sequencing and spatial imaging of tumor samples collected at different time points during treatment. The aim is to better understand how cancer cells and immune cells interact and to identify biomarkers that can predict whether a patient will respond to chemo-immunotherapy or develop resistance.

The study assumes that early molecular and spatial changes at the single-cell level can predict treatment response. This knowledge could help doctors adapt therapies, avoiding unnecessary treatment while improving effectiveness. The project seeks to reveal, for the first time, how cellular diversity and spatial relationships contribute to treatment resistance and disease progression.

Tumor samples will be analyzed before treatment, after the first treatment cycle (C1D1), and at surgery. Only the biopsy taken after C1D1 is collected specifically for this study; all other samples come from routine clinical care.

Panoramica dello studio

Stato

Non ancora reclutamento

Condizioni

Intervento / Trattamento

Descrizione dettagliata

This exploratory translational study investigates early breast cancer (EBC), focusing on triple-negative (TNBC) and high-risk luminal (ER+/HER2-) subtypes. By integrating single-cell RNA sequencing, using the 10x Genomics platform (or similar technologies if it will be not available at the time of experiment), and spatial imaging analyses from serial tumor biopsies, the project aims to characterize tumor-immune interactions and identify predictive biomarkers of response or resistance to neoadjuvant chemo-immunotherapy.

We hypothesize that early molecular and spatial features, when detected at the single-cell level, can predict treatment sensitivity or resistance. This would enable adaptive therapeutic strategies that minimize overtreatment while maximizing efficacy in EBC. Our goal is to reveal, for the first time, the cellular heterogeneity and spatial interactions that drive therapy resistance and disease progression.

The analysis will be performed on tumor biopsies collected before the start of treatment, after C1D1 and on surgical material. The only tissue sample collected specifically for the study is the biopsy after C1D1.

Tipo di studio

Interventistico

Iscrizione (Stimato)

55

Fase

  • Non applicabile

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Contatto studio

Luoghi di studio

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

  • Adulto
  • Adulto più anziano

Accetta volontari sani

No

Descrizione

Inclusion Criteria:

  1. Female patients aged ≥18 years.
  2. ECOG performance status 0-1.

  3. Histologically confirmed early breast cancer with one of the following molecular profiles:

    • TNBC: ER and PR negative (IHC <10%) and HER2 negative (IHC 0-1+ or FISH non-amplified).
    • High-risk luminal (ER+/HER2-): ER positive (IHC ≥10%) HER2 negative (IHC 0-1+ or FISH non-amplified), with high-risk features (e.g., Grade 3, PR-negative, high proliferation, high TILS).

  4. Clinical indication for neoadjuvant treatment according to standard practice:

    • TNBC: cT1c and/or cN positive, or cT2 (>2 cm) and/or cN positive (stage II,III).
    • High-risk luminal: features as defined above (Grade 3, PR-negative, high proliferation, ER low).
  5. Ability to understand and sign written informed consent for participation in the study, approved by the local Ethics Committee.

Exclusion Criteria:

  1. HER2-positive tumors.
  2. Multifocal tumors - exclusion if a single index lesion cannot be identified and sampled; otherwise allowed if a representative lesion can be biopsied.
  3. Known metastatic disease. 4 Clinical contraindications to the planned neoadjuvant therapy.

5. Decision for upfront surgery as determined by the multidisciplinary team. 6. Inability to provide informed consent. 7. Pregnancy or breastfeeding. 8. Prior systemic therapy (chemotherapy, immunotherapy, or endocrine therapy) for the current breast cancer before baseline biopsy 9. On-treatment biopsy clinically not feasible or controindicated

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

  • Scopo principale: Altro
  • Assegnazione: N / A
  • Modello interventistico: Assegnazione di gruppo singolo
  • Mascheramento: Nessuno (etichetta aperta)

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
To characterize the dynamic changes in tumor and immune cell populations in TNBC and to prospectively collect serial samples from high-risk luminal (ER+/HER2-) breast cancer patients.
Lasso di tempo: Pre-treatment, on-treatment (after first cycle of therapy), and post-treatment (surgery or residual disease)
Gene expression levels per single-cell and relative cell clustering (%) by comparing pre-treatment, on-treatment (after first cycle of standard of care neoadiuvant therapy), and post-treatment (surgery or residual disease)
Pre-treatment, on-treatment (after first cycle of therapy), and post-treatment (surgery or residual disease)

Altre misure di risultato

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
To correlate single-cell gene expression data with pCR and RD to identify predictive signatures of therapy response
Lasso di tempo: Across all collected timepoints (baseline, after C1 of neadiuvant standard of care therapy and at surgery)
pCR and RD will be evaluated across all collected timepoints (baseline, after C1 of neadiuvant standard of care therapy and at surgery)
Across all collected timepoints (baseline, after C1 of neadiuvant standard of care therapy and at surgery)

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Sponsor

IRCCS San Raffaele

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Stimato)

1 settembre 2026

Completamento primario (Stimato)

1 settembre 2028

Completamento dello studio (Stimato)

1 marzo 2029

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

8 maggio 2026

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

18 maggio 2026

Primo Inserito (Effettivo)

19 maggio 2026

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

22 maggio 2026

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

19 maggio 2026

Ultimo verificato

1 maggio 2026

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Parole chiave

Termini MeSH pertinenti aggiuntivi

Altri numeri di identificazione dello studio

  • ONSET

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

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