Estudio clínico de un biomarcador de diagnóstico basado en transcriptomas para enfermedades febriles agudas

La fiebre aguda es una emergencia médica común en todo el mundo, causada con mayor frecuencia por infecciones bacterianas o virales. El diagnóstico diferencial temprano y rápido de las enfermedades infecciosas es crucial para mejorar los resultados de los pacientes. Si bien la detección de patógenos sigue siendo el estándar de oro para diagnosticar infecciones, métodos como el cultivo requieren mucho tiempo y a menudo carecen de sensibilidad. Además, la presencia de microorganismos colonizadores normales, como bacterias y virus en el cuerpo humano, puede provocar falsos positivos en la detección de patógenos. Estas limitaciones a menudo obligan a los médicos a confiar en la terapia antibacteriana empírica basada en los síntomas clínicos, lo que contribuye inadvertidamente al uso excesivo de antibióticos y al creciente problema de la resistencia bacteriana.

Además, el mal uso de fármacos antibacterianos en pacientes con infecciones no bacterianas puede provocar complicaciones como infecciones secundarias por Clostridium difficile, disfunción hepática, daño renal, citopenia y alteraciones en la microbiota del organismo. Los marcadores de diagnóstico basados ​​en las respuestas inflamatorias del huésped ofrecen un enfoque alternativo para el diagnóstico de infecciones. Sin embargo, los biomarcadores proteicos como la procalcitonina, aunque se utilizan ampliamente en entornos clínicos, están lejos de ser ideales para diagnosticar con precisión infecciones bacterianas, ya que son propensos a dar falsos positivos y negativos.

Una dirección prometedora es el análisis de las interacciones huésped-patógeno a nivel del transcriptoma, en particular la expresión genética diferencial del huésped en respuesta a diversos patógenos. Esta área de investigación ha ganado mucha atención recientemente. Los marcadores transcriptómicos derivados de la sangre periférica de los pacientes se han utilizado con éxito en el diagnóstico y estudio de la patogénesis de diversas enfermedades infecciosas.

A pesar de estos avances, los estudios que se basan en la secuenciación de ARN o la tecnología de chips transcriptomas requieren equipos especializados y experiencia en bioinformática, lo que los hace costosos y difíciles de implementar en la práctica clínica habitual. Además, los resultados del análisis del transcriptoma no se validan fácilmente mediante la reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa (RT-PCR), el "estándar de oro" para la cuantificación del ARN. Por lo tanto, para que los marcadores de diagnóstico basados ​​en transcriptomas sean más aplicables clínicamente, se necesitan tecnologías en tiempo real, como la PCR, para mejorar la precisión del diagnóstico de infecciones y reducir el uso indebido de fármacos antibacterianos. Actualmente, la investigación en esta área sigue siendo limitada.