ROLIVER - Tuleva kohortti maksamikrobiston tunnistamiseksi (ROLIVER)
keskiviikko 18. huhtikuuta 2018 päivittänyt: Radu Mircea Neagoe, Tîrgu Mureș Emergency Clinical County Hospital, Romania
Rasvakudoksen mikrobiotan olemassaolo, joka syyllisesti osallistuu matala-asteisen tulehduksen laukaisemiseen, saattaa muistuttaa maksafibroosissa havaittua.
Mikrobihypoteesien luomiseksi, jonka oletetaan olevan vastuussa maksafibroosin puhkeamisesta, sekvensoimme 16SrDNA-geenin 36 lihavan potilaan maksabiopsioista (ROLIVER-kohortti) ja kuvailimme alkuperäisen matemaattisen lähestymistavan maksafibroosin F0, F1, F2 varhaisen vaiheen allekirjoitusten tulkitsemiseen.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Valmis
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Maksasairauksille ja erityisesti fibroosille on ominaista suoliston mikrobiston dysbioosi, jolla on suuri monimuotoisuus.
Klassiset tilastolliset analyysit eivät salli maksafibroosin F0,F1,F2:n eri alhaisten pistemäärien erottamista.
Rasvakudoksen mikrobiotan olemassaolo, joka syyllisesti osallistuu matala-asteisen tulehduksen laukaisemiseen, saattaa muistuttaa maksafibroosissa havaittua.
Mikrobihypoteesien luomiseksi, jonka oletetaan olevan vastuussa maksafibroosin puhkeamisesta, sekvensoimme 16SrDNA-geenin 36 lihavan potilaan maksabiopsioista (ROLIVER-kohortti) ja kuvailimme alkuperäisen matemaattisen lähestymistavan maksafibroosin F0, F1, F2 varhaisen vaiheen allekirjoitusten tulkitsemiseen.
Tunnistamme, että Protebacteria on maksan pääfyla, jossa Pseudomonadaceae- ja Proteobacteriaceae-perheet edustavat ~ 60 % 16SrDNA-geenin monimuotoisuudesta.
Vaikka ensisijaisten komponenttien analyysit eivät pystyneet erottamaan kolmea ryhmää, osittaisen pienimmän neliösumman erotteluanalyysi näyttää olevan tehokas työkalu kunkin ryhmän ennustavien allekirjoitusten tunnistamiseen.
Rakensimme edelleen matriisin vuorovaikutteisista OTU-klustereista, jotka ympäröivät maksafibroosin varhaisia pisteitä.
Lopulta sovelsimme tfidf-lähestymistapaa esimerkkinä harvinaisista muuttujista, jotka voisivat sisältää diagnoosin tarkentamiseen soveltuvaa tietoa.
Kaiken kaikkiaan ehdotamme matemaattista lähestymistapaa, joka soveltuu sellaisten bakteerien tarkkaan tunnistamiseen, jotka oletettavasti osallistuvat maksafibroosin asteittaiseen kehittymiseen, mikä on siten uusi terapeuttinen mahdollisuus.
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Todellinen)
36
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Joo
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Kaikki
Näytteenottomenetelmä
Ei-todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
Osallistujat olivat miehiä tai naisia, joiden BMI oli yli 35 ja joilla oli muita sairauksia tai yli 40.
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- bariatriset potilaat
- sairaalloisia lihavia potilaita
Poissulkemiskriteerit:
- vakava krooninen liittyvä sairaus (sydämen vajaatoiminta, kirroosi, hypopituitarismi tai autoimmuunisairaudet), alkoholin käyttö (> 20 g etanolia päivässä), lääkkeiden käyttö (laksatiivien, kuitulisän tai probioottien käyttö viimeisen 6 viikon aikana), tulehduksellinen häiriöt ja immunomoduloivien lääkkeiden käyttö. Muita poissulkemiskriteerejä olivat: aiemmat bariatriset leikkaukset, liikalihavuuslääkkeiden käyttö edellisten 3 kuukauden aikana, äskettäinen (viimeiset 2 kuukautta) tai jatkuva antibioottien käyttö, liiallinen D-vitamiinilisän käyttö; aktiivinen tai äskettäin (viimeiset 3 kuukautta), osallistuminen painonpudotusohjelmaan tai painonmuutos 3 kg viimeisen 3 kuukauden aikana, raskaana tai suunnittelee raskautta 6 kuukauden sisällä tai imettävät naiset, huumeiden väärinkäyttö ja muut tutkijan määrittelemät syyt.
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
positiivinen tai negatiivinen lineaarinen regressio 16SrDNA-sekvenssien ja maksafibroosipisteiden välillä
Aikaikkuna: 36 kuukautta
|
joidenkin 16SrDNA:n esiintymistiheyden maksassa tulisi korreloida positiivisesti tai negatiivisesti maksafibroosin pistemäärän kanssa
|
36 kuukautta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Keskiviikko 1. tammikuuta 2014
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Lauantai 31. joulukuuta 2016
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Tiistai 31. tammikuuta 2017
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Keskiviikko 18. huhtikuuta 2018
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Keskiviikko 18. huhtikuuta 2018
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Maanantai 30. huhtikuuta 2018
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Maanantai 30. huhtikuuta 2018
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Keskiviikko 18. huhtikuuta 2018
Viimeksi vahvistettu
Sunnuntai 1. huhtikuuta 2018
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- TirguMECCH
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
PÄÄTTÄMÄTÖN
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .