標本中の微生物同定のための MiSeq の評価

この研究の目的は、シーケンス解析に必要な関連するコンピューター インフラストラクチャおよびバイオインフォマティクス ソフトウェアと共に、次世代 DNA シーケンス装置であるイルミナ MiSeq を使用するテストを評価および最適化することです。 このシステムは、最終的には、NIH 臨床センターの検査医学部門が、一次患者検体中の感染病原体を特定するために使用することを目的としています。 一次標本からの全 DNA の配列決定に基づく次世代の配列決定技術は、従来の微生物学的アプローチよりも多くの利点があると期待されています。 これらには、培養が困難または不可能な一次標本から直接病原体を検出することが含まれます。

この研究では、廃棄された患者サンプルと剖検材料を MiSeq システムでテストして、細菌、ウイルス、およびその他の病原体を特定および分類します。 この研究の目的上、サンプルという用語は、綿棒、組織生検、血液、糞便、唾液、尿、傷などのサンプルを指します。 シーケンス結果を分析する研究者は、MiSeq システムでテストされる標本の検証サブセットの微生物培養結果を知らされません。 MiSeq 解析の結果は、検査室情報システム (SCC SOFT Computer [Clearwater, FL, USA] のソフトウェア) に保存されている Microbiology Services の公式培養結果と比較できる形式に変換されます。