ROLIVER - Cohorte Prospectiva para la Identificación de Microbiota Hepática (ROLIVER)

Las enfermedades hepáticas y en particular la fibrosis se caracterizan por una disbiosis de la microbiota intestinal con una gran diversidad. Los análisis estadísticos clásicos no permiten discriminar entre las diferentes puntuaciones bajas de fibrosis hepática F0,F1,F2. La existencia de una microbiota de tejido adiposo implicada causalmente en el desencadenamiento de una inflamación de bajo grado podría parecerse a lo observado en la fibrosis hepática. Para generar hipótesis microbianas supuestamente responsables del inicio de la fibrosis hepática, secuenciamos el gen 16SrDNA de biopsias de hígado de 36 pacientes obesos (cohorte ROLIVER) y describimos un enfoque matemático original para descifrar las firmas de la etapa temprana de la fibrosis hepática F0, F1, F2. Identificamos que Protebacteria como el principal filo en el hígado con las familias Pseudomonadaceae y Proteobacteriaceae que representan ~ 60% de la diversidad del gen 16SrDNA. Si bien los análisis de componentes primarios no pudieron discriminar entre los tres grupos, el análisis discriminante de mínimos cuadrados parciales aparece como una herramienta poderosa para identificar las firmas predictivas para cada grupo. Además, construimos una matriz de grupos de OTU que interactúan alrededor de las primeras puntuaciones de fibrosis hepática. Eventualmente, aplicamos el enfoque tfidf para ejemplificar las raras variables que podrían llevar alguna información adecuada para refinar el diagnóstico. En conjunto, aquí proponemos un enfoque matemático adecuado para la identificación precisa de bacterias supuestamente involucradas en el desarrollo progresivo de la fibrosis hepática que representan, por lo tanto, una nueva oportunidad terapéutica.