Evaluación de MiSeq para la identificación microbiana en muestras
Fondo:
Los investigadores están probando una nueva forma de averiguar qué causa las infecciones en las personas en los hospitales.
Las técnicas actuales utilizan pruebas químicas o biológicas en las muestras de una persona. Las muestras son sangre, tejido, heces, saliva, orina, etc. Los investigadores están probando nuevas técnicas que utilizan un dispositivo llamado MiSeq. Puede secuenciar todo el ADN (material genético) en una muestra. Esto puede mostrar microorganismos, como bacterias, hongos y virus que causan infecciones. Los investigadores quieren saber si la nueva prueba funciona tan bien o mejor que las pruebas actuales. Harán esto mirando alrededor de 250 muestras.
Objetivo:
Para probar si MiSeq funciona igual o mejor que las pruebas actuales para identificar los microorganismos que causan infecciones.
Elegibilidad:
Pacientes de NIH cuyas muestras se enviaron al laboratorio del Servicio de Microbiología para análisis microbiológicos de rutina.
Diseño:
Los participantes darán su consentimiento para que se utilicen en el estudio las muestras que dieron como parte de su atención médica de rutina. Para los menores de 18 años, un padre o tutor legal dará su consentimiento.
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Descripción general del estudio
Estado
Condiciones
Descripción detallada
El propósito de este estudio es evaluar y optimizar las pruebas que utilizan un instrumento de secuenciación de ADN de próxima generación, Illumina MiSeq, junto con la infraestructura informática asociada y el software de bioinformática necesarios para el análisis de secuencias. En última instancia, este sistema está destinado a ser utilizado por el Departamento de Medicina de Laboratorio del Centro Clínico de los NIH para identificar agentes infecciosos en muestras primarias de pacientes. Se espera que las técnicas de secuenciación de próxima generación basadas en la secuenciación del ADN total de muestras primarias tengan muchas ventajas sobre los enfoques microbiológicos clásicos. Estos incluyen la detección de patógenos directamente de muestras primarias que pueden ser difíciles o imposibles de cultivar.
En este estudio, las muestras de pacientes descartadas y el material de autopsia se analizarán con el sistema MiSeq para identificar y clasificar bacterias, virus y otros patógenos. A los efectos de este estudio, el término muestras se referirá a cualquier muestra como hisopos, biopsias de tejido, sangre, heces, saliva, orina, herida, etc. Los investigadores que analizan los resultados de la secuenciación no conocerán los resultados del cultivo microbiológico para un subconjunto de muestras de validación que se analizarán con el sistema MiSeq. Los resultados del análisis de MiSeq se convertirán en un formato que se pueda comparar con los resultados de cultivo oficiales de los Servicios de Microbiología que se almacenan en el sistema de información del laboratorio (software de SCC SOFT Computer [Clearwater, FL, EE. UU.]).
Tipo de estudio
Inscripción (Actual)
Contactos y Ubicaciones
Ubicaciones de estudio
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Maryland
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Bethesda, Maryland, Estados Unidos, 20892
- National Institutes of Health Clinical Center
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Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
Acepta Voluntarios Saludables
Método de muestreo
Población de estudio
Descripción
CRITERIOS DE INCLUSIÓN
- Los especímenes descartados se utilizarán para este estudio.
- Los pacientes de los que se obtienen las muestras deben obtener su consentimiento.
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
- Modelos observacionales: Otro
- Perspectivas temporales: Futuro
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
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Muestra
Muestras de pacientes desechadas y material de autopsia
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¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Evaluar y optimizar las pruebas que utilizan un instrumento de secuenciación de ADN de próxima generación, Illumina MiSeq, junto con la infraestructura informática asociada y el software de bioinformática necesarios para secuenciar el análisis.
Periodo de tiempo: Al finalizar el estudio
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Evaluar y optimizar las pruebas que utilizan un instrumento de secuenciación de ADN de próxima generación, Illumina MiSeq, junto con la infraestructura informática asociada y el software de bioinformática necesarios para secuenciar el análisis.
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Al finalizar el estudio
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Investigadores
- Investigador principal: Adrian M Zelazny, Ph.D., National Institutes of Health Clinical Center (CC)
Publicaciones y enlaces útiles
Enlaces Útiles
Fechas de registro del estudio
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
Finalización primaria (Estimado)
Finalización del estudio (Estimado)
Fechas de registro del estudio
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Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
Publicado por primera vez (Estimado)
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Última actualización publicada (Actual)
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
Última verificación
Más información
Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- 160001
- 16-CC-0001
Plan de datos de participantes individuales (IPD)
¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
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