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母体末梢血全胎児細胞を用いた非侵襲的出生前遺伝子診断技術の開発

2025年1月27日 更新者:Ronald J Wapner, MD、Columbia University
羊水穿刺 (羊水) と絨毛膜絨毛サンプリング (CVS) は、広く使用されている無細胞非侵襲的出生前検査 (NIPT) では確実に診断できない多くの小さな DNA/遺伝子異常を確実に検出できます。 研究者らは、母親からの血液サンプルを使用した細胞ベースのNIPT(ここでは単一胎児細胞(SFC)検査と呼ばれる)が、羊膜またはCVSを使用して検出される遺伝子異常のほとんどまたはすべてを検出できるという証拠を提示している. この研究は、胎児の超音波異常のために臨床ケアの一環としてこれらの検査を受けている女性において、羊水またはCVSによってすでに検出された異常を検出する際のSFC検査の有効性を比較することを提案しています。

調査の概要

詳細な説明

これは、「ゲノム配列決定による出生前遺伝子診断: 前向き評価」というタイトルのプロジェクトの改訂版です。 この研究は、細胞ベースの非侵襲的出生前検査 (NIPT) の新しい形式の有用性と精度をテストすることを提案しています。ここでは非侵襲的単一胎児細胞 (SFC) 検査と呼ばれています。 長年にわたる開発作業の後、研究者は 2016 年に SFC テストの実現可能性に関する証拠を発表しました。 最近の広範な予備データは、SFC テストの大幅な改善を示しています。 現在の形式の無細胞 NIPT 検査では、さまざまな遺伝的障害の原因となる中型から小型の欠失および重複を確実に検出することはできません。 一部の胎児細胞はアポトーシス性であり、一部は細胞周期の S 期にあり、DNA を複製しているため、予備データは、母親の血液からの胎児栄養膜を使用した SFC 検査が異数性および染色体下欠失を検出できることを示しており、単一細胞を分析することの重要性を強調しています。 アポトーシスと S 期の両方がさまざまな方法でコピー数分析を妨害し、個々の細胞をバーコード化する前に細胞をプールすると、データ品質が失われます。 2 つのパイロット検証研究からの予備データは、信頼できるデータが大多数の患者で収集できることを示していますが、この点に関するデータはこのプロジェクトによって大幅に拡張されます。

予備データでは、すべての異数性が非常に確実に検出され、1 Mb という小さなゲノム欠失と 1.5 Mb という小さな重複が明確に定義されていることが示されています。 最初の目的は、異常な核型または染色体マイクロアレイ (CMA) を伴う先天異常の年間 50 例、および先天異常と正常な CMA を伴う年間 50 例の盲検 SFC テストを実行することです。 これにより、CMA と比較した SFC テストの成功率と偽陽性率および偽陰性率を直接測定できます。 2 番目の目的は、目的 1 から入手可能な WGA 製品と凍結されていない増幅細胞を使用して、SFC 検査をさらに改善し、親助成金の一部として WGS を受ける症例における遺伝性または de novo 病原性点突然変異の標的検出を含むようにすることです。 WGS によって検出された小さな CNV、目的 1 からの偽陽性または偽陰性の結果の再調査、および将来的には de novo 変異のゲノム全体の検出を実行しようとする可能性があります。 親の助成金を通じて利用可能なリソースを利用して、SFC 検査が遺伝的出生前診断を変革する可能性があるかどうかをテストする機会があります。これにより、CNV であるか点変異であるか、遺伝性であるか de novo であるかにかかわらず、すべての遺伝的変化を検出することができます。ローリスク妊娠で。

研究の種類

観察的

入学 (実際)

33

連絡先と場所

このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。

研究場所

    • New York
      • New York、New York、アメリカ、10032
        • Columbia University
    • Texas
      • Houston、Texas、アメリカ、77030
        • Baylor College of Medicine

参加基準

研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。

適格基準

就学可能な年齢

18年歳以上 (大人、高齢者)

健康ボランティアの受け入れ

はい

サンプリング方法

非確率サンプル

調査対象母集団

実施された核型および/またはCMAを有する研究サイトに存在する妊娠中の女性は、この研究のために募集されます。 女性の半分は正常な CMA (150) を持ち、半分は異常な CMA (150) を持ちます。

説明

包含基準:

  • すでに CVS または羊水穿刺を受けている (血液サンプルは処置後 7 日以上に採取された)。
  • -CVSまたは羊水穿刺から異常(ケース)または正常(コントロール)のCMA /核型/ FISH結果をすでに受け取っている。

除外基準:

  • -手順の少なくとも7日後に母体の血液サンプルが利用できない。
  • 言語の壁 (英語またはスペイン語以外を話す、適切な通訳者がいない)
  • 母親の年齢が18歳未満
  • 高次多胎妊娠(三つ子以上)

研究計画

このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。

研究はどのように設計されていますか?

