SynapDx 자폐증 유전자 발현 분석 연구(STORY) (STORY)
SynapDx 자폐 스펙트럼 장애 유전자 발현 분석 연구
이 연구는 소아 발달 평가 센터에 소개된 생후 18개월 이상 60개월 미만의 약 880명의 어린이를 전향적으로 등록할 것입니다. 등록된 어린이는 RNA 유전자 발현 분석 및 선택적으로 대사물, 지질 및 DNA 분석을 위해 혈액을 채취하고 ASD 진단의 유무를 결정하기 위해 임상 평가를 받게 됩니다.
이 연구의 주요 목적은 다음과 같습니다.
- 자폐 스펙트럼 장애(ASD)의 유무에 대한 분류와 임상 평가 간의 일치를 최대화하기 위해 혈액 RNA 유전자 발현 패턴을 분류하는 알고리즘을 개발합니다.
이 연구의 2차 목표는 다음과 같습니다.
- 분류와 ASD의 존재 또는 부재에 대한 임상적 평가 사이의 일치를 최대화하는 방식으로 혈장 대사산물 및/또는 지질 프로필을 분류하는 알고리즘을 개발합니다.
- 가능한 발달 장애(DD)에 대해 발달 평가 클리닉에 의뢰된 아동으로 구성된 별도의 모집단에서 혈장 대사산물 및/또는 지질 프로파일 분류 알고리즘의 임상적 민감도 및 특이성을 전향적으로 평가하기 위해.
- 염색체 마이크로어레이 분석(CMA) 또는 게놈의 시퀀싱 단백질 코딩 영역에 의해 검출된 유전자 발현 서명, 대사산물 및/또는 지질 서명, ASD 관련 유전자 변이의 존재의 다양한 조합의 임상적 민감도 및 특이성을 평가합니다.
연구 개요
상태
상태
정황
정황
상세 설명
이 연구의 주요 목표는 ASD를 나타내는 유전자 발현 시그니처를 정의하고 임상적 민감도와 특이성을 확립하는 것입니다. ASD의 임상의 진단은 DSM-5를 참조 표준 도구로 사용하여 이루어집니다. 널리 사용되는 진단 도구인 ADOS-2(Autism Diagnostic Observation Schedule)는 ASD 진단을 받은 아동에 대한 임상 평가의 전형적인 구성 요소이며 이 평가는 모든 연구 참가자에게 수행됩니다. 이 연구의 2차 목적은 (1) ASD를 나타내는 대사산물 및 지질 시그니처를 정의하고 이들의 임상적 민감도 및 특이성을 확립하고 (2) 유전자 발현 시그니처, 대사산물 및/또는 지질 시그니처의 다양한 조합의 임상적 민감도 및 특이성을 결정하는 것입니다. 및 CMA에 의해 검출된 ASD 관련 유전자 변이의 존재 및 게놈의 시퀀싱 단백질 코딩 영역
분석: 분석의 세부 사항은 통계적 분석 계획(SAP)에 지정되며, 여기에는 특이점, 누락된 데이터 및 사이트 간 차이를 처리하는 절차가 포함됩니다. 검증 세트의 눈가림을 해제하기 전에 PI(주임 조사자) 위원회에서 SAP를 검토하고 승인합니다.
1차 분석: 연구의 1차 결과는 관련 95% 신뢰 구간과 함께 DSM-5 ASD 진단에 따라 피험자를 분류하기 위한 SDX-002 테스트의 임상적 민감도 및 특이성의 추정치입니다. 민감도 및 특이도는 DSM-5(2013년 5월 발행)에 의한 자폐증 스펙트럼 장애의 존재 또는 부재에 대한 임상 진단에 대한 동의를 기반으로 검증 단계 모집단에서 평가됩니다.
유전자 발현 서명은 부분 최소 제곱, 지원 벡터 머신 및 부스트 결정 트리를 포함한 여러 기계 학습 알고리즘의 결과에 대해 5중 교차 검증을 사용하여 500개의 주제 개발 단계 세트에서 훈련될 것입니다. 교육 절차는 각 방법에 대한 예상 ROC 곡선과 곡선 아래 영역(AUC)에 대한 신뢰 구간을 생성합니다. 기계 학습 알고리즘의 최종 선택은 AUC와 ROC 곡선에서 선택한 작동 지점의 예상 성능을 기반으로 합니다. 작동 지점은 수용 가능한 특이성에서 높은 감도를 제공하도록 선택됩니다.
2차 분석: 현재까지 등록된 대부분의 환자에서 선택적 생체 저장소 샘플 수집에 대한 동의를 얻었습니다. 생물 저장소 샘플에 대한 의도된 분석이 이제 확립되었습니다(또한 위에 나열된 2차 목표 참조). 신진대사 및 지방체 서명은 생물 저장소 샘플에 동의한 개발 단계 세트의 500명의 피험자 하위 집합에서 유사하게 평가됩니다. 유전자 발현 시그너처 외에도 대사산물 및/또는 지질 시그너처와 DNA 분석이 다양한 구성의 유전자 발현 시그너처와 결합될 것이며 이러한 추가 조치가 임상적 민감도 및 특이성에 미치는 영향을 평가할 것입니다. 이러한 추가 대사체/지방체 시그니처 및/또는 DNA 분석이 테스트 성능을 향상시키는 경우 이러한 요소가 SDX-002 분석에 포함될 수 있습니다.
