母体末梢血全胎児細胞を用いた非侵襲的出生前遺伝子診断技術の開発
調査の概要
詳細な説明
これは、「ゲノム配列決定による出生前遺伝子診断: 前向き評価」というタイトルのプロジェクトの改訂版です。 この研究は、細胞ベースの非侵襲的出生前検査 (NIPT) の新しい形式の有用性と精度をテストすることを提案しています。ここでは非侵襲的単一胎児細胞 (SFC) 検査と呼ばれています。 長年にわたる開発作業の後、研究者は 2016 年に SFC テストの実現可能性に関する証拠を発表しました。 最近の広範な予備データは、SFC テストの大幅な改善を示しています。 現在の形式の無細胞 NIPT 検査では、さまざまな遺伝的障害の原因となる中型から小型の欠失および重複を確実に検出することはできません。 一部の胎児細胞はアポトーシス性であり、一部は細胞周期の S 期にあり、DNA を複製しているため、予備データは、母親の血液からの胎児栄養膜を使用した SFC 検査が異数性および染色体下欠失を検出できることを示しており、単一細胞を分析することの重要性を強調しています。 アポトーシスと S 期の両方がさまざまな方法でコピー数分析を妨害し、個々の細胞をバーコード化する前に細胞をプールすると、データ品質が失われます。 2 つのパイロット検証研究からの予備データは、信頼できるデータが大多数の患者で収集できることを示していますが、この点に関するデータはこのプロジェクトによって大幅に拡張されます。
予備データでは、すべての異数性が非常に確実に検出され、1 Mb という小さなゲノム欠失と 1.5 Mb という小さな重複が明確に定義されていることが示されています。 最初の目的は、異常な核型または染色体マイクロアレイ (CMA) を伴う先天異常の年間 50 例、および先天異常と正常な CMA を伴う年間 50 例の盲検 SFC テストを実行することです。 これにより、CMA と比較した SFC テストの成功率と偽陽性率および偽陰性率を直接測定できます。 2 番目の目的は、目的 1 から入手可能な WGA 製品と凍結されていない増幅細胞を使用して、SFC 検査をさらに改善し、親助成金の一部として WGS を受ける症例における遺伝性または de novo 病原性点突然変異の標的検出を含むようにすることです。 WGS によって検出された小さな CNV、目的 1 からの偽陽性または偽陰性の結果の再調査、および将来的には de novo 変異のゲノム全体の検出を実行しようとする可能性があります。 親の助成金を通じて利用可能なリソースを利用して、SFC 検査が遺伝的出生前診断を変革する可能性があるかどうかをテストする機会があります。これにより、CNV であるか点変異であるか、遺伝性であるか de novo であるかにかかわらず、すべての遺伝的変化を検出することができます。ローリスク妊娠で。
研究の種類
入学 (実際)
連絡先と場所
研究場所
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New York
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New York、New York、アメリカ、10032
- Columbia University
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Texas
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Houston、Texas、アメリカ、77030
- Baylor College of Medicine
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- すでに CVS または羊水穿刺を受けている (血液サンプルは処置後 7 日以上に採取された)。
- -CVSまたは羊水穿刺から異常(ケース)または正常(コントロール)のCMA /核型/ FISH結果をすでに受け取っている。
除外基準:
- -手順の少なくとも7日後に母体の血液サンプルが利用できない。
- 言語の壁 (英語またはスペイン語以外を話す、適切な通訳者がいない)
- 母親の年齢が18歳未満
- 高次多胎妊娠(三つ子以上)
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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通常の CMA
以前に CMA を行って正常な結果を得た WFC 検査のために血液サンプルを採取する 150 人の女性。
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血液検体でWFC検査を行います。
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異常な CMA
以前に CMA を行って異常な結果が得られた、WFC 検査のために血液サンプルが採取される 150 人の女性。
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血液検体でWFC検査を行います。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
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異常および正常な核型と CMA を持つ妊娠の母集団を使用して、WFC テストの偽陽性、偽陰性、真陽性、および真陰性の割合を決定します。
時間枠:3年
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3年
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各サンプルのスコア可能なセルの数を含む WFC テストの技術的な成功率を決定します。
時間枠:3年
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3年
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既知の CNV の「スパイクイン」サンプルと、胎児細胞に自然に発生する CNV の分析に基づいて、WFC テストによって削除/重複を検出するための解像度のレベルを決定します。
時間枠:3年
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3年
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De novo および継承された単一遺伝子突然変異と良性 SNP を含む単一遺伝子突然変異のジェノタイピングの能力と成功率を決定します。
時間枠:3年
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3年
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二次結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
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テスト時の在胎週数、特定の異常、母体の体重、多胎妊娠に応じて WFC テスト結果を評価します。
時間枠:3年
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3年
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妊娠中に細胞がより頻繁に発生し、子癇前症などの妊娠に不利な転帰をもたらすかどうかを判断します。
時間枠:3年
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3年
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同じ細胞でジェノタイピングとゲノム全体のコピー数解析を実行する機能など、単一細胞のジェノタイピング方法を改善します。
時間枠:3年
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3年
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協力者と研究者
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協力者
捜査官
- 主任研究者:Ronald Wapner, MD、Columbia University
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (実際)
研究の完了 (実際)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- AAAS9107
- 3R01HD055651 (米国 NIH グラント/契約)
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
IPD プランの説明
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
米国で製造され、米国から輸出された製品。
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