Studio clinico del biomarcatore diagnostico basato sul trascrittoma per la malattia febbrile acuta

La febbre acuta è un’emergenza medica comune in tutto il mondo, spesso causata da infezioni batteriche o virali. La diagnosi differenziale precoce e rapida delle malattie infettive è fondamentale per migliorare i risultati dei pazienti. Sebbene il rilevamento degli agenti patogeni rimanga il gold standard per la diagnosi delle infezioni, metodi come la coltura richiedono molto tempo e spesso mancano di sensibilità. Inoltre, la presenza di normali microrganismi colonizzatori, come batteri e virus nel corpo umano, può portare a falsi positivi nel rilevamento degli agenti patogeni. Queste limitazioni spesso costringono i medici a fare affidamento su una terapia antibatterica empirica basata sui sintomi clinici, contribuendo inavvertitamente all’uso eccessivo di antibiotici e al crescente problema della resistenza batterica.

Inoltre, l’uso improprio di farmaci antibatterici in pazienti con infezioni non batteriche può portare a complicazioni come infezioni secondarie da Clostridium difficile, disfunzione epatica, danni renali, citopenia e alterazioni del microbiota corporeo. I marcatori diagnostici basati sulle risposte infiammatorie dell’ospite offrono un approccio alternativo alla diagnosi delle infezioni. Tuttavia, i biomarcatori proteici come la procalcitonina, sebbene ampiamente utilizzati in ambito clinico, sono lungi dall’essere ideali per diagnosticare accuratamente le infezioni batteriche, poiché sono soggetti a falsi positivi e negativi.

Una direzione promettente è l'analisi delle interazioni ospite-patogeno a livello del trascrittoma, in particolare l'espressione genica differenziale dell'ospite in risposta a vari agenti patogeni. Quest’area di ricerca ha guadagnato recentemente una notevole attenzione. I marcatori trascrittomici derivati ​​dal sangue periferico dei pazienti sono stati utilizzati con successo nella diagnosi e nello studio della patogenesi di varie malattie infettive.

Nonostante questi progressi, gli studi che si basano sul sequenziamento dell’RNA o sulla tecnologia dei chip del trascrittoma richiedono attrezzature specializzate e competenze bioinformatiche, il che li rende costosi e difficili da implementare nella pratica clinica di routine. Inoltre, i risultati dell'analisi del trascrittoma non sono facilmente convalidati dalla reazione a catena della polimerasi a trascrizione inversa (RT-PCR), il "gold standard" per la quantificazione dell'RNA. Pertanto, per rendere i marcatori diagnostici basati sul trascrittoma più applicabili clinicamente, sono necessarie tecnologie in tempo reale, come la PCR, per migliorare l’accuratezza della diagnosi delle infezioni e ridurre l’uso improprio di farmaci antibatterici. Attualmente, la ricerca in questo settore rimane limitata.