Desenvolvimento de Tecnologia para Diagnóstico Genético Pré-Natal Não Invasivo Utilizando Células Fetais Inteiras de Sangue Periférico Materno

Esta é uma revisão de um projeto intitulado "Diagnóstico genético pré-natal por sequenciamento genômico: uma avaliação prospectiva". Este estudo propõe testar a utilidade e precisão de uma nova forma de teste pré-natal não invasivo baseado em células (NIPT), aqui chamado de teste não invasivo de célula fetal única (SFC). Após muitos anos de trabalho de desenvolvimento, os pesquisadores publicaram evidências da viabilidade do teste SFC em 2016. Extensos dados preliminares recentes mostram melhorias consideráveis ​​nos testes SFC. As formas atuais de teste NIPT sem células não fornecem detecção confiável de deleções e duplicações de tamanho médio a pequeno que causam uma variedade de deficiências genéticas. Dados preliminares indicam que o teste SFC usando trofoblastos fetais do sangue da mãe pode detectar aneuploidias e deleções subcromossômicas e enfatizam a importância de analisar células únicas, uma vez que algumas células fetais são apoptóticas e algumas estão na fase S do ciclo celular replicando seu DNA. Tanto a apoptose quanto a fase S interferem na análise do número de cópias de maneiras diferentes, e o agrupamento de células antes do código de barras de células individuais resulta em perda de qualidade de dados. Dados preliminares de dois estudos-piloto de validação demonstram que dados confiáveis ​​podem ser coletados na grande maioria dos pacientes, embora os dados sobre esse ponto possam ser bastante expandidos por este projeto.

Dados preliminares mostram detecção muito robusta de todas as aneuploidias e definição clara de deleções genômicas tão pequenas quanto 1 Mb e duplicações tão pequenas quanto 1,5 Mb. O primeiro objetivo é realizar testes SFC cegos em 50 casos por ano com anomalias congênitas com cariótipo anormal ou microarray cromossômico (CMA) e 50 casos por ano com anomalias congênitas e CMA normal. Isso fornecerá uma medida direta da taxa de sucesso e das taxas de falsos positivos e falsos negativos para testes SFC em comparação com CMA. O segundo objetivo será usar os produtos WGA e células não amplificadas congeladas disponíveis no objetivo 1 para melhorar ainda mais o teste SFC para incluir a detecção direcionada de mutações pontuais patogênicas herdadas ou de novo nos casos submetidos a WGS como parte da concessão dos pais, confirmação de muito pequenas CNVs detectadas por WGS, reestudo de resultados falsos positivos ou falsos negativos do objetivo 1 e, no futuro, poderia tentar realizar a detecção ampla do genoma de mutações de novo. Capitalizando os recursos disponíveis por meio da concessão dos pais, há a oportunidade de testar se o teste SFC tem o potencial de transformar o diagnóstico genético pré-natal para que todas as alterações genéticas, sejam CNV ou mutação pontual, sejam herdadas ou de novo, possam ser detectadas mesmo em gestações de baixo risco.