Klinisk studie av transkriptombasert diagnostisk biomarkør for akutt febersykdom

Akutt feber er en vanlig medisinsk nødsituasjon over hele verden, oftest forårsaket av bakterielle eller virusinfeksjoner. Tidlig og rask differensialdiagnose av infeksjonssykdommer er avgjørende for å forbedre pasientresultatene. Mens patogendeteksjon fortsatt er gullstandarden for å diagnostisere infeksjoner, er metoder som dyrking tidkrevende og mangler ofte følsomhet. I tillegg kan tilstedeværelsen av normale koloniserende mikroorganismer, som bakterier og virus i menneskekroppen, føre til falske positiver i patogendeteksjon. Disse begrensningene tvinger ofte leger til å stole på empirisk antibakteriell terapi basert på kliniske symptomer, som utilsiktet bidrar til overforbruk av antibiotika og det økende problemet med bakteriell resistens.

Videre kan misbruk av antibakterielle legemidler hos pasienter med ikke-bakterielle infeksjoner føre til komplikasjoner som sekundære infeksjoner med Clostridium difficile, leverdysfunksjon, nyreskade, cytopeni og endringer i kroppens mikrobiota. Diagnostiske markører basert på vertens inflammatoriske responser tilbyr en alternativ tilnærming til infeksjonsdiagnose. Imidlertid er proteinbiomarkører som procalcitonin, selv om de er mye brukt i kliniske omgivelser, langt fra ideelle for nøyaktig diagnostisering av bakterielle infeksjoner, siden de er utsatt for falske positive og negative.

En lovende retning er analysen av vert-patogen-interaksjoner på transkriptomnivå, spesielt det differensielle genuttrykket til verten som respons på forskjellige patogener. Dette forskningsområdet har fått betydelig oppmerksomhet den siste tiden. Transkriptomiske markører avledet fra pasienters perifere blod har blitt brukt med suksess for å diagnostisere og studere patogenesen til forskjellige infeksjonssykdommer.

Til tross for disse fremskrittene krever studier som er avhengige av RNA-sekvensering eller transkriptombrikketeknologi spesialisert utstyr og bioinformatikkekspertise, noe som gjør dem dyre og utfordrende å implementere i rutinemessig klinisk praksis. I tillegg er resultatene fra transkriptomanalyse ikke lett validert ved revers transkripsjonspolymerasekjedereaksjon (RT-PCR), "gullstandarden" for RNA-kvantifisering. Derfor, for å gjøre transkriptombaserte diagnostiske markører mer klinisk anvendelige, er det behov for sanntidsteknologier, slik som PCR, for å forbedre nøyaktigheten av infeksjonsdiagnostikk og redusere misbruk av antibakterielle legemidler. Foreløpig er forskningen på dette området begrenset.