Avaliação do MiSeq para identificação microbiana em amostras
Fundo:
Os pesquisadores estão testando uma nova maneira de descobrir o que causa infecções em pessoas em hospitais.
As técnicas atuais usam testes químicos ou biológicos em amostras de uma pessoa. As amostras são sangue, tecido, fezes, saliva, urina, etc. Os pesquisadores estão testando novas técnicas que usam um dispositivo chamado MiSeq. Ele pode sequenciar todo o DNA (material genético) em uma amostra. Isso pode mostrar microorganismos, como bactérias, fungos e vírus que causam infecção. Os pesquisadores querem saber se o novo teste funciona tão bem ou melhor do que os testes atuais. Eles farão isso observando cerca de 250 amostras.
Objetivo:
Para testar se o MiSeq funciona tão bem ou melhor que os testes atuais para identificar microorganismos que causam infecção.
Elegibilidade:
Pacientes do NIH cujas amostras foram enviadas ao laboratório do Serviço de Microbiologia para testes microbiológicos de rotina.
Projeto:
Os participantes consentirão que as amostras que forneceram como parte de seus cuidados médicos de rotina sejam usadas no estudo. Para menores de 18 anos, um dos pais ou responsável legal consentirá.
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Visão geral do estudo
Status
Condições
Descrição detalhada
O objetivo deste estudo é avaliar e otimizar o teste que usa um instrumento de sequenciamento de DNA de última geração, o Illumina MiSeq, juntamente com a infraestrutura de computador associada e o software de bioinformática necessários para a análise de sequência. Esse sistema destina-se, em última análise, ao uso do Departamento de Medicina Laboratorial do Centro Clínico do NIH para identificar agentes infecciosos em amostras primárias de pacientes. Espera-se que as técnicas de sequenciamento de próxima geração baseadas no sequenciamento do DNA total de espécimes primários tenham muitas vantagens sobre as abordagens microbiológicas clássicas. Isso inclui a detecção de patógenos diretamente de amostras primárias que podem ser difíceis ou impossíveis de cultivar.
Neste estudo, amostras descartadas de pacientes e material de autópsia serão testadas com o sistema MiSeq para identificar e classificar bactérias, vírus e outros patógenos. Para efeitos deste estudo, o termo amostras refere-se a qualquer amostra, como zaragatoas, biópsias de tecidos, sangue, fezes, saliva, urina, feridas, etc. Os investigadores que analisam os resultados do sequenciamento serão cegos para os resultados da cultura microbiológica para um subconjunto de validação de amostras a serem testadas com o sistema MiSeq. Os resultados da análise do MiSeq serão convertidos em um formulário que pode ser comparado com os resultados da cultura oficial dos Serviços de Microbiologia que estão armazenados no sistema de informações do laboratório (software da SCC SOFT Computer [Clearwater, FL, EUA]).
Tipo de estudo
Inscrição (Real)
Contactos e Locais
Locais de estudo
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Maryland
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Bethesda, Maryland, Estados Unidos, 20892
- National Institutes of Health Clinical Center
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Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
Aceita Voluntários Saudáveis
Método de amostragem
População do estudo
Descrição
CRITÉRIO DE INCLUSÃO
- Espécimes descartados serão usados para este estudo.
- Os pacientes dos quais as amostras são derivadas devem ser consentidos.
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
- Modelos de observação: Outro
- Perspectivas de Tempo: Prospectivo
Coortes e Intervenções
Grupo / Coorte |
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Amostra
Amostras de pacientes descartadas e material de autópsia
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Avalie e otimize os testes que usam um instrumento de sequenciamento de DNA de última geração, o Illumina MiSeq, juntamente com a infraestrutura de computador associada e o software de bioinformática necessários para a análise de sequenciamento
Prazo: Na conclusão do estudo
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Avalie e otimize os testes que usam um instrumento de sequenciamento de DNA de última geração, o Illumina MiSeq, junto com a infraestrutura de computador associada e o software de bioinformática necessários para a análise de sequenciamento
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Na conclusão do estudo
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Investigadores
- Investigador principal: Adrian M Zelazny, Ph.D., National Institutes of Health Clinical Center (CC)
Publicações e links úteis
Links úteis
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Conclusão Primária (Real)
Conclusão do estudo (Real)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Estimado)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- 160001
- 16-CC-0001
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
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