関節リウマチにおける経口メタゲノムバイオマーカー
関節リウマチ (RA) は、米国で 200 万人が罹患している、重度の可能性がある慢性の自己免疫疾患です。 自己免疫病因の調節における環境要因の役割は明確に説明されていますが、特定の作用機序はまだよくわかっていません。 自己免疫疾患の発症に粘膜表面の微生物叢が関係していることを示す証拠が増えています。 さまざまな研究で、RA と歯周病が明確に関連付けられています。 後者は、口腔細菌ポルフィロモナス・ジンジバリスを含む赤色複合体に関連しています。 それでも、RAに関連するP.ジンジバリス(および他の口腔細菌)の特定のマーカーがあるかどうかを判断するための、RAの口腔微生物叢の体系的な分析は行われていません。
この研究では、研究者は、(i) 生物製剤治療前の早期 RA 患者、および (ii) RA 患者のサブセットから得られた口腔サンプルから分離された DNA の口腔微生物組成 (マイクロバイオーム) および遺伝子含有量 (メタゲノム) を特徴付けます。抗TNF-α療法に反応するか反応しないか。 この研究の革新的な側面は、口腔細菌種の同定を超えて、これらのグループに関連する菌株と遺伝子のレベルにまで及んでいます。 全体的な仮説は、自己免疫および自己免疫疾患の発症に影響を与える口腔微生物の多様性が個人間に存在するというものです。
調査の概要
状態
状態
条件
条件
介入・治療
介入・治療
詳細な説明
これは、この新しいコラボレーションを確立するための、異なるが補完的な分野の 5 人の研究者による学際的な調査研究です。 リウマチ専門医、歯科医、口腔生物学者、および免疫学、微生物学、ゲノミクスの専門知識を持つ感染症の専門家の協力に基づいて、このプロジェクトから得られる情報には高い翻訳の可能性があります。 簡単に言えば、RA参加者はリウマチ専門医によって募集されます。 研究対象の 2 つのグループに対して、合計 100 人の参加者が募集されます。 RAの被験者の1つのグループと他のグループは健康なコントロールになります。 これらの 2 つのグループは、研究への参加のために次のグループに分けられます。 . グループ2は、2つ以上のTNFアンタゴニストに抵抗性であるRAと同じ年齢および性別の25人の被験者と比較される、一次抗TNF療法に反応する25人のRA成人被験者からなる。 参加者は、フロリダ大学デンタルクリニック研究ユニットでの調査研究訪問が予定されています。 検査中、次のことが行われます: 多次元健康評価アンケート (MDHAQ)、歯科検査、唾液の収集、および歯肉上のさまざまな歯の表面から歯垢が除去されます。
歯肉縁上は、ゲノミクス ラボでディープ シーケンスにかけられます。 2 つの特定の目的をテストするには: 1) 16S RNA データに基づく口腔マイクロバイオーム プロファイルが RA の発症または特定の治療への反応に関連しているという仮説をテストすること、および 2) 特定の遺伝子、バリアント、および機能的能力(メタゲノム)は、RAまたは治療反応に関連しています。 このパイロット研究が完了すると、研究者は細菌のバイオマーカーを体系的に特定します (例: 種、亜種、遺伝子) は、RA と相関し、疾患治療の潜在的な標的として役立つ可能性があります。 これらのマーカーは、将来の研究で RA 治療の新しい薬物標的として開発される可能性があります。
研究の種類
研究の種類
入学 (実際)
入学
連絡先と場所
研究場所
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Florida
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Gainesville、Florida、アメリカ、32610
- University of Florida College of Dentistry-Periodontics
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Gainesville、Florida、アメリカ、32611
- Randall Malcom VA Medical Center
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参加基準
適格基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 少なくとも 10 本の天然の無冠歯 (第 3 大臼歯を除く) が存在する必要があります。
除外基準:
- 歯が10本未満;
- 歯科治療の前に抗生物質の予防が必要な患者を含め、過去3か月以内に抗生物質で治療された;
- 免疫力が低下している個人 (HIV、エイズ、免疫抑制薬物療法);
- ウォッシュアウト期間の開始の1週間前または研究期間中に、歯科用製品の使用を含む別の臨床研究に参加します。と
- -インフォームドコンセントを提供したくない、または提供できず、収集の指示に従う。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 観測モデル:ケースコントロール
- 時間の展望:断面図
グループ/コホートの数
コホートと介入
グループ/コホートグループ/コホート |
介入・治療介入・治療 |
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RA - 生物学的製剤にナイーブ
このグループは、生物製剤で治療されていない(生物製剤未使用の)25人の関節リウマチ(RA)の成人被験者で構成されます。
検査中、次のことが行われます: 多次元健康評価アンケート (MDHAQ)、歯科検査、唾液の収集、および歯肉上のさまざまな歯の表面から歯垢が除去されます。
