ROLIVER - 肝臓微生物叢の特定のための将来コホート (ROLIVER)

肝疾患、特に線維症は、多様性に富んだ腸内微生物叢の異常によって特徴付けられます。 従来の統計分析では、肝線維症の異なる低スコア F0、F1、F2 を区別することはできません。 低悪性度の炎症の誘発に因果的に関与する脂肪組織微生物叢の存在は、肝線維症で観察されるものと類似している可能性があります。 肝線維症の発症の原因と推定される微生物仮説を生成するために、我々は36人の肥満患者（ROLIVERコホート）からの肝生検から16SrDNA遺伝子を配列し、肝線維症の初期段階F0、F1、F2の特徴を解読するための独自の数学的アプローチを説明しました。 我々は、プロテバクテリアが肝臓の主要な門であり、シュードモナス科およびプロテオバクテリア科が16SrDNA遺伝子多様性の約60%を表すことを確認した。 主成分分析では 3 つのグループを区別できませんでしたが、部分最小二乗判別分析は、各グループを予測するサインを特定するための強力なツールとして機能します。 さらに、肝線維症の初期スコアを囲む相互作用する OTU クラスターのマトリックスを構築しました。 最終的に、私たちは tfidf アプローチを適用して、診断を精緻化するのに適した情報を持っている可能性のあるまれな変数を例示しました。 まとめると、我々はここで、新たな治療の機会となる肝線維症の進行進行に関与していると推定される細菌を正確に同定するのに適した数学的アプローチを提案する。