표본 내 미생물 식별을 위한 MiSeq 평가
배경:
연구자들은 병원에 있는 사람들에게 무엇이 감염을 일으키는지 알아내기 위한 새로운 방법을 테스트하고 있습니다.
현재 기술은 사람의 샘플에 대한 화학적 또는 생물학적 테스트를 사용합니다. 샘플은 혈액, 조직, 대변, 타액, 소변 등입니다. 연구원들은 MiSeq이라는 장치를 사용하는 새로운 기술을 테스트하고 있습니다. 샘플의 모든 DNA(유전 물질)를 시퀀싱할 수 있습니다. 이것은 감염을 일으키는 박테리아, 진균 및 바이러스와 같은 미생물을 보여줄 수 있습니다. 연구자들은 새로운 테스트가 현재 테스트보다 더 잘 작동하는지 알고 싶어합니다. 그들은 약 250개의 샘플을 살펴봄으로써 이를 수행할 것입니다.
목적:
감염을 유발하는 미생물을 식별하기 위해 MiSeq이 현재 테스트와 같거나 더 나은지 테스트합니다.
적임:
일상적인 미생물 검사를 위해 샘플을 Microbiology Service의 실험실로 보낸 NIH 환자.
설계:
참가자는 연구에 사용되는 일상적인 의료 서비스의 일부로 자신이 제공한 샘플을 사용하는 데 동의합니다. 18세 미만의 경우 부모 또는 법적 보호자가 동의합니다.
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연구 개요
상태
정황
상세 설명
이 연구의 목적은 시퀀스 분석에 필요한 관련 컴퓨터 인프라 및 생물 정보학 소프트웨어와 함께 차세대 DNA 시퀀싱 기기인 Illumina MiSeq를 사용하는 테스트를 평가하고 최적화하는 것입니다. 이 시스템은 궁극적으로 NIH Clinical Center Department of Laboratory Medicine에서 일차 환자 검체에서 감염원을 식별하기 위해 사용하기 위한 것입니다. 1차 표본의 전체 DNA 시퀀싱을 기반으로 하는 차세대 시퀀싱 기술은 고전적인 미생물학적 접근 방식에 비해 많은 이점이 있을 것으로 예상됩니다. 여기에는 배양이 어렵거나 불가능할 수 있는 1차 표본에서 직접 병원균을 검출하는 것이 포함됩니다.
이 연구에서는 폐기된 환자 샘플과 부검 재료를 MiSeq 시스템으로 테스트하여 박테리아, 바이러스 및 기타 병원체를 식별하고 분류합니다. 이 연구의 목적을 위해 샘플이라는 용어는 면봉, 조직 생검, 혈액, 대변, 타액, 소변, 상처 등과 같은 모든 샘플을 의미합니다. 시퀀싱 결과를 분석하는 조사관은 MiSeq 시스템으로 테스트할 검체의 검증 하위 집합에 대한 미생물 배양 결과에 대해 눈이 멀게 됩니다. MiSeq 분석 결과는 실험실 정보 시스템(SCC SOFT Computer [Clearwater, FL, USA]의 소프트웨어)에 저장된 Microbiology Services 공식 배양 결과와 비교할 수 있는 형식으로 변환됩니다.
연구 유형
등록 (실제)
연락처 및 위치
연구 장소
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Maryland
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Bethesda, Maryland, 미국, 20892
- National Institutes of Health Clinical Center
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준
- 폐기된 표본은 이 연구에 사용됩니다.
- 검체를 채취한 환자는 동의를 받아야 합니다.
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
- 관찰 모델: 다른
- 시간 관점: 유망한
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
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견본
폐기된 환자 샘플 및 부검 재료
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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시퀀스 분석에 필요한 관련 컴퓨터 인프라 및 생물정보학 소프트웨어와 함께 차세대 DNA 시퀀싱 기기인 Illumina MiSeq를 사용하는 테스트를 평가하고 최적화합니다.
기간: 연구 완료시
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시퀀스 분석에 필요한 관련 컴퓨터 인프라 및 생물정보학 소프트웨어와 함께 차세대 DNA 시퀀싱 기기인 Illumina MiSeq를 사용하는 테스트를 평가하고 최적화합니다.
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연구 완료시
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공동 작업자 및 조사자
수사관
- 수석 연구원: Adrian M Zelazny, Ph.D., National Institutes of Health Clinical Center (CC)
간행물 및 유용한 링크
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (실제)
연구 완료 (실제)
연구 등록 날짜
최초 제출
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처음 게시됨 (추정된)
연구 기록 업데이트
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