表观平衡染色体易位/下一代测序/智力障碍 (ANI)

显然与异常表型相关的平衡染色体重排 (ABCR) 是一种罕见但有问题的事件。 它发生在 6% 的从头相互易位和 9% 的从头倒位中。 异常表型，包括智力障碍和/或多发性先天性异常 (ID/MCA)，可以通过阵列 CGH 检测到的相关隐性基因组失衡或断点处的基因破坏来解释。 然而，使用传统方法（即荧光原位杂交 (FISH)、Southern 印迹）进行断点克隆通常费时费力，无法常规进行。 如果不对这些重排进行全面调查，遗传咨询将是一个真正的挑战。 最近，研究人员和其他人表明，下一代测序 (NGS) 是一种在分子水平上表征 ABCR 断点的强大而快速的技术。

ANI 项目 (ABCR NGS ID) 旨在使用 NGS 在分子水平上表征 55 名患有智力障碍和/或多种先天性异常 (ID/MCA) 的患者的 ABCR。 研究人员假设 ABCR 通过基因破坏或位置效应解释了患者的表型，因为基因组失衡先前已被阵列比较基因组杂交 (CGH) 排除。

ANI 项目是一项为期 3 年的研究，将由 21 个合作伙伴组成的联盟进行，其中包括 19 个法国医院细胞遗传学实验室、一个研究团队 (TIGER) 和一个细胞生物技术中心。 患者将由每个细胞遗传学实验室招募。 ABCR 断点将通过 NGS 和第一次生物信息学分析进行分子表征。 结果将通过聚合酶链反应 (PCR) 扩增连接片段，然后进行 Sanger 测序来验证，从而允许在碱基对水平上定位断点。 在一些复杂的情况下，有必要进行 FISH 实验来阐明结果。 然后，第二个生物信息学分析将确定断点的特征（序列、重复元素、基因和调控元素）。 最后，对于每个断点，将进行基因表达研究，包括被断点破坏的基因和两个相邻基因。 所有这些数据，连同文献和数据库中已有的数据，将被整合以确定该基因是否可以解释患者的表型，从而允许进行适当的遗传咨询。

该项目将确定涉及 ID 和发育异常的新候选基因。 它还将有助于开发和评估 NGS 作为 ABCR 和 ID/MCA 的诊断工具。 它还将允许揭示 ABCR 的机制和功能后果，特别是在位置效应方面。

总之，ANI 项目将有助于改进 ID/MCA 和 ABCR 患者的诊断管理和遗传咨询。 它还将有助于理解 ABCR 生理病理学和揭示发育和脑功能所涉及的通路，从而改善对一般 ID/MCA 患者的遗传咨询。