ROLIVER - 간 미생물군 식별을 위한 전향적 코호트 (ROLIVER)

간 질환, 특히 섬유증은 매우 다양한 장내 미생물 불균형이 특징입니다. 고전적인 통계 분석은 간 섬유증 F0,F1,F2의 다른 낮은 점수를 구별하는 것을 허용하지 않습니다. 낮은 등급의 염증 유발에 인과적으로 관여하는 지방 조직 미생물총의 존재는 간 섬유증에서 관찰되는 것과 유사할 수 있습니다. 간 섬유증 발병에 대한 것으로 추정되는 미생물 가설을 생성하기 위해 우리는 36명의 비만 환자(ROLIVER 코호트)의 간 생검에서 16SrDNA 유전자를 시퀀싱하고 간 섬유증 초기 단계 F0, F1, F2의 서명을 해독하기 위한 독창적인 수학적 접근 방식을 설명합니다. 우리는 Protebacteria가 16SrDNA 유전자 다양성의 ~60%를 나타내는 Pseudomonadaceae 및 Proteobacteriaceae 계열과 간에서 주요 문으로 확인했습니다. 기본 구성 요소 분석은 세 그룹을 구별할 수 없었지만 부분 최소 제곱 판별 분석은 각 그룹에 대해 예측 가능한 서명을 식별하는 강력한 도구로 나타납니다. 우리는 간 섬유증의 초기 점수를 둘러싼 상호 작용하는 OTU 클러스터의 매트릭스를 추가로 구성했습니다. 결국 우리는 tfidf 접근 방식을 적용하여 진단을 구체화하는 데 적합한 일부 정보를 전달할 수 있는 희귀 변수를 예시했습니다. 전체적으로 우리는 새로운 치료 기회를 나타내는 간 섬유증의 점진적인 발달에 추정되는 박테리아의 정확한 식별에 적합한 수학적 접근법을 제안합니다.