분명히 균형 잡힌 염색체 전좌/차세대 시퀀싱/지적 장애 (ANI)

비정상적인 표현형과 관련된 분명히 균형 잡힌 염색체 재배열(ABCR)은 드물지만 문제가 있는 사건입니다. de novo reciprocal translocations의 6%와 de novo inversions의 9%에서 발생합니다. 지적 장애 및/또는 다발성 선천성 기형(ID/MCA)을 포함하는 비정상적인 표현형은 어레이-CGH로 검출할 수 있는 관련 숨겨진 게놈 불균형 또는 중단점에서의 유전자 파괴로 설명될 수 있습니다. 그러나 기존 방법(즉, 형광 in situ 하이브리드화(FISH), 서던 블롯)을 사용한 중단점 복제는 종종 힘들고 시간이 많이 걸리며 일상적으로 수행할 수 없습니다. 이러한 재배열에 대한 완전한 조사가 없으면 유전 상담은 진정한 도전입니다. 최근 조사자들과 다른 연구자들은 NGS(Next-Generation Sequencing)가 분자 수준에서 ABCR 중단점을 특성화하는 강력하고 신속한 기술임을 보여주었습니다.

ANI 프로젝트(ABCR NGS ID)는 NGS를 사용하여 지적 장애 및/또는 다발성 선천성 기형(ID/MCA)을 나타내는 55명의 환자의 분자 수준 ABCR에서 특성화하는 것을 목표로 합니다. 연구자들은 게놈 불균형이 이전에 어레이-비교 게놈 혼성화(CGH)에 의해 제외되었을 것이기 때문에 ABCR이 유전자 파괴 또는 위치 효과에 의해 환자 표현형을 설명한다는 가설을 세웁니다.

ANI 프로젝트는 프랑스 병원 세포유전학 연구소 19곳과 연구팀(TIGER), 세포생명공학센터 등 21개 파트너로 구성된 컨소시엄이 3년간 진행하는 연구다. 각 세포유전학 실험실에서 환자를 모집합니다. ABCR 중단점은 NGS와 최초의 생물 정보학 분석에 의해 분자적으로 특성화될 것입니다. 결과는 PCR(polymerase chain reaction)에 의한 접합부 단편의 증폭에 이어 Sanger 시퀀싱으로 확인되어 염기쌍 수준에서 중단점의 위치를 ​​파악할 수 있습니다. 일부 복잡한 경우 결과를 명확히 하기 위해 FISH 실험이 필요할 수 있습니다. 두 번째 생물 정보학 분석은 중단점의 특성(서열, 반복 요소, 유전자 및 조절 요소)을 결정합니다. 마지막으로, 각 중단점에 대해 중단점에 의해 파괴된 유전자와 두 개의 인접 유전자를 포함하여 유전자 발현 연구가 수행됩니다. 이러한 모든 데이터는 문헌 및 데이터베이스에서 이미 사용 가능한 데이터와 함께 유전자가 환자의 표현형을 설명할 수 있는지 결정하기 위해 통합되어 적절한 유전 상담을 허용합니다.

이 프로젝트는 ID 및 발달 이상과 관련된 새로운 후보 유전자를 식별할 것입니다. 또한 ABCR 및 ID/MCA의 진단 도구로서 NGS의 개발 및 평가에 기여할 것입니다. 또한 특히 위치 효과 측면에서 ABCR의 풀림 메커니즘 및 기능적 결과를 허용합니다.

결론적으로 ANI 프로젝트는 ID/MCA 및 ABCR 환자의 진단 관리 및 유전 상담 개선에 기여할 것입니다. 또한 ABCR 생리 병리학의 이해와 발달 및 뇌 기능에 관련된 경로의 해명에 기여하여 일반적으로 ID/MCA 환자에 대한 유전 상담을 개선할 것입니다.