高グレード軟部肉腫の遺伝的およびテロメア特性

目的

研究者らは、次の目的で 2 年間のパイロット観察研究を計画しています。

• 軟部組織肉腫 (STS) の場合の循環細胞非含有 DNA (cfDNA) を特定して定量化する
• STS のテロメア維持メカニズム (TMM) を調査します。
• TMM 関連の遺伝子変異を使用して、腫瘍切除時および追跡調査全体を通じて STS 内の腫瘍由来の cfDNA を特定および定量します。
• 上記の腫瘍由来の cfDNA の特徴を経時的に追跡し、臨床転帰と相関させて、潜在的な STS バイオマーカーを特定します。 仮説 他のがんでの所見に基づいて、STS の場合には血漿 cfDNA が検出可能であるという仮説が立てられています。 がん細胞の発生においてテロメア長の維持が重要な役割を果たすことを考慮して、研究者らはまた、TMM関連変異が腫瘍由来のcfDNAに存在し、STS組織の安定したマーカーとして機能し、したがって局所再発または転移性疾患が発生するにつれて濃度が増加すると仮説を立てている。

腫瘍由来の cfDNA の同定 0 ～ 3 か月以内に、既知の腫瘍特異的変異を標的とする高感度アッセイが開発されます。 研究者らは、遡及的に収集した組織にこれらを使用して、STS 患者の血漿中で cfDNA が検出 (および定量) できることを検証します。

STS 組織における TMM の分析 3 ～ 12 か月で、将来的に採取されたすべてのサンプルからの腫瘍サンプルが分析され、STS 内でどの TMM が活性化されているかが確認されます。 テロメラーゼおよび ALT 活性はそれぞれ、公開されている検査技術によって評価されます。

TMM 関連変異 / 腫瘍由来 cfDNA の定量化と特性評価 10 ～ 12 か月以内に、STS で最も蔓延していることが判明した TMM 関連変異を同定するための定量的ポリメラーゼ連鎖反応ベースのアッセイが開発されます。 12～22か月目に、これらのアッセイは、手術時および経過観察期間中、将来的に採用されるすべての患者から採取された血漿サンプル中のTMM関連変異（したがって腫瘍由来のcfDNAも）を特定および定量するために使用されます。

cfDNA 特性と臨床転帰との相関 22 ～ 24 か月目の cfDNA 濃度、腫瘍由来 cfDNA 濃度、およびその両方の遺伝的特徴が、局所再発、転移再発、死亡などの臨床転帰測定値と相関し、これらの特性が将来のバイオマーカーとしての可能性を判断します。 。

患者の募集/サンプル収集 患者は、East Midlands Sarcoma Service を通じて募集されます。 すでに入手可能なサンプルは、STS で cfDNA が検出できることを検証するために 2 つのソースから収集されます。まず、転移性疾患を持つ 20 人の患者に、組織学的分析後にすでに保管されている腫瘍組織の遡及的分析に同意するよう求められます。 これらの患者からは分析のために血液サンプルも 1 つ採取されます。 次に、ノッティンガム健康科学バイオバンク (ノッティンガム市立病院) にすでに保管されているすべての STS サンプルと、付随する血漿サンプル (執筆時点で 15) が分析されます。

研究者らは、0～22か月間の残りの分析のために、局所的に計画的切除を受けている非転移性高悪性度STS患者に参加を呼びかける。 2013 年の数字は、100 人を超える患者が対象となることを示唆しています。 腫瘍組織、血液、および影響を受けていない筋肉および唾液（コントロール DNA の 2 つのソース）が切除時に収集されます。 採用が終了するまで、繰り返しの血液サンプルが月に 3 回収集されます。