Desarrollo de Tecnología para el Diagnóstico Genético Prenatal No Invasivo Utilizando Células Fetales Enteras de Sangre Periférica Materna

Esta es una revisión de un proyecto titulado "Diagnóstico genético prenatal mediante secuenciación genómica: una evaluación prospectiva". Este estudio propone probar la utilidad y la precisión de una nueva forma de prueba prenatal no invasiva basada en células (NIPT), aquí llamada prueba no invasiva de células fetales únicas (SFC). Después de muchos años de trabajo de desarrollo, los investigadores publicaron pruebas de la viabilidad de las pruebas de SFC en 2016. Numerosos datos preliminares recientes muestran mejoras considerables en las pruebas de SFC. Las formas actuales de pruebas NIPT sin células no proporcionan una detección confiable de deleciones y duplicaciones de tamaño mediano a pequeño que causan una variedad de discapacidades genéticas. Los datos preliminares indican que las pruebas de SFC que utilizan trofoblastos fetales de la sangre de la madre pueden detectar aneuploidía y deleciones subcromosómicas y enfatizan la importancia de analizar células individuales, ya que algunas células fetales son apoptóticas y otras están en la fase S del ciclo celular replicando su ADN. Tanto la apoptosis como la fase S interfieren con el análisis del número de copias de diferentes maneras, y la combinación de células antes de codificar las células individuales da como resultado una pérdida de calidad de los datos. Los datos preliminares de dos estudios piloto de validación demuestran que se pueden recopilar datos fiables sobre la gran mayoría de los pacientes, aunque este proyecto ampliaría enormemente los datos sobre este punto.

Los datos preliminares muestran una detección muy robusta de todas las aneuploidías y una definición clara de deleciones genómicas tan pequeñas como 1 Mb y duplicaciones tan pequeñas como 1,5 Mb. El primer objetivo es realizar pruebas de SFC ciegas en 50 casos por año con anomalías congénitas con cariotipo anormal o micromatriz cromosómica (CMA) y 50 casos por año con anomalías congénitas y CMA normal. Esto proporcionará una medida directa de la tasa de éxito y las tasas de falsos positivos y falsos negativos para las pruebas SFC en comparación con CMA. El segundo objetivo será utilizar los productos WGA y las células no amplificadas congeladas disponibles en el objetivo 1 para mejorar aún más las pruebas de SFC para incluir la detección específica de mutaciones puntuales patogénicas heredadas o de novo en los casos que se someten a WGS como parte de la subvención principal, la confirmación de muy pequeñas CNV detectadas por WGS, reestudio de resultados falsos positivos o falsos negativos del objetivo 1, y en el futuro podría intentar realizar una detección de mutaciones de novo en todo el genoma. Aprovechando los recursos disponibles a través de la subvención principal, existe la oportunidad de probar si las pruebas de SFC tienen el potencial de transformar el diagnóstico prenatal genético para que todos los cambios genéticos, ya sea CNV o mutación puntual, heredados o de novo, puedan detectarse incluso en embarazos de bajo riesgo.