デザインの詳細

コホートと介入

グループ/コホート
介入・治療
通常の CMA
以前に CMA を行って正常な結果を得た WFC 検査のために血液サンプルを採取する 150 人の女性。
血液検体でWFC検査を行います。
異常な CMA
以前に CMA を行って異常な結果が得られた、WFC 検査のために血液サンプルが採取される 150 人の女性。
血液検体でWFC検査を行います。

この研究は何を測定していますか?

主要な結果の測定

結果測定
時間枠
異常および正常な核型と CMA を持つ妊娠の母集団を使用して、WFC テストの偽陽性、偽陰性、真陽性、および真陰性の割合を決定します。
時間枠:3年
3年
各サンプルのスコア可能なセルの数を含む WFC テストの技術的な成功率を決定します。
時間枠:3年
3年
既知の CNV の「スパイクイン」サンプルと、胎児細胞に自然に発生する CNV の分析に基づいて、WFC テストによって削除/重複を検出するための解像度のレベルを決定します。
時間枠:3年
3年
De novo および継承された単一遺伝子突然変異と良性 SNP を含む単一遺伝子突然変異のジェノタイピングの能力と成功率を決定します。
時間枠:3年
3年

二次結果の測定

結果測定
時間枠
テスト時の在胎週数、特定の異常、母体の体重、多胎妊娠に応じて WFC テスト結果を評価します。
時間枠:3年
3年
妊娠中に細胞がより頻繁に発生し、子癇前症などの妊娠に不利な転帰をもたらすかどうかを判断します。
時間枠:3年
3年
同じ細胞でジェノタイピングとゲノム全体のコピー数解析を実行する機能など、単一細胞のジェノタイピング方法を改善します。
時間枠:3年
3年

協力者と研究者

ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。

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捜査官

  • 主任研究者:Ronald Wapner, MD、Columbia University

研究記録日

これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。

主要日程の研究

研究開始 (実際)

2020年9月1日

一次修了 (実際)

2023年7月20日

研究の完了 (実際)

2023年7月20日

試験登録日

最初に提出

2020年2月24日

QC基準を満たした最初の提出物

2020年2月25日

最初の投稿 (実際)

2020年2月26日

学習記録の更新

投稿された最後の更新 (実際)

2025年3月25日

QC基準を満たした最後の更新が送信されました

2025年1月27日

最終確認日

2025年1月1日

詳しくは

本研究に関する用語

その他の研究ID番号

  • AAAS9107
  • 3R01HD055651 (米国 NIH グラント/契約)

個々の参加者データ (IPD) の計画

個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?

いいえ

IPD プランの説明

プロジェクト データセットおよび関連するゲノム データは、NIH のゲノム データ共有ポリシーに準拠した患者のプライバシー、機密性、および健康情報の管理の基準を慎重に遵守しながら、制御されたアクセス dbGAP リポジトリまたは同等のデータベースを通じて研究のために科学コミュニティと広く共有されます。 遺伝子データのデータ共有は dbGaP で行われます。 データは研究のすべての年で生成され、研究の完了時に提出されます。 研究プロトコル、インフォームド コンセントのテンプレート、結果レポートのテンプレート、バイオインフォマティクス ツールなどのリソースも、オープン アクセス データベースと公開 Web サイトを通じて利用できるようになります。 大規模な科学コミュニティと共有するために、承認されたプラットフォームを通じてデータセットと情報ツールを利用できるようにします。 WFC に関連する将来の研究のためにこれらのサンプルを使用する許可を得て、残りの DNA サンプルを保存します。 これらの標本は暗号化された方法で保管されます。

医薬品およびデバイス情報、研究文書

米国FDA規制医薬品の研究

いいえ

米国FDA規制機器製品の研究

いいえ

米国で製造され、米国から輸出された製品。

いいえ

この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。

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