トランスクリプトームに基づく急性熱性疾患診断バイオマーカーの臨床研究

急性発熱は世界中で一般的な医療緊急事態であり、ほとんどの場合細菌またはウイルス感染によって引き起こされます。 感染症の早期かつ迅速な鑑別診断は、患者の転帰を改善するために非常に重要です。 病原体の検出は依然として感染症を診断するためのゴールドスタンダードですが、培養などの方法は時間がかかり、多くの場合感度が不足しています。 さらに、人体内に細菌やウイルスなどの通常の定着微生物が存在すると、病原体の検出において偽陽性が発生する可能性があります。 これらの制限により、医師は臨床症状に基づいた経験的な抗菌療法に頼らざるを得ないことが多く、不用意に抗生物質の過剰使用や細菌耐性の問題の増大につながっています。

さらに、非細菌感染症の患者における抗菌薬の誤用は、クロストリジウム・ディフィシルによる二次感染、肝機能障害、腎障害、血球減少症、体内微生物叢の変化などの合併症を引き起こす可能性があります。 宿主の炎症反応に基づく診断マーカーは、感染症診断への代替アプローチを提供します。 ただし、プロカルシトニンのようなタンパク質バイオマーカーは、臨床現場で広く使用されていますが、偽陽性や偽陰性が発生しやすいため、細菌感染を正確に診断するには理想的とは程遠いです。

有望な方向性は、トランスクリプトームレベルでの宿主と病原体の相互作用、特にさまざまな病原体に応答した宿主の示差的な遺伝子発現の分析である。 この研究分野は最近大きな注目を集めています。 患者の末梢血に由来するトランスクリプトームマーカーは、さまざまな感染症の診断や病因の研究にうまく利用されています。

こうした進歩にもかかわらず、RNA シークエンシングやトランスクリプトーム チップ技術に依存した研究には特殊な機器とバイオインフォマティクスの専門知識が必要なため、高価であり、日常的な臨床診療での導入が困難となっています。 さらに、トランスクリプトーム解析の結果は、RNA 定量化の「ゴールドスタンダード」である逆転写ポリメラーゼ連鎖反応 (RT-PCR) によって簡単に検証されません。 したがって、トランスクリプトームベースの診断マーカーをより臨床的に応用できるようにするには、感染症診断の精度を高め、抗菌薬の誤用を減らすための PCR などのリアルタイム技術が必要です。 現在、この分野の研究は依然として限られています。