염증성 장질환에서 림프성 Tyrosine Phosphatase 유전자 다형성
이 연구는 다음을 목표로 합니다.
- PTPN22 유전자의 단일 염기 다형성(rs2476601, rs33996649 및 rs2488457)과 염증성 장 질환 사이의 연관성을 조사합니다.
- 연구된 SNP와 질병 활동/치료에 대한 반응 사이의 관계를 연관시키기 위해.
연구 개요
상태
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정황
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개입 / 치료
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상세 설명
염증성 장질환(IBD)은 크론병(CD) 및 궤양성 대장염(UC)으로 나타나는 위장관의 만성 염증성 장애로, 임상적 질병 활동의 에피소드에 의해 중단되는 완화 기간을 임상적으로 특징으로 합니다(Zallot et al., 2013). ). IBD 환자는 심한 설사, 통증, 피로, 체중 감소와 같은 몇 가지 일반적인 증상을 나타내지만 국소화는 약간 다릅니다. ).
Lennard-Jones et al. 크론병의 진단을 확립하기 위해 거시적 및 현미경적 기준을 정의했습니다. 육안 진단 도구에는 신체 검사, 내시경 및 방사선이 포함됩니다. 현미경적 특징은 점막 생검 및/또는 수술 표본에서 평가할 수 있습니다. 진단은 불연속적이고 종종 육아종성 장 염증의 소견에 달려 있습니다(Lennard-Jones et al., 1997). 궤양성 대장염의 진단은 병력, 내시경 소견, 다발성 점막 생검의 조직병리학 및 적절한 방사선학을 기반으로 합니다(Silverberg et al., 2005, Satsangi et al., 2006).
궤양성 대장염의 발생 패턴은 지난 20년 동안 서양에서 발생률이 계속 증가하고 아시아 및 중동과 같이 이전에 발생률이 낮았던 지역(100,000명당 0.15-6.5명)에서 발생률이 증가하면서 변화했습니다(Ng et al., 2017 ). 15년 동안(1995-2009) UC 진단의 현저한 증가가 기록되었습니다. 카이로 대학에서는 1995-1999년에 17건, 2005-2009년에 76건이 기록되었다(Esmat et al., 2014).
CD와 UC는 둘 다 유전적으로 복잡한 질병이며, 수백 개의 독립적인 유전자좌가 질병 감수성에 기여합니다(Norouzinia et al., 2015). 그럼에도 불구하고 많은 IBD 관련 유전자의 분자 메커니즘과 기능은 아직 알려지지 않았습니다. 유전학 외에도 IBD는 미생물학적 및 환경적 측면의 강력한 영향을 받습니다(Norouzinia et al., 2017).
GWAS(Genome-wide 연관 연구)는 IBD에 대한 더 나은 이해를 가능하게 하여 UC 및 CD에 대한 여러 유전적 감수성 유전자좌가 확인되었습니다(Yamamoto-Furusho et al., 2015). 관련된 유전적 요인 중에는 IBD 진행에 대한 감수성 또는 보호 효과와 관련된 면역 시스템 분자의 여러 다형성이 있지만, 주로 발병(성인 또는 소아), 샘플 크기 차이 및 인종 의존적 유전적 배경(Neuman et al., 2012, Ng et al., 2012, Peng et al., 2017, Girardelli et al., 2018).
PTPN22 단백질은 N-말단 PTP 촉매 도메인; 도메인간 영역; 및 다른 단백질과의 상호 작용을 위한 모티프로 기능하는 4개의 프롤린이 풍부한 영역이 있는 C-말단 도메인(Stanford et al., 2014). 티로신 포스파타아제는 장 상피 장벽 기능 유지, 자가포식소체 기능 및 침입 박테리아에 대한 면역 반응 조절에 관여합니다. 장 세포에서 장의 전 염증성 사이토카인 분비를 제한할 뿐만 아니라 생체 내에서 CD4+ T 세포의 분화 및 기능을 제어합니다(Spalinger et al., 2015). PTPN22에 의해 암호화된 림프성 티로신 포스파타제(Lyp)는 T 세포 수용체 활성화 의존 키나아제(Csk 키나아제)를 탈인산화함으로써 T 세포 활성화의 음성 조절자로서 중요한 역할을 합니다(Cloutier et al., 1999). PTPN22는 NLRP3 티로신 인산화를 조절함으로써 NLRP3 인플라마솜(Nod Like Receptor Family Pyrine Domain Containing 3)의 중요한 조절자입니다. 또한, PTPN22는 자가포식 의존적 방식으로 NLRP3 매개 IL-1베타 분비를 조절합니다(Yilmaz et al., 2018).
