ネオアジュバント化学療法を受けた乳がんのリアルタイム分子解析 (NEO-R)

乳がん (BC) は、フランスにおける主要な公衆衛生上の問題であり、発生率が増加しており、2017 年には約 60,000 人の新規症例と 12,000 人の死亡が推定されています。 近年の生存率の改善にもかかわらず、化学療法 (CT) への耐性は BC における最重要課題のままです。 ネオアジュバントキミオセラピー (NAC) は現在、トリプルネガティブ (TN) や HER2+ 腫瘍など、手術可能だが攻撃的な BC の女性にますます使用されています (Pusztai et al, Lancet Oncol 2019)。 これには、少なくとも 3 つの利点があります。i) 保存的手術を承認する腫瘍減量、ii) TN 患者へのカペシタビンの送達による、病理学的反応に応じた補助全身療法の調整 (Masuda N. et al, N Engl J Med. 2017) およびHER2+ 患者における T-DM1 (von Minckwitz G et al., N Engl J Med. 2019)、病理学的完全奏効 (pCR) がない場合、および iii) 化学療法抵抗性の分子メカニズムを調査するためのリソースを提供します。 現在の標準的な NAC レジメンは、アントラサイクリンとタキサン (および HER2+ の場合はトラスツズマブ) の連続的な関連付け (Huober & von Minckwitz, Breast Care 2011) と、病理学的評価で浸潤癌が残存していないこととして定義される pCR の達成に基づいています。手術標本 (切除された乳房標本およびサンプリングされた同側リンパ節 (すなわち、AJCC 病期分類システムにおける ypT0/Tis ypN0)) は予後良好な特徴です; pCR のない患者は高い再発リスク (TN の約 50% およびHER2+ サブタイプ)。

これらの患者の治療効率を改善する上での主なボトルネックは、NAC に対する耐性に効果的に関与する候補の特定、関連モデルおよび予測モデルでの検証、および代理マーカーからの検出です。 もちろん、耐性患者（pCRなし）と感受性患者（pCR）の間、またはペアになったNAC後サンプルとNAC前サンプルの間で、NAC前のサンプルで示差的に表される分子変化の検索により、抵抗性に関与する候補が明らかになる可能性があります（「先天性」）。 」および「後天性安定」)、ただし、NAC 中に発生する可逆性 (「後天性可逆性」) であり、切除された標本では識別されない (Echeverria GV, Sci Transl Med 2019) 可能性があるが、分析によってのみ識別可能な変化は無視します。 NACレジメン中の一連のサンプルの、臨床診療では困難で外傷性です。

現在のプロジェクトは、NAC に適格な BC 患者における薬剤耐性の強力な候補を特定することを目的としています。 その独創性は、3 つの異なる補完的な前向きアプローチの組み合わせに基づいています: NAC の前後にサンプリングされた生検の分子分析から、NAC に対する患者の反応を模倣する in vitro BC 患者由来オルガノイド (PDO) から、および循環腫瘍細胞 (CTCs) から) NAC の前/中/後に分離されます。 このプロジェクトは、最先端の技術 (少量の生物学的材料からの RNA および DNA シーケンシング、希少なサブセット/単一細胞の分離、およびマルチオミクス分析) を革新的なモデル (乳房 PDO の薬物検査、可逆的薬物の同定) と組み合わせます。誘導された変化) および薬剤耐性に関与する堅牢なマーカーの巧妙な組み合わせはすべて確立されており、実験室で実行されています (パート B を参照)。 最後の 2 つのポイントは、最近の 2 つの技術的進歩のおかげで実現可能になったばかりです: 乳癌 PDO 培養 (Sachs N, et al. 細胞。 2018) および CTC の分離と特徴付け (Gkountela S, et al. 細胞。 2019）。 簡単に言えば、研究者は、NAC で治療された BC 患者のコホートからの一連の腫瘍生検と血液サンプルを使用します (図 1)。 腫瘍生検は、NACの前後に収集されます。 それらは、RNA-seq およびターゲット NGS (エクソーム) アプローチによって分析され、さまざまな病理学的反応を示す患者の NAC に起因する違いを捉えます。 また、BC PDO モデルの生成にも使用されます。 NAC応答を予測するPDOモデルは、NAC耐性を調査するための関連モデルとして利用されます。 具体的には、研究者はこれらのモデルを使用して、in vitro での「後天的可逆的」薬物誘発耐性メカニズム (つまり、薬物曝露中にのみ検出可能) を調べます。 血液サンプルは、NAC の前、最中、および後に収集され、CTC を分析し、研究者が NAC の前/後のサンプルのみで検出できない可能性がある、ex vivo で「後天性の可逆的」薬物誘発性耐性メカニズムを特定することを目的としています。

私たちの知る限りでは、これら 3 つの革新的なアプローチを併用して、NAC を受けている患者の「耐性」のトピックを詳細に調査するのはこれが初めてです。 この組み合わせの強みは、相互に排他的ではなく、発生する可能性のあるさまざまな状況 (「先天的」、「後天的」、および/または「可逆的」薬物誘発耐性) を予測できることです。 各アプローチは、現在文献で入手可能な散在した不完全なデータよりも、この質問に対するより完全な回答を構築するのに役立つ独自の正確かつ具体的な情報を提供します。