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Technologieentwicklung für die nichtinvasive pränatale genetische Diagnose unter Verwendung ganzer fötaler Zellen aus mütterlichem peripherem Blut

3. November 2022 aktualisiert von: Ronald J Wapner, MD, Columbia University
Amniozentese (Amnio) und Chorionzottenbiopsie (CVS) können viele kleinere DNA-/genetische Anomalien zuverlässig erkennen, die durch den weit verbreiteten zellfreien nichtinvasiven Pränataltest (NIPT) nicht zuverlässig diagnostiziert werden können. Die Forscher legen Beweise dafür vor, dass eine zellbasierte Form des NIPT, hier Single Fetal Cell (SFC)-Test genannt, unter Verwendung einer Blutprobe der Mutter die meisten oder alle genetischen Anomalien erkennen kann, die mit Amnio oder CVS nachgewiesen werden. Diese Studie schlägt vor, die Wirksamkeit von SFC-Tests bei der Erkennung von Anomalien zu vergleichen, die bereits durch Amnio oder CVS bei Frauen festgestellt wurden, die sich diesen Tests bereits als Teil ihrer klinischen Behandlung aufgrund von fötalen Ultraschallanomalien unterziehen.

Studienübersicht

Detaillierte Beschreibung

Dies ist eine Überarbeitung eines Projekts mit dem Titel „Pränatale genetische Diagnose durch Genomsequenzierung: Eine prospektive Bewertung“. Diese Studie schlägt vor, den Nutzen und die Genauigkeit einer neuen Form des zellbasierten nichtinvasiven pränatalen Tests (NIPT), hier als nichtinvasiver Single Fetal Cell (SFC)-Test bezeichnet, zu testen. Nach langjähriger Entwicklungsarbeit veröffentlichten die Forscher 2016 Belege für die Machbarkeit von SFC-Tests. Umfangreiche aktuelle vorläufige Daten zeigen erhebliche Verbesserungen bei SFC-Tests. Gegenwärtige Formen von zellfreien NIPT-Tests bieten keinen zuverlässigen Nachweis von Deletionen mittlerer bis kleinerer Größe und Duplikationen, die eine Vielzahl von genetischen Behinderungen verursachen. Vorläufige Daten weisen darauf hin, dass SFC-Tests mit fetalen Trophoblasten aus dem Blut der Mutter Aneuploidie und subchromosomale Deletionen erkennen können, und unterstreichen die Bedeutung der Analyse einzelner Zellen, da einige fetale Zellen apoptotisch sind und einige sich in der S-Phase des Zellzyklus befinden und ihre DNA replizieren. Sowohl die Apoptose als auch die S-Phase stören die Kopienzahlanalyse auf unterschiedliche Weise, und das Poolen von Zellen vor dem Barcodieren einzelner Zellen führt zu einem Verlust der Datenqualität. Vorläufige Daten aus zwei Pilot-Validierungsstudien zeigen, dass bei der großen Mehrheit der Patienten zuverlässige Daten gesammelt werden können, obwohl die Daten zu diesem Punkt durch dieses Projekt erheblich erweitert würden.

Vorläufige Daten zeigen eine sehr robuste Erkennung aller Aneuploidien und eine klare Definition von genomischen Deletionen von nur 1 Mb und Duplikationen von nur 1,5 Mb. Das erste Ziel ist die Durchführung von verblindeten SFC-Tests bei 50 Fällen pro Jahr mit angeborenen Anomalien mit abnormalem Karyotyp oder chromosomalem Mikroarray (CMA) und 50 Fällen pro Jahr mit angeborenen Anomalien und normaler CMA. Dies liefert ein direktes Maß für die Erfolgsrate und die falsch-positiven und falsch-negativen Raten für SFC-Tests im Vergleich zu CMA. Das zweite Ziel besteht darin, die unter Ziel 1 verfügbaren WGA-Produkte und gefrorenen nicht amplifizierten Zellen zu verwenden, um die SFC-Tests weiter zu verbessern, um den gezielten Nachweis von ererbten oder de novo pathogenen Punktmutationen in den Fällen einzuschließen, in denen WGS als Teil des Elternstipendiums durchgeführt wird, Bestätigung von very kleine CNVs, die durch WGS erkannt wurden, eine erneute Untersuchung falsch positiver oder falsch negativer Ergebnisse aus Ziel 1, und in Zukunft könnte versucht werden, einen genomweiten Nachweis von De-novo-Mutationen durchzuführen. Unter Nutzung der durch das Elternstipendium verfügbaren Ressourcen besteht die Möglichkeit zu testen, ob SFC-Tests das Potenzial haben, die genetische Pränataldiagnostik so zu verändern, dass alle genetischen Veränderungen, ob CNV oder Punktmutation, ob vererbt oder de novo, sogar erkannt werden können bei Niedrigrisikoschwangerschaften.

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Voraussichtlich)

300

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienkontakt

Studieren Sie die Kontaktsicherung

Studienorte

    • New York
      • New York, New York, Vereinigte Staaten, 10032
        • Rekrutierung
        • Columbia University
        • Kontakt:
        • Kontakt:
        • Hauptermittler:
          • Ronald Wapner, MD
    • Texas
      • Houston, Texas, Vereinigte Staaten, 77030
        • Rekrutierung
        • Baylor College of Medicine

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

18 Jahre und älter (Erwachsene, Älterer Erwachsener)

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Ja

Studienberechtigte Geschlechter

Weiblich

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

Schwangere Frauen, die sich an den Studienzentren vorstellen und einen Karyotyp und/oder eine CMA durchführen lassen, werden für diese Studie rekrutiert. Die Hälfte der Frauen hat eine normale CMA (150) und die andere Hälfte eine abnormale CMA (150).

