대장암 환자 맞춤형 화학요법 평가를 위한 스플라이싱 기반 예측 학습 (SPLICE)
대장암 개인별 화학요법 평가를 위한 접합 기반 예측 학습 (SPLICE)
대장암(CRC)은 전 세계적으로 암 관련 사망의 주요 원인 중 하나로 남아 있습니다. 근치적 절제술 후 보조 화학요법이 생존율을 향상시키지만, 그 효과는 환자마다 크게 다릅니다. 신뢰할 수 있는 예측 바이오마커의 부재는 종종 과도한 치료 또는 불충분한 치료로 이어집니다.
이 연구는 종양 유래 대체 스플라이싱 서명을 사용하여 보조 화학요법 반응에 대한 기계 학습 기반 예측 모델을 개발하는 것을 목표로 합니다.
RNA-seq 데이터, 스플라이싱 아이소폼 및 임상 결과를 통합하여, 이 연구는 수술 후 치료 반응 및 재발 위험의 분자적 예측 인자를 식별하고자 합니다.
연구 개요
상태
상태
정황
정황
개입 / 치료
개입 / 치료
상세 설명
대장암(CRC)은 치유적 절제 후 보조 화학요법이 표준 치료법임에도 불구하고 여전히 주요 글로벌 건강 부담으로 남아 있습니다. 그러나 환자의 치료 반응은 크게 다양하며, 현재 검증된 분자 모델이 보조 치료 선택을 안내하지는 않습니다.
최근 연구들은 유전자 수준 발현만이 아닌 비정상적인 선택적 스플라이싱이 화학요법 민감도와 종양 재발 형성에 결정적인 역할을 한다고 시사합니다. 그럼에도 이러한 복잡한 전사체적 변이는 표준 발현 차이 분석에서 종종 놓치게 됩니다.
ASPAIRE 프레임워크(Alternative Splicing and Predictive mAchIne learnIng for Response Evaluation)는 고급 계산 모델링을 적용하여 RNA-seq 데이터에서 다차원 스플라이싱 특징을 포착하고 이를 임상적으로 실행 가능한 예측으로 변환합니다.
본 연구에서 연구진은 기계 학습을 활용하여 대장암의 보조 화학요법 반응을 예측할 것입니다. 연구 계획은 세 단계로 진행됩니다:
- RNA 시퀀싱 및 계산 특징 추출을 통한 보조 화학요법 반응과 관련된 선택적 스플라이싱 패턴 식별
- 연구진은 역전사 정량적 중합효소 연쇄반응(RT-qPCR) 기반 분석법을 개발하고 화학요법 반응을 예측하기 위한 기계 학습 모델을 훈련시킬 것입니다.
- 연구진은 분석법을 독립적으로 검증할 것입니다. 이 분석법은 잠정적으로 "SPLICE"(대장암 개인별 화학요법 평가를 위한 스플라이싱 기반 예측 학습)로 명명되었으며, 치료 후 최대 5년까지의 무병 생존율을 대상으로 검증될 것입니다.
본 연구 종료 시, 이 분석법은 무병 생존율을 예측함으로써 임상적 의사 결정을 지원하기 위해 개발 및 검증될 것입니다.
연구 유형
연구 유형
등록 (추정된)
등록
연락처 및 위치
연구 연락처
연구 연락처
- 이름: Ajay Goel, PhD
- 전화번호: 626-218-3452
- 이메일: ajgoel@coh.org
연구 장소
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California
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Duarte, California, 미국, 91010
- 모병
- City of Hope Medical Center
-
연락하다:
- Ajay Goel, PhD
- 전화번호: 626-218-3452
- 이메일: ajgoel@coh.org
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참여기준
자격 기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 성인
- 고령자
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- 조직학적으로 확인된 2-3기 대장암 (TNM 분류, 8판)
- 근치적 절제술 후 표준 보조 화학요법을 받은 경우
- 화학요법 전 종양 조직(FFPE 또는 동결) 이용 가능
- 결과 분석(재발, 생존)을 위한 충분한 임상 데이터
- 18-80세 연령
제외 기준:
- 염증성 장질환
- 부적절한 RNA 품질 또는 동의서 부재
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
그룹/코호트 수
코호트 및 개입
그룹/코호트그룹/코호트 |
개입 / 치료개입 / 치료 |
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대장암 무반응군 (훈련 코호트)
대장암의 비반응자로서 첫 번째 코호트에서 원발 종양 치료 후 60개월 이내에 재발성 대장암이 발생한 환자
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주종양에서 유래된 조직 샘플에서 그 수준이 검사되는 RNA 스플라이싱 아이소폼 패널
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대장암 반응군(훈련 코호트)
1차 코호트에서 원발성 종양 치료 후 60개월 이내에 재발성 대장암(CRC)이 발생하지 않은 대장암 반응군
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주종양에서 유래된 조직 샘플에서 그 수준이 검사되는 RNA 스플라이싱 아이소폼 패널
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대장암 재발 환자 중 반응이 없는 환자 (검증 코호트)
주 종양 치료 후 60개월 이내에 재발성 대장암이 발생한 대장암 비반응자군, 두 번째 독립 검증 코호트에서
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주종양에서 유래된 조직 샘플에서 그 수준이 검사되는 RNA 스플라이싱 아이소폼 패널
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대장암 반응군 (검증 코호트)
두 번째 독립 검증 코호트에서 원발 종양 치료 후 60개월 이내에 재발성 대장암이 발생하지 않은 대장암 반응자
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주종양에서 유래된 조직 샘플에서 그 수준이 검사되는 RNA 스플라이싱 아이소폼 패널
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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무재발생 생존
기간: 질병 치료 시작일부터 사망일까지 또는 최대 60개월까지
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대장암 치료 후 재발까지의 시간
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질병 치료 시작일부터 사망일까지 또는 최대 60개월까지
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2차 결과 측정
2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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전체 생존율
기간: 질병 치료 시작일부터 사망일까지 또는 최대 60개월
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질환 치료 시작부터 모든 원인으로 인한 사망까지의 기간
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질병 치료 시작일부터 사망일까지 또는 최대 60개월
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공동 작업자 및 조사자
수사관
수사관
- 수석 연구원: Ajay Goel, PhD, City of Hope Medical Center
간행물 및 유용한 링크
일반 간행물
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연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
연구 시작
기본 완료 (추정된)
기본 완료
연구 완료 (추정된)
연구 완료
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QC 기준을 충족하는 최초 제출
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마지막으로 확인됨
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이 연구와 관련된 용어
기타 연구 ID 번호
기타 연구 ID 번호
- 23228/SPLICE
개별 참가자 데이터(IPD) 계획
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IPD 계획 설명
약물 및 장치 정보, 연구 문서
미국 FDA 규제 의약품 연구
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
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