최종 SDX-002 분석의 민감도 및 특이성은 인구통계학적 정보와 발달 테스트 결과를 사용하여 하위 집단 간에도 평가됩니다. 많은 하위 모집단에 피험자가 거의 없을 가능성이 높으며 결과 해석에 주의가 필요합니다. 계획된 부분 모집단 분석에는 성별, 연령, 민족, ASD DSM-IV-TR 진단 하위 범주, DSM-5 ASD 심각도 수준(사회적 커뮤니케이션 및 제한된 관심사/반복적 행동) 및 ADOS-2 점수가 포함됩니다.
연구 유형
연구 유형
등록 (예상)
등록
연락처 및 위치
연구 장소
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Arizona
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Scottsdale, Arizona, 미국, 85254
- Melmed Center
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California
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Long Beach, California, 미국, 90806
- Miller Children's Hospital
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Sacramento, California, 미국, 95817
- UC Davis MIND Institute
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Georgia
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Decatur, Georgia, 미국, 30033
- Emory University
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Illinois
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Chicago, Illinois, 미국, 60612
- Rush Medical Center
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Indiana
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Indianapolis, Indiana, 미국, 46202
- Riley Hospital for Children
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Massachusetts
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Boston, Massachusetts, 미국, 02115
- Children's Hospital Boston
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Lexington, Massachusetts, 미국, 02421
- Lurie Center Massachusetts General Hospital
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New York
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New York, New York, 미국, 10029
- Mount Sinai School of Medicine/Seaver Center
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Staten Island, New York, 미국, 10314
- Institute for Behavioral Research on Staten Island
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North Carolina
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Chapel Hill, North Carolina, 미국, 27517
- University of North Carolina at Chapel Hill
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Ohio
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Cincinnati, Ohio, 미국, 45229
- Cincinnati Children's Hospital Medical Center
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Columbus, Ohio, 미국, 43205
- Nationwide Children's Hospital
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Pennsylvania
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Philadelphia, Pennsylvania, 미국, 19104
- Children's Hospital of Philadelphia
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South Carolina
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Charleston, South Carolina, 미국, 29425
- Medical University of South Carolina
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Tennessee
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Nashville, Tennessee, 미국, 37212
- Vanderbilt University
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Texas
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Houston, Texas, 미국, 77054
- Baylor College of Medicine/Texas Children's Hospital
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Washington
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Seattle, Washington, 미국, 98121
- Seattle Children's
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Alberta
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Edmonton, Alberta, 캐나다, T5G 0B7
- Glenrose Rehabilitation Hospital
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Ontario
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Toronto, Ontario, 캐나다, M4G 1R8
- Holland Bloorview Kids Rehabilitation Hospital
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참여기준
자격 기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
연구 대상 성별
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- 고립된 운동 문제 이외의 가능한 발달 장애를 평가하기 위해 발달 평가 센터로 의뢰되었습니다.
- 18개월 이상 60개월 미만.
- 부모/법적 보호자는 연구에 대한 정보를 받았으며 정보에 입각한 동의서에 서명했습니다.
제외 기준:
- 자폐 스펙트럼 장애(즉, 여러 분야의 팀에 의한 사전 평가는 이미 자폐 스펙트럼 장애 진단을 확실하게 확립했습니다.)
- 연구 절차를 완료할 수 없거나 완료할 의사가 없습니다.
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
그룹/코호트 수
코호트 및 개입
그룹/코호트그룹/코호트 |
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개발 그룹
개발 단계에서는 분류 알고리즘이 완성될 때까지 분석이 수행됩니다.
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검증 그룹
검증 단계에서는 300명의 주제에서 최종 분류 알고리즘의 성능을 평가합니다.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
주요 결과 측정
결과 측정 |
기간 |
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말초 혈액에서 RNA 유전자 발현
기간: 수집일로부터 30일 이내
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수집일로부터 30일 이내
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2차 결과 측정
2차 결과 측정
결과 측정 |
기간 |
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말초 혈액의 대사 산물, 지질 및 DNA 변이
기간: 수집일로부터 30일 이내
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수집일로부터 30일 이내
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공동 작업자 및 조사자
수사관
수사관
- 연구 책임자: Barbara Rathmell, MD, SynapDx Corp
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작
연구 시작
기본 완료 (실제)
기본 완료
연구 완료 (실제)
연구 완료
연구 등록 날짜
최초 제출
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (추정)
처음 게시됨
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (추정)
마지막 업데이트 게시됨
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
마지막으로 확인됨
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
추가 관련 MeSH 약관
기타 연구 ID 번호
기타 연구 ID 번호
- 12002 (레지스트리 식별자: DAIDS-ES)
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