Beschreibung

Einschlusskriterien:

  • Hatte bereits eine CVS oder Amniozentese (Blutprobe entnommen >= 7 Tage nach dem Eingriff).
  • bereits ein abnormales (Fall) oder normales (Kontrolle) CMA/Karyotyp/FISH-Ergebnis aus dem CVS oder der Amniozentese erhalten haben.

Ausschlusskriterien:

  • Nichtverfügbarkeit der mütterlichen Blutprobe mindestens 7 Tage nach dem Eingriff.
  • Sprachbarriere (nicht Englisch oder Spanisch sprechend und kein adäquater Dolmetscher)
  • Alter der Mutter unter 18 Jahren
  • Mehrlingsschwangerschaft höherer Ordnung (Drilling oder größer)

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
Intervention / Behandlung
Normale CMA
150 Frauen, deren Blutproben für WFC-Tests entnommen werden, bei denen zuvor eine CMA mit normalen Ergebnissen durchgeführt wurde.
Durchführung von WFC-Tests an Blutproben.
Anormale CMA
150 Frauen, deren Blutproben für WFC-Tests entnommen werden, bei denen zuvor eine CMA mit abnormalen Ergebnissen durchgeführt wurde.
Durchführung von WFC-Tests an Blutproben.

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Zeitfenster
Bestimmen Sie anhand einer Population von Schwangeren mit abnormen und normalen Karyotypen und CMAs die falsch-positiven, falsch-negativen, richtig-positiven und richtig-negativen Raten von WFC-Tests.
Zeitfenster: 3 Jahre
3 Jahre
Bestimmen Sie die technische Erfolgsrate für WFC-Tests, einschließlich der Anzahl der bewertbaren Zellen für jede Probe.
Zeitfenster: 3 Jahre
3 Jahre
Bestimmen Sie das Auflösungsniveau für die Erkennung von Deletionen/Duplikationen durch WFC-Tests basierend auf "angereicherten" Proben bekannter CNVs und auf der Analyse von natürlich vorkommenden CNVs in fötalen Zellen.
Zeitfenster: 3 Jahre
3 Jahre
Bestimmen Sie die Fähigkeit und Erfolgsrate für die Genotypisierung einzelner Genmutationen, einschließlich de novo und vererbter einzelner Genmutationen und gutartiger SNPs.
Zeitfenster: 3 Jahre
3 Jahre

Sekundäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Zeitfenster
Bewerten Sie die WFC-Testergebnisse nach Gestationsalter beim Testen, spezifischen Anomalien, mütterlichem Gewicht und Mehrlingsschwangerschaften.
Zeitfenster: 3 Jahre
3 Jahre
Bestimmen Sie, ob Zellen in Schwangerschaften häufiger vorkommen, was zu unerwünschten Schwangerschaftsergebnissen einschließlich Präeklampsie führt.
Zeitfenster: 3 Jahre
3 Jahre
Verbessern Sie Methoden zur Genotypisierung einzelner Zellen, einschließlich der Fähigkeit, Genotypisierung und genomweite Kopienzahlanalyse an derselben Zelle durchzuführen.
Zeitfenster: 3 Jahre
3 Jahre

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

1. September 2020

Primärer Abschluss (Voraussichtlich)

1. März 2023

Studienabschluss (Voraussichtlich)

1. März 2023

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

24. Februar 2020

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

25. Februar 2020

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

26. Februar 2020

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

7. November 2022

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

3. November 2022

Zuletzt verifiziert

1. November 2022

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen

Andere Studien-ID-Nummern

  • AAAS9107
  • 3R01HD055651 (US NIH Stipendium/Vertrag)

Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)

Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?

NEIN

Beschreibung des IPD-Plans

Der Projektdatensatz und die zugehörigen Genomdaten werden über das dbGAP-Repository mit kontrolliertem Zugriff oder vergleichbare Datenbanken für Forschungszwecke in großem Umfang mit der wissenschaftlichen Gemeinschaft geteilt, wobei die Standards für den Datenschutz, die Vertraulichkeit und die Verwaltung von Gesundheitsinformationen, die der NIH-Richtlinie zur gemeinsamen Nutzung von Genomdaten entsprechen, sorgfältig eingehalten werden. Der Datenaustausch genetischer Daten erfolgt in dbGaP. Die Daten werden in allen Jahren der Studie generiert und nach Abschluss der Studie eingereicht. Ressourcen, einschließlich Studienprotokolle, Vorlagen für Einwilligungserklärungen, Ergebnisberichte und bioinformatische Tools, werden auch über frei zugängliche Datenbanken und öffentliche Websites zur Verfügung gestellt. Wir werden Datensätze und Informatikwerkzeuge über zugelassene Plattformen für den Austausch mit der größeren wissenschaftlichen Gemeinschaft zur Verfügung stellen. Wir werden verbleibende DNA-Proben mit der Erlaubnis aufbewahren, diese Proben für zukünftige Forschungen im Zusammenhang mit WFC zu verwenden. Diese Proben werden verschlüsselt aufbewahrt.

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

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