Klinická studie diagnostického biomarkeru pro akutní febrilní onemocnění založeného na transkriptomu

Akutní horečka je celosvětově běžnou lékařskou pohotovostí, nejčastěji způsobenou bakteriálními nebo virovými infekcemi. Včasná a rychlá diferenciální diagnostika infekčních onemocnění je zásadní pro zlepšení výsledků pacientů. Zatímco detekce patogenů zůstává zlatým standardem pro diagnostiku infekcí, metody jako kultivace jsou časově náročné a často postrádají citlivost. Navíc přítomnost normálních kolonizujících mikroorganismů, jako jsou bakterie a viry v lidském těle, může vést k falešným pozitivům při detekci patogenů. Tato omezení často nutí lékaře spoléhat se na empirickou antibakteriální terapii založenou na klinických příznacích, což bezděčně přispívá k nadměrnému užívání antibiotik a rostoucímu problému bakteriální rezistence.

Kromě toho může zneužití antibakteriálních léků u pacientů s nebakteriálními infekcemi vést ke komplikacím, jako jsou sekundární infekce Clostridium difficile, dysfunkce jater, poškození ledvin, cytopenie a změny v tělesné mikrobiotě. Diagnostické markery založené na zánětlivých odpovědích hostitele nabízejí alternativní přístup k diagnostice infekce. Proteinové biomarkery, jako je prokalcitonin, i když jsou široce používány v klinických podmínkách, nejsou zdaleka ideální pro přesnou diagnostiku bakteriálních infekcí, protože jsou náchylné k falešně pozitivním a negativním výsledkům.

Slibným směrem je analýza interakcí hostitel-patogen na úrovni transkriptomu, zejména diferenciální genové exprese hostitele v reakci na různé patogeny. Tato oblast výzkumu získala v poslední době značnou pozornost. Transkriptomické markery odvozené z periferní krve pacientů byly úspěšně využívány při diagnostice a studiu patogeneze různých infekčních onemocnění.

Navzdory těmto pokrokům vyžadují studie založené na sekvenování RNA nebo technologii transkriptomových čipů specializované vybavení a bioinformatické znalosti, což je činí nákladnými a náročnými na implementaci v běžné klinické praxi. Navíc výsledky z analýzy transkriptomu nelze snadno ověřit pomocí reverzní transkripční polymerázové řetězové reakce (RT-PCR), "zlatého standardu" pro kvantifikaci RNA. Proto, aby byly diagnostické markery založené na transkriptomu klinicky použitelnější, je zapotřebí technologií v reálném čase, jako je PCR, ke zvýšení přesnosti diagnostiky infekcí a snížení zneužívání antibakteriálních léků. V současné době je výzkum v této oblasti omezený.