ROLIVER - Coorte prospettica per l'identificazione del microbiota epatico (ROLIVER)

Le malattie del fegato e in particolare la fibrosi sono caratterizzate da una disbiosi del microbiota intestinale con una grande diversità. Le analisi statistiche classiche non consentono di discriminare tra i diversi punteggi bassi di fibrosi epatica F0,F1,F2. L'esistenza di un microbiota del tessuto adiposo causalmente coinvolto nell'innesco di un'infiammazione di basso grado potrebbe assomigliare a quanto osservato nella fibrosi epatica. Per generare ipotesi microbiche responsabili dell'insorgenza della fibrosi epatica abbiamo sequenziato il gene 16SrDNA da biopsie epatiche di 36 pazienti obesi (coorte ROLIVER) e descritto un approccio matematico originale per decifrare le firme dello stadio iniziale della fibrosi epatica F0, F1, F2. Abbiamo identificato i Protebacteria come i principali phyla nel fegato con le famiglie Pseudomonadaceae e Proteobacteriaceae che rappresentano circa il 60% della diversità del gene 16SrDNA. Mentre le analisi dei componenti primari non sono state in grado di discriminare tra i tre gruppi, l'analisi discriminante dei minimi quadrati parziali appare come un potente strumento per identificare le firme predittive per ciascun gruppo. Abbiamo inoltre costruito una matrice di cluster OTU interagenti che circondano i primi punteggi di fibrosi epatica. Alla fine, abbiamo applicato l'approccio tfidf per esemplificare le variabili rare che potrebbero portare alcune informazioni adatte a raffinare la diagnosi. Complessivamente, proponiamo qui un approccio matematico adatto all'identificazione precisa di batteri presumibilmente coinvolti nel progressivo sviluppo della fibrosi epatica che rappresentano quindi una nuova opportunità terapeutica.