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CRSwNP의 바이러스 및 후생유전학적 영향

후생유전학적 조절은 비용종증을 동반한 만성 2형 만성 비부비동염을 유발합니다: 마커, 병원체 및 메커니즘 식별

배경/근거

여러 장애가 제2형(T2) 염증을 특징으로 하지만 T2의 유발 요인은 아직 알려지지 않았습니다. 비용종증을 동반한 만성 비부비동염(CRSwNP)에서는 고전적인 제2형 장애로 상피 세포 분화의 상실, 상처에 대한 반응 장애, 선천적 방어 기전의 장애로 상피 장벽의 기능 장애가 제시됩니다. 숙주 유전적 또는 환경적 요인에 의해서만 T2 장애를 기술하려는 시도가 실패한 후, 선천적 면역 반응 및 상피 완전성의 수정에서 후생유전학의 역할은 T2 질병의 새로운 이해를 위한 중요한 미개척 메커니즘으로 나타납니다.

또한 연구자들은 이러한 변화가 바이러스성 병원체에 의해 유발될 수 있는 가능성을 탐구합니다. 이 개념은 SARS-CoV-2 바이러스 감소 조치로 인해 호흡기 바이러스의 빈도가 감소하고 그에 따라 만성 기도 질환이 감소하여 T2 질환에서 바이러스의 역할을 암시한다는 최근 관찰 결과에 의해 뒷받침되었습니다.

가설

연구자들은 T2 만성 비부비동염(CRSwNP)이 외부 요인(아마도 바이러스)이 후생유전학적 조작 및/또는 만성 바이러스 감염을 통해 질병에 기여하는 후생유전학적 메커니즘을 포함한다고 믿고 있습니다.

목표

조사관은 T2 CRS와 관련된 후생유전학적 서명을 식별하고 바이러스의 기여를 탐구하는 것을 목표로 합니다. 방법 건강한 피험자를 평가하는 T2 CRS 환자, 차도가 있는 CRS 환자 및 수술을 받는 질병 환자의 후성유전체 관련 연구에 광범위한 적용 범위의 강력한 메틸화 프로파일링이 사용될 것입니다. 또한 고급 transcriptomic 및 metagenomic 방법은 유전자 발현 프로파일과 바이러스를 식별합니다. 이 제안에는 단일 세포 수준에서 전사체 패턴과 후생유전학을 평가하기 위해 수술을 받는 환자에 대한 횡단면 연구도 포함됩니다.

예상되는 결과

연구자들은 후생유전학적 바이오마커를 식별하고 새로운 치료법을 위한 새로운 표적을 열기 위해 여러 병원성 바이러스를 연루시킬 것으로 기대합니다.

연구 개요

상세 설명

연구 배경 및 근거

만성 비부비동염(CRS)은 비용종(NP)의 유무와 관계없이 T2 및/또는 비T2 염증 패턴으로 나타날 수 있습니다. NP 형성과 같은 CRS의 특정 측면은 후성 유전 과정과 관련이 있습니다. 수많은 연구가 다른 T2 질병의 발생 및 만성화에서 후생유전학의 역할을 지원합니다. 천식 및 알레르기성 비염(North, Ann Allergy Asthma Immunol, 2011).

COVID19 대유행 기간 동안 "실제" 경험을 통해 T2 질병 발병에 대한 통찰력을 얻었을 수 있습니다. 2020년에 배치된 바이러스 봉쇄 조치는 가장 일반적인 호흡기 바이러스의 빈도를 예측 가능하게 감소시켜 일반적으로 바이러스성 호흡기 감염에 의해 유발되는 천식 및 COPD의 악화와 함께 침습성 호흡기 감염을 줄였습니다(Linden, Eur Respir Rev, 2019; Mikhail, Ann Allergy Asthma Immunol, 2019). 예기치 않게 상기도의 만성 염증도 감소했습니다. 삼출액과 유선염을 동반한 만성 중이염이 급감했고, 수술 대기자 명단에 있던 어린이의 절반 이상이 자발적인 호전으로 제거됐다. 이것은 비용종증을 동반한 만성 비부비동염(CRSwNP)에 대한 상담 감소에 대한 일화적 관찰을 동반했습니다.

따라서 연구자들은 T2 질환이 염증성 질환 스펙트럼의 고유한 측면을 나타내므로 후생유전학적 메커니즘 또는 만성 감염을 통해 지속적인 효과를 유지하는 바이러스 병원체와의 상호작용에 따라 기능 장애가 발생한다고 제안합니다.

