ROLIVER – Prospektive Kohorte zur Identifizierung von Lebermikrobiota (ROLIVER)

Lebererkrankungen und insbesondere Fibrose sind durch eine Darmmikrobiota-Dysbiose mit großer Diversität gekennzeichnet. Klassische statistische Analysen ermöglichen keine Unterscheidung zwischen den unterschiedlich niedrigen Leberfibrosewerten F0, F1, F2. Das Vorhandensein einer Mikrobiota im Fettgewebe, die ursächlich an der Auslösung einer geringgradigen Entzündung beteiligt ist, könnte dem ähneln, was bei Leberfibrose beobachtet wird. Um mikrobielle Hypothesen zu erstellen, die möglicherweise für den Beginn der Leberfibrose verantwortlich sind, haben wir das 16SrDNA-Gen aus Leberbiopsien von 36 adipösen Patienten (ROLIVER-Kohorte) sequenziert und einen originellen mathematischen Ansatz zur Entschlüsselung der Signaturen der frühen Stadien der Leberfibrose F0, F1, F2 beschrieben. Wir haben festgestellt, dass Protebakterien die Hauptstämme in der Leber sind, wobei die Familien Pseudomonadaceae und Proteobacteriaceae etwa 60 % der 16SrDNA-Gendiversität ausmachen. Während Primärkomponentenanalysen nicht in der Lage waren, zwischen den drei Gruppen zu unterscheiden, scheint die partielle Diskriminanzanalyse der kleinsten Quadrate ein leistungsstarkes Werkzeug zur Identifizierung von Signaturen zu sein, die für jede Gruppe prädiktiv sind. Darüber hinaus haben wir eine Matrix interagierender OTU-Cluster erstellt, die frühe Leberfibrosestadien umgeben. Schließlich haben wir den tfidf-Ansatz angewendet, um die seltenen Variablen zu veranschaulichen, die einige Informationen enthalten könnten, die zur Verfeinerung der Diagnose geeignet sind. Insgesamt schlagen wir hier einen mathematischen Ansatz vor, der zur präzisen Identifizierung von Bakterien geeignet ist, die vermutlich an der fortschreitenden Entwicklung von Leberfibrose beteiligt sind und daher eine neue therapeutische Möglichkeit darstellen.