Technológiafejlesztés noninvazív prenatális genetikai diagnózishoz anyai perifériás vérből származó teljes magzati sejteket használva

Ez a "Prenatális genetikai diagnosztika genomi szekvenálás segítségével: jövőbeli értékelés" című projekt átdolgozása. Ez a tanulmány azt javasolja, hogy teszteljék a sejtalapú noninvazív prenatális tesztelés (NIPT) új formájának hasznosságát és pontosságát, amelyet itt noninvazív egymagzati sejtvizsgálatnak (SFC) neveznek. Sok éves fejlesztési munka után a kutatók 2016-ban bizonyítékokat tettek közzé az SFC-teszt megvalósíthatóságára vonatkozóan. A közelmúltban megjelent kiterjedt előzetes adatok jelentős javulást mutatnak az SFC-tesztelés terén. A sejtmentes NIPT tesztelés jelenlegi formái nem biztosítják a közepes és kisebb méretű deléciók és duplikációk megbízható kimutatását, amelyek különféle genetikai fogyatékosságokat okoznak. Az előzetes adatok azt mutatják, hogy az anyai vérből származó magzati trofoblasztokkal végzett SFC-teszttel kimutatható az aneuploiditás és a szubkromoszómális deléció, és hangsúlyozni lehet az egyes sejtek elemzésének fontosságát, mivel egyes magzati sejtek apoptotikusak, mások pedig a sejtciklus S-fázisában replikálják DNS-üket. Mind az apoptózis, mind az S-fázis különböző módon zavarja a másolatszám-elemzést, és a sejtek egyesítése az egyes sejtek vonalkódolása előtt az adatminőség elvesztését eredményezi. Két kísérleti validációs vizsgálat előzetes adatai azt mutatják, hogy a betegek nagy többségéről megbízható adatok gyűjthetők, bár ez a projekt jelentősen bővítené az erre vonatkozó adatokat.

Az előzetes adatok azt mutatják, hogy az összes aneuploiditás nagyon robusztus kimutatása, és világosan meghatározhatóak az 1 Mb-ig terjedő genomi deléciók és az 1,5 Mb-os duplikációk. Az első cél az, hogy vak SFC-tesztet végezzenek évente 50, abnormális kariotípussal vagy kromoszómális microarray-vel (CMA) járó veleszületett anomáliával és évente 50 veleszületett anomáliával és normál CMA-val. Ez közvetlenül méri a sikerességi arányt, valamint az SFC-tesztek hamis pozitív és álnegatív arányát a CMA-val összehasonlítva. A második cél az lesz, hogy az 1. célból elérhető WGA-termékeket és fagyasztott nem amplifikált sejteket felhasználják az SFC-teszt továbbfejlesztésére, beleértve az öröklött vagy de novo patogén pontmutációk célzott kimutatását a WGS-en átesett esetekben a szülői támogatás részeként, a nagyon A WGS által kimutatott kis CNV-k, az 1. cél álpozitív vagy álnegatív eredmények újravizsgálata, és a jövőben megkísérelhetik a de novo mutációk genomszintű kimutatását. A szülői támogatáson keresztül elérhető forrásokat kihasználva lehetőség nyílik annak tesztelésére, hogy az SFC-teszt képes-e a genetikai prenatális diagnózist úgy átalakítani, hogy minden genetikai változás, legyen az CNV vagy pontmutáció, akár öröklött, akár de novo is kimutatható legyen. alacsony kockázatú terhességben.