ROLIVER - Coorte Prospectiva para Identificação da Microbiota Hepática (ROLIVER)

As doenças hepáticas e notadamente a fibrose são caracterizadas por uma disbiose da microbiota intestinal com grande diversidade. As análises estatísticas clássicas não permitem discriminar entre os diferentes escores baixos de fibrose hepática F0,F1,F2. A existência de uma microbiota do tecido adiposo causalmente envolvida no desencadeamento de uma inflamação de baixo grau pode se assemelhar ao observado na fibrose hepática. Para gerar hipóteses microbianas supostamente responsáveis ​​pelo início da fibrose hepática, sequenciamos o gene 16SrDNA de biópsias hepáticas de 36 pacientes obesos (coorte ROLIVER) e descrevemos uma abordagem matemática original para decifrar as assinaturas do estágio inicial da fibrose hepática F0, F1, F2. Identificamos que Protebacteria é o principal filo no fígado com as famílias Pseudomonadaceae e Proteobacteriaceae representando ~60% da diversidade do gene 16SrDNA. Enquanto as análises de componentes primários foram incapazes de discriminar entre os três grupos, a análise discriminante parcial de mínimos quadrados aparece como uma ferramenta poderosa para identificar assinaturas preditivas para cada grupo. Além disso, construímos uma matriz de clusters OTU interativos em torno dos primeiros escores de fibrose hepática. Eventualmente, aplicamos a abordagem tfidf para exemplificar as raras variáveis ​​que poderiam estar carregando alguma informação adequada para refinar o diagnóstico. Em conjunto, propomos aqui uma abordagem matemática adequada para a identificação precisa de bactérias supostamente envolvidas no desenvolvimento progressivo da fibrose hepática que representam, portanto, uma nova oportunidade terapêutica.