PTPN22 유전자는 1번 염색체 단완(1p13.2)에 위치한다. 유전자에는 24개의 엑손이 있다(NCBI 웹사이트). PTPN22 유전자에서 약 21개의 SNP가 발견되었다(rs1310182, rs3789604, rs33996649, rs1217414, rs2476601, rs12760457, rs2488457,,,,etc). SNP rs2476601> ex5onT>(C18) 14는 아르기닌 620을 단백질 산물(620W 변이체라고 함)의 트립토판 잔기로 대체합니다(Spalinger et al., 2016). 엑손 10의 SNP rs33996649(G788>A)는 아르기닌 263의 글루타민 잔기(263Q 변이체라고 함)로의 치환을 매개하고 Lyp가 Csk 키나아제와 상호 작용하는 능력에 영향을 미치므로 복합체 형성 및 결과적인 억제를 피합니다. T 세포 활성화(Hedjoudje et al., 2017) . SNP rs2488457(G-1123>C)은 프로모터 영역에 위치한다(Chen et al., 2013). 위치 -1123에서 활성제 단백질 4(AP-4)에 대한 전사 인자 결합 부위는 G의 존재 하에서 예측된다. C 대립유전자가 아닌 대립유전자(Jüliger et al., 2003).
PTPN22 유전자 SNP와 IBD의 연관성에 관한 모순된 결과가 발표되었습니다(Bank et al., 2014, Sfar et al., 2010, Chen et al., 2013, Latiano et al., 2007, Diaz-Gallo et al., 2011, Wagenleiter 등, 2005, Zaid 등, 2018, Sadr 등, 2019).
이집트에서는 PTPN22 유전자 SNP와 Type1 DM(El-Kafoury et al., 2014), ITP(Anis et al., 2011), SLE(Elghzaly et al., 2015), 원형탈모증( El-Zawahry et al., 2013) 및 RA(Salama et al., 2014)}.
최근 이집트에서 PTPN22 유전자 SNP와 IBD의 연관성에 관한 연구는 발표되지 않았습니다.
연구 유형
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연락처 및 위치
연구 연락처
연구 연락처
- 이름: menna refaat, Ass lecturer
- 전화번호: 01011490613
- 이메일: mennarefaat924@gmail.com
연구 연락처 백업
- 이름: eman reda, lecturer
- 전화번호: 01001838796
참여기준
자격 기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
연구 대상 성별
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- 염증성 장질환 환자
제외 기준:
- 전신성 자가면역 질환(RA,SLE) 환자는 연구에서 제외됩니다.
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
그룹/코호트 수
코호트 및 개입
그룹/코호트그룹/코호트 |
개입 / 치료개입 / 치료 |
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ㅏ
염증성 장질환 환자
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PCR-제한 조각 길이 다형성
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비
건강한 과목
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PCR-제한 조각 길이 다형성
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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Lymphoid Tyrosine Phosphatase 유전자(rs2476601, rs33996649 및 rs2488457)의 단일 염기 다형성과 염증성 장질환과의 연관성
기간: 기준선
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림프성 티로신 포스파타제 유전자(exon10의 SNP(G788>A), 엑손 14의 SNP(C1858>T) 및 프로모터 영역의 SNP(G-1123>C))에서 3개의 단일 염기 다형성이 진단된 100명의 환자에서 평가될 것입니다. 염증성 장 질환과 100명의 건강한 피험자를 PCR-RFLP(Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism)로 분석하여 이러한 다형성과 염증성 장 질환 사이의 연관성을 탐지했습니다.
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기준선
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2차 결과 측정
2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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연구된 SNP와 질병 활동/치료에 대한 반응 사이의 관계를 연관시키기 위해.
기간: 기준선
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Serum Erythrocyte Sedimentation Rate, C-Reactive Protien, Anti Nuclear Antibody, Antineutrophil Cytoplasmic Antibody (ANCA) and Anti Saccharomyces Cerevisiae (ASCA) 및 분변 칼프로텍틴이 모든 환자에게 실시됩니다. LYP에서 조사된 세 가지 다형성은 질병 활동 및 IBD 환자의 치료 반응.
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기준선
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공동 작업자 및 조사자
간행물 및 유용한 링크
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연구 주요 날짜
연구 시작 (예상)
연구 시작
기본 완료 (예상)
기본 완료
연구 완료 (예상)
연구 완료
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- LYP polymorphisms in IBD
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