Estudo clínico de biomarcador diagnóstico baseado em transcriptoma para doença febril aguda

A febre aguda é uma emergência médica comum em todo o mundo, causada mais frequentemente por infecções bacterianas ou virais. O diagnóstico diferencial precoce e rápido de doenças infecciosas é crucial para melhorar os resultados dos pacientes. Embora a detecção de patógenos continue sendo o padrão ouro para o diagnóstico de infecções, métodos como a cultura são demorados e muitas vezes carecem de sensibilidade. Além disso, a presença de microrganismos colonizadores normais, como bactérias e vírus no corpo humano, pode levar a falsos positivos na detecção de patógenos. Estas limitações muitas vezes obrigam os médicos a confiar na terapia antibacteriana empírica baseada em sintomas clínicos, contribuindo inadvertidamente para o uso excessivo de antibióticos e para o problema crescente da resistência bacteriana.

Além disso, o uso indevido de medicamentos antibacterianos em pacientes com infecções não bacterianas pode levar a complicações como infecções secundárias por Clostridium difficile, disfunção hepática, danos renais, citopenia e alterações na microbiota corporal. Marcadores diagnósticos baseados nas respostas inflamatórias do hospedeiro oferecem uma abordagem alternativa para o diagnóstico de infecções. No entanto, biomarcadores proteicos como a procalcitonina, embora amplamente utilizados em ambientes clínicos, estão longe de ser ideais para diagnosticar com precisão infecções bacterianas, uma vez que são propensos a falsos positivos e negativos.

Uma direção promissora é a análise das interações patógeno-hospedeiro no nível do transcriptoma, particularmente a expressão gênica diferencial do hospedeiro em resposta a vários patógenos. Esta área de pesquisa ganhou atenção significativa recentemente. Marcadores transcriptômicos derivados do sangue periférico de pacientes têm sido utilizados com sucesso no diagnóstico e estudo da patogênese de diversas doenças infecciosas.

Apesar desses avanços, os estudos que dependem do sequenciamento de RNA ou da tecnologia de chips transcriptômicos exigem equipamentos especializados e conhecimento em bioinformática, tornando-os caros e difíceis de implementar na prática clínica de rotina. Além disso, os resultados da análise do transcriptoma não são facilmente validados pela reação em cadeia da polimerase com transcrição reversa (RT-PCR), o "padrão ouro" para quantificação de RNA. Portanto, para tornar os marcadores diagnósticos baseados no transcriptoma mais aplicáveis ​​clinicamente, há necessidade de tecnologias em tempo real, como a PCR, para aumentar a precisão do diagnóstico de infecções e reduzir o uso indevido de medicamentos antibacterianos. Atualmente, a pesquisa nesta área permanece limitada.