MiSeqin arviointi mikrobien tunnistamiseksi näytteissä
Tausta:
Tutkijat testaavat uutta tapaa selvittääkseen, mikä aiheuttaa infektioita sairaaloissa.
Nykytekniikat käyttävät kemiallisia tai biologisia testejä henkilön näytteille. Näytteitä ovat verta, kudosta, ulostetta, sylkeä, virtsaa jne. Tutkijat testaavat uusia tekniikoita, jotka käyttävät MiSeq-nimistä laitetta. Se voi sekvensoida kaiken DNA:n (geneettisen materiaalin) näytteessä. Tämä voi näyttää mikro-organismeja, kuten bakteereja, sieniä ja viruksia, jotka aiheuttavat infektioita. Tutkijat haluavat tietää, toimiiko uusi testi yhtä hyvin vai paremmin kuin nykyiset testit. He tekevät tämän tarkastelemalla noin 250 näytettä.
Tavoite:
Testaa, toimiiko MiSeq yhtä hyvin tai paremmin kuin nykyiset testit infektioita aiheuttavien mikro-organismien tunnistamiseksi.
Kelpoisuus:
NIH-potilaat, joiden näytteet on lähetetty mikrobiologian laitoksen laboratorioon rutiininomaisiin mikrobiologisiin tutkimuksiin.
Design:
Osallistujat suostuvat siihen, että tutkimuksessa käytetään osana rutiinihoitoaan antamiaan näytteitä. Alle 18-vuotiaille vanhemman tai laillisen huoltajan suostumuksen antaa.
...
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Yksityiskohtainen kuvaus
Tämän tutkimuksen tarkoituksena on arvioida ja optimoida testausta, jossa käytetään seuraavan sukupolven DNA-sekvensointilaitetta, Illumina MiSeqiä, sekä siihen liittyvää tietokoneinfrastruktuuria ja sekvenssianalyysiin tarvittavaa bioinformatiikkaohjelmistoa. Tämä järjestelmä on viime kädessä tarkoitettu NIH:n kliinisen keskuksen laboratoriolääketieteen osaston käyttöön tartunnanaiheuttajien tunnistamiseen ensisijaisista potilasnäytteistä. Ensimäisten näytteiden kokonais-DNA:n sekvensointiin perustuvilla seuraavan sukupolven sekvensointitekniikoilla odotetaan olevan monia etuja klassisiin mikrobiologisiin lähestymistapoihin verrattuna. Näitä ovat patogeenien havaitseminen suoraan primaarinäytteistä, joita voi olla vaikea tai mahdoton viljellä.
Tässä tutkimuksessa poistetut potilasnäytteet ja ruumiinavausmateriaali testataan MiSeq-järjestelmällä bakteerien, virusten ja muiden patogeenien tunnistamiseksi ja luokittamiseksi. Tässä tutkimuksessa termillä näytteet tarkoitetaan mitä tahansa näytteitä, kuten vanupuikkoja, kudosbiopsioita, verta, ulosteita, sylkeä, virtsaa, haavaa jne. Sekvensointituloksia analysoivat tutkijat sokeutuvat mikrobiologisen viljelyn tuloksiin MiSeq-järjestelmällä testattavien näytteiden validointiosajoukon osalta. MiSeq-analyysin tulokset muunnetaan muotoon, jota voidaan verrata laboratorion tietojärjestelmään (SCC SOFT Computerin [Clearwater, FL, USA]) tallennettuihin Microbiology Servicesin virallisiin viljelytuloksiin.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
Maryland
-
Bethesda, Maryland, Yhdysvallat, 20892
- National Institutes of Health Clinical Center
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
SISÄLLYTTÄMISKRITEERIT
- Tässä tutkimuksessa käytetään hylättyjä näytteitä.
- Potilailta, joilta näytteet on saatu, vaaditaan suostumus.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Muut
- Aikanäkymät: Tulevaisuuden
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
|---|
|
Näyte
Potilasnäytteet ja ruumiinavausmateriaali on hävitetty
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Arvioi ja optimoi testaus, joka käyttää seuraavan sukupolven DNA-sekvensointiinstrumenttia, Illumina MiSeqia, sekä siihen liittyvää tietokoneinfrastruktuuria ja bioinformatiikkaohjelmistoa, jotka tarvitaan sekvenssianalyysiin
Aikaikkuna: Opintojen päätyttyä
|
Arvioi ja optimoi testaus, jossa käytetään seuraavan sukupolven DNA-sekvensointilaitetta, Illumina MiSeqia, sekä siihen liittyvää tietokoneinfrastruktuuria ja bioinformatiikkaohjelmistoa, jotka tarvitaan sekvenssianalyysiin
|
Opintojen päätyttyä
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Tutkijat
- Päätutkija: Adrian M Zelazny, Ph.D., National Institutes of Health Clinical Center (CC)
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Hyödyllisiä linkkejä
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Arvioitu)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 160001
- 16-CC-0001
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .