Klinisk undersøgelse af transkriptom-baseret diagnostisk biomarkør for akut febersygdom

Akut feber er en almindelig medicinsk nødsituation verden over, oftest forårsaget af bakterielle eller virale infektioner. Tidlig og hurtig differentialdiagnose af infektionssygdomme er afgørende for at forbedre patientresultaterne. Mens patogendetektion fortsat er guldstandarden for diagnosticering af infektioner, er metoder som dyrkning tidskrævende og mangler ofte følsomhed. Derudover kan tilstedeværelsen af ​​normale koloniserende mikroorganismer, såsom bakterier og vira i menneskekroppen, føre til falske positiver i patogendetektion. Disse begrænsninger tvinger ofte læger til at stole på empirisk antibakteriel terapi baseret på kliniske symptomer, hvilket utilsigtet bidrager til overforbrug af antibiotika og det voksende problem med bakteriel resistens.

Endvidere kan misbrug af antibakterielle lægemidler hos patienter med ikke-bakterielle infektioner føre til komplikationer såsom sekundære infektioner med Clostridium difficile, leverdysfunktion, nyreskade, cytopeni og ændringer i kroppens mikrobiota. Diagnostiske markører baseret på værtens inflammatoriske responser tilbyder en alternativ tilgang til infektionsdiagnose. Imidlertid er proteinbiomarkører som procalcitonin, selvom de er udbredt i kliniske omgivelser, langt fra ideelle til nøjagtig diagnosticering af bakterielle infektioner, da de er tilbøjelige til falske positive og negative.

En lovende retning er analysen af ​​vært-patogen-interaktioner på transkriptomniveauet, især værtens differentielle genekspression som reaktion på forskellige patogener. Dette forskningsområde har fået stor opmærksomhed på det seneste. Transkriptomiske markører afledt af patienters perifere blod er med succes blevet brugt til at diagnosticere og studere patogenesen af ​​forskellige infektionssygdomme.

På trods af disse fremskridt kræver undersøgelser, der er afhængige af RNA-sekventering eller transkriptomchipteknologi, specialiseret udstyr og bioinformatikekspertise, hvilket gør dem dyre og udfordrende at implementere i rutinemæssig klinisk praksis. Derudover er resultaterne fra transkriptomanalyse ikke let valideret ved omvendt transkriptionspolymerasekædereaktion (RT-PCR), "guldstandarden" for RNA-kvantificering. For at gøre transkriptombaserede diagnostiske markører mere klinisk anvendelige er der derfor behov for realtidsteknologier, såsom PCR, for at øge nøjagtigheden af ​​infektionsdiagnose og reducere misbrug af antibakterielle lægemidler. I øjeblikket er forskningen på dette område begrænset.