상세한 연구 계획 T2 질병의 병태생리학에 대한 현재의 이해는 병인의 초기 단계를 거의 설명하지 못하게 합니다. 연구자들은 T2 질병이 인터페론(IFN) 신호 구성요소의 손상을 통해 부상이나 병원균에 대한 T1 반응을 감소시켜 반대되지 않는 T2 신호를 유도하는 후성 각인의 결과라고 믿고 있습니다.

또한 연구자들은 이 기능 장애가 바이러스 감염에 의해 생성되며, 이는 잠복 형태로 숙주에 지속될 수 있거나 숙주 게놈의 후생유전적 변형을 통해 그 효과를 계속 발휘할 수 있다고 의심합니다. 결과적으로 연구자들은 바이러스 감염과의 연관성을 입증하는 데 중점을 두고 T2 염증에 존재하는 후생적 조절을 포괄적으로 특성화할 것을 제안합니다. 우리의 목표를 달성하기 위해 연구자들은 DNA 메틸화 상태, 염색질 접근성 및 유전자 발현 프로파일링을 결합하여 T2 질병의 병인에 잠재적으로 중요한 후성유전학적 변화와 유전자를 결정함으로써 T2 질병을 특성화할 것입니다. 조사관은 최신 결과를 전염병 전 물질의 바이오뱅크와 비교하여 고유한 실험 조건으로 전염병 대책으로 부과된 사회적 바이러스 노출의 막대한 변화를 활용할 것입니다. 병인에 대한 새로운 시각을 밝히는 것 외에도 T2 질병의 후생유전학적 및 바이롬 초상화를 정의하면 새로운 진단 및 치료 대상을 개선하고 잠재적으로 관련 바이러스를 식별할 수 있습니다.

연구 전략 조사관은 T2 CRSwNP 환자와 관련된 후생유전학적 패턴과 바이러스를 식별할 것입니다. 조직 및 생검 샘플에서 얻은 기존의 광범위한 세포 바이오뱅크를 활용하여 조사관은 CRS 및 건강한 환자에서 봉쇄 전 및 대유행에 따라 존재하는 후생유전학과 바이러스를 비교할 것입니다. 모집단(다음 섹션에서 자세히 설명)에는 건강한 피험자, 완화 치료 중인 CRS 환자 및 내시경 부비동 수술(ESS)을 받는 질병 환자가 포함됩니다. 연구자들은 잠재적 차이를 분석하기 위해 동일한 수의 생물학적 성별을 평가하는 것을 목표로 합니다. 샘플 크기는 이전 transcriptomics 경험을 기반으로 합니다. 이 관찰 연구는 환자에게 추가 치료를 필요로 하지 않습니다.

실험적 설계

I) 유형 2 및 메틸화:

CRSwNP 생검 샘플의 1차 상피 세포(N=24) 및 내시경 뇌하수체 수술을 받는 환자의 1차 비강 상피 세포(N=16) 원래의 바이러스와 후생유전학적 표시를 보존하기 위해. T2 CRSwNP의 폴립 샘플은 혈액 검사 및 조직학과 함께 임상 표현형에 따라 선택됩니다.

II) 관해 환자 방법: 실험 A, B 및 C는 모두 비강에서 칫솔질 샘플을 분석하기 위해 다음 방법을 사용합니다. (N=36) A) 건강한 상기도 세포에서 바이롬 및 메틸화 프로필 확립. (N=12) B) 치료 중인 건강한 부비동은 어떤 모습입니까(N=12) C) 두필루맙으로 T2 염증을 감소시키는 것이 IFN 활성을 증가시키거나 IFN 경로에서 메틸화를 감소시킴으로써 작용합니까?

III) 수술은 2형에 어떤 영향을 미칩니까? 1차 단면 분석 후 수술 후 4개월의 진화와 비교 인구: CRSwNP에 대한 ESS를 받는 환자, 아스피린 감수성이 있는 피험자의 30% 이상 포함.

1단계: ESS 시점(n=24, 칫솔질 확인을 위한 6) 방법: 환자는 전사골동의 생검을 받게 됩니다. 이들은 Single cell multiomes를 포함한 transcriptomic 도구를 사용하여 평가를 받게 됩니다.

단계 II: ESS 후 4개월(n=동일한 24쌍의 피험자. 동일한 코호트의 환자가 4개월 시점에 평가될 것입니다. 질병의 진화는 CSO HNS 표준에 따라 "최적" "차선" 또는 "허용 불가" 결과로 평가될 것입니다. 브러싱은 샘플링에 사용되며 위와 동일한 분석을 받게 됩니다.

연구 유형

관찰

등록 (예상)

60

연락처 및 위치

이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.