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すべての参加者は、歯肉縁上のためにさまざまな歯の表面から歯垢を除去します。
RAグループは、身体機能、痛み、および全体的な状態に関する多次元健康評価アンケート(MDHAQ)を受け取ります。
他の名前:
参加者全員が唾液を採取します。
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ヘルシーコントロール
このグループは、25 人の成人被験者で構成されます。これらは、25 人の生物学的製剤に対するナイーブと同じ世帯のメンバーからの健康なコントロールであり、同じ年齢です。
検査中、次のことが行われます: 歯科検査、唾液の採取、および歯肉上のさまざまな歯の表面から歯垢が除去されます。
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すべての参加者は、歯肉縁上のためにさまざまな歯の表面から歯垢を除去します。
参加者全員が唾液を採取します。
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抗TNFに反応するRA
このグループは、一次抗TNF-α療法に反応した関節リウマチ(RA)の25人の成人被験者で構成されます。
検査中、次のことが行われます: 多次元健康評価アンケート (MDHAQ)、歯科検査、唾液の収集、および歯肉上のさまざまな歯の表面から歯垢が除去されます。
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すべての参加者は、歯肉縁上のためにさまざまな歯の表面から歯垢を除去します。
RAグループは、身体機能、痛み、および全体的な状態に関する多次元健康評価アンケート(MDHAQ)を受け取ります。
他の名前:
参加者全員が唾液を採取します。
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抗TNFに反応しないRA
このグループは、2つ以上の抗TNF-α療法に耐性があり、抗TNFグループに反応するRAと同年齢の関節リウマチ(RA)の25人の成人被験者で構成されます。
検査中、次のことが行われます: 多次元健康評価アンケート (MDHAQ)、歯科検査、唾液の収集、および歯肉上のさまざまな歯の表面から歯垢が除去されます。
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すべての参加者は、歯肉縁上のためにさまざまな歯の表面から歯垢を除去します。
RAグループは、身体機能、痛み、および全体的な状態に関する多次元健康評価アンケート(MDHAQ)を受け取ります。
他の名前:
参加者全員が唾液を採取します。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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口腔マイクロバイオームは、RAとの関連性のために各グループでカタログ化されます。
時間枠:1日目
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ウィルコクソン順位和検定は、各プロファイルで計算され、グループの各ペア(RA患者とコントロール)間のメタゲノム遺伝子含有量の違いを特定します。
RA患者の口腔微生物叢におけるKEGGオルソログおよびエッグノッグオルソロググループマーカーの潜在的な微生物機能的役割も評価されます。
すべての結果は、誤発見率アプローチを使用した複数のテストで修正されます。
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1日目
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グループ間の口腔細菌マーカーを見つけるために、メタゲノム解析が行われます。
時間枠:18ヶ月
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ウィルコクソン順位和検定は、各プロファイルで計算され、各グループ間の異なるメタゲノム遺伝子含有量を特定します。
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18ヶ月
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協力者と研究者
協力者
協力者
捜査官
捜査官
- 主任研究者:Michael R Bubb, MD、University of Florida
- 主任研究者:Edward K Chan, Ph.D.、University of Florida
研究記録日
主要日程の研究
研究開始
研究開始
一次修了 (実際)
一次修了
研究の完了 (実際)
研究の完了
試験登録日
最初に提出
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (見積もり)
最初の投稿
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
投稿された最後の更新
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
その他の研究ID番号
その他の研究ID番号
- IRB201500286
- 11712325 (その他の助成金/資金番号:Department of Defense)
- 12.420 (その他の助成金/資金番号:Department of Defense)
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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