慢性閉塞性肺疾患、特発性肺線維症およびコントロールにおける単一細胞レベルの気道アトラス (DISCOVAIR)

慢性呼吸器疾患の発生率の増加は、世界中のあらゆる年齢層の何十万人もの人々に影響を与える公衆衛生上の問題です。 空気中の汚染物質 (汚染物質、アレルゲン) に直接さらされる気道は、さまざまな細胞 (多毛細胞、基底細胞、粘膜分泌細胞、神経内分泌細胞など) が関与する複雑な生態系を形成しており、周囲の結合組織だけでなく、それらの豊富な免疫環境とも複雑に相互作用します。そして地元の微生物叢。 アレルギー疾患などの特定の疾患では、鼻気道と気管支気道の間に病態生理学的連続性が仮定されていますが、研究者は、さまざまな研究で鼻気道と気管支気道から採取したサンプル間に大きな遺伝子発現勾配があることを実証しています。 正常な生理学的状況における呼吸樹全体の細胞変動を特定することは、国際コンソーシアムの Human Cell Atlas の目的で定義されているように、すべての気道細胞のアトラスの確立で定義された主要な目的の 1 つです。

個々の細胞に特異的に存在する RNA の配列決定 (「単一細胞 RNAseq」) と、隣接する細胞との比較により、正確な細胞の寄与と関与するシグナル伝達経路を文書化することができます。 組織サンプリング、安定化、輸送、および単一細胞分析手順の開発は、初代呼吸器上皮培養で実行でき、健康なボランティアからの呼吸器サンプルにも拡張できます。

このプロジェクトでは、慢性閉塞性肺疾患、間質性肺線維症のボランティアの遺伝子発現プロファイルを単一細胞レベル (単一細胞 RNAseq) で分析し、同年齢の健康な被験者と比較します。 サンプルの技術的モダリティは、サンプルを直接分析するためのブラッシングと段階的な気道生検です。 このアプローチは、気液界面培養によって補完され、単一細胞 RNAseq での二次分析と、単一細胞 in situ 分析によるこれらの細胞の分布の三次元マッピングを可能にします。

呼吸樹（鼻、細気管支、細気管支）のいくつかのレベルでのサンプリングのおかげで、気管気管支軸に沿った細胞および遺伝子発現の変動が、さまざまな年齢の被験者、健康な被験者、または慢性閉塞性肺疾患や間質性肺疾患などの病状に苦しんでいる被験者で徹底的に記録されます。肺線維症。 これらのデータは、さまざまな生理学的および病理学的状況で比較するための世界的な参照として役立ちます。