연구 연락처

연구 연락처 백업

연구 장소

참여기준

연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.

자격 기준

공부할 수 있는 나이

  • 성인
  • 고령자

건강한 자원 봉사자를 받아들입니다

샘플링 방법

비확률 샘플

연구 인구

  • 유리한 진화를 보이는 T2 CRSwNP 환자
  • ESS를 받는 T2 CRSwNP 환자
  • 비강 증상이 없고 정상적인 후각이 기록된 건강한 지원자

설명

포함 기준:

  • 유리한 진화를 보이는 T2 CRSwNP 환자
  • ESS를 받는 T2 CRSwNP 환자
  • 비강 증상이 없고 정상적인 후각이 기록된 건강한 지원자

제외 기준:

  • 낭포성 섬유증
  • 원발성 면역결핍

공부 계획

이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.

연구는 어떻게 설계됩니까?

디자인 세부사항

코호트 및 개입

그룹/코호트
개입 / 치료
일차 상피 세포
모집단: 조사관은 원래의 바이러스 및 후생유전학적 표시를 보존하기 위해 가능한 가장 빠른 형식(P0 또는 P1)으로 당사의 바이오뱅크에서 냉동 해리된 세포를 사용할 것입니다. T2 CRSwNP의 폴립 샘플은 혈액 검사 및 조직학과 함께 임상 표현형에 따라 선택됩니다.
CRSwNP 완화 환자
인구: 지속적인 비강내 코르티코스테로이드(INCS) 또는 듀필루맙 하에서 ESS 후 완벽한 부비동 결과.
부비동 수술이 부비동 바이러스에 미치는 영향
모집단: 아스피린 감수성이 있는 피험자의 30% 이상을 포함하여 CRSwNP에 대해 ESS를 진행 중인 환자.
비용종 및 부비동 조직 제거를 위한 내시경 부비동 수술.
건강한 자원봉사자
모집단: UPSIT-40 테스트로 평가했을 때 비강 증상이 없고 정상적인 후각을 보이는 참가자.

연구는 무엇을 측정합니까?

주요 결과 측정

결과 측정
측정값 설명
기간
후생유전학적 바이오마커 및 병원성 바이러스 동정
기간: 12 개월

연구자들은 CRS와 관련된 바이러스 및 후생유전학적 마커를 식별할 것으로 기대합니다.

바이러스는 수집된 조직의 대량 시퀀싱을 사용하여 식별됩니다. 바이러스는 시퀀싱에서 최소 5번의 읽기에서 보이는 경우에만 "존재"하는 것으로 간주됩니다. 이렇게 확인된 바이러스는 주어진 조건에 대한 조직 샘플의 최소 25%에서 보일 때만 평가된 질병 또는 건강 상태와 관련된 것으로 간주됩니다. 질병과의 연관성은 건강한 상태에 비해 질병에 걸린 후보 바이러스의 더 높은 비율로 정의됩니다.

활성 CRSwNP 질병과 관해 중인 질병 사이의 전체 게놈에 걸친 메틸화 프로필을 비교하여 후생유전학적 마커를 식별할 것입니다. 기계 학습 기술은 활동성 질병 또는 확인된 바이러스 병원체의 존재와 관련된 후생유전학적 바이오마커의 추정 시퀀스를 식별하는 데 사용됩니다.

12 개월

공동 작업자 및 조사자

여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.

수사관

  • 수석 연구원: Martin Y. Desrosiers, MD, Centre Hospitalier de l'Universite de Montreal (CHUM)

간행물 및 유용한 링크

연구에 대한 정보 입력을 담당하는 사람이 자발적으로 이러한 간행물을 제공합니다. 이것은 연구와 관련된 모든 것에 관한 것일 수 있습니다.

연구 기록 날짜

이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.

연구 주요 날짜

연구 시작 (실제)

2023년 5월 18일

기본 완료 (예상)

2024년 12월 30일

연구 완료 (예상)

2024년 12월 30일

연구 등록 날짜

최초 제출

2023년 5월 2일

QC 기준을 충족하는 최초 제출

2023년 5월 10일

처음 게시됨 (실제)

2023년 5월 12일

연구 기록 업데이트

마지막 업데이트 게시됨 (실제)

2023년 5월 22일

QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출

2023년 5월 19일

마지막으로 확인됨

2023년 5월 1일

추가 정보

이 연구와 관련된 용어

개별 참가자 데이터(IPD) 계획

개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?

아니요

약물 및 장치 정보, 연구 문서

미국 FDA 규제 의약품 연구

아니

미국 FDA 규제 기기 제품 연구

아니

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만성 비부비동염(진단)에 대한 임